德斯蒙德

Desmond是D.E.开发的一个软件包。Shaw Research对生物系统进行高速分子动力学模拟。该代码使用新型并行算法和数值技术，在包含大量处理器的平台上实现高性能和高精度，但也可以在单个计算机上执行。Desmond包含针对带有NVIDIA GPU的机器进行优化的代码。

Desmond的示例脚本可以在Bridges上的/opt/packages/examples/desmond目录中使用。

文档

• 请参阅Desmond文档，网址为https://www.deshawresearch.com/resources_desmond.html
• 引文：引用Desmond在出版物中的话，请使用这篇论文，该论文在2006年ACM/IEEE超级计算大会（SC06）上获得了“最佳论文奖”。

Kevin J.Bowers、Edmond Chow、Huafeng Xu、Ron O.Dror、Michael P.Eastwood、Brent A.Gregersen、John L.Klepeis、István Kolossváry、Mark A.Moraes、Federico D.Sacerdoti、John K.Salmon、Yibing Shan和David E.Shaw，“商品集群分子动力学模拟的可缩放算法”2006年11月11日至17日在佛罗里达州坦帕市举行的ACM/IEEE超级计算会议（SC06）会议记录文本

用法

要查看可用的Desmond版本，请键入

模块availdesmond

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模块帮助desmond

要使用Desmond，请在批处理脚本或交互式会话中包含如下命令加载desmond模块:

模块负载desmond

确保还加载了所需的任何其他模块，如模块帮助desmond命令。