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PubMed出版物摘要
人类RNA解旋酶II/Galpha(RH-II/Gualpha)和RNA解旋酶II/Gubeta(RH-II/Gubeta-)是具有相同结构域的副logue,由DEAD盒解旋酶域(DEAD)、解旋酶保守的C末端结构域(helicase_C)和GUCT结构域组成。RH-II/Gu蛋白的N-末端区域,包括DEAD结构域和解旋酶_C结构域,解开双链RNA。遵循GUCT结构域的RH-II/Gualpha的C端尾部折叠单个RNA链,而RH-II/Gubeta的C端尾巴则不折叠,并且GUCT域对RNA解旋酶或折叠酶活性都不是必需的。因此,对GUCT域知之甚少。在本研究中,我们已经确定了RH-II/Guβ-GUCT结构域的溶液结构。使用基于NOE的距离约束和基于剩余偶极耦合的角度约束进行的结构计算,在K585-A659的区域内产生了一个定义明确的结构,具有β-α-α-β-β-α-beta-α-beta拓扑,而Pfam HMM算法将GUCT域定义为G571-E666。这种基于结构的域边界在使用HMM定义的序列同源搜索中显示假阳性。结构同源性搜索显示,GUCT结构域具有RRM折叠,这通常在RNA相互作用蛋白中发现。然而,它在β-表上缺少表面暴露的芳香残基和基本残基,这些残基对RNA在典型RRM域中的识别很重要。此外,GUCT结构域的整体表面呈酸性,因此GUCT不太可能与RNA分子相互作用。相反,它可能通过表面暴露色氨酸周围的疏水表面与蛋白质相互作用。蛋白质2009。(c) 2008年威利莱斯公司。
来自人类RNA解旋酶II/Gubeta的GUCT结构域的溶液结构揭示了RRM折叠,但RNA相互作用令人难以置信。,Ohnishi S、Paakkonen K、Koshiba S、Tochio N、Sato M、Kobayashi N、Harada T、Watanabe S、Muto Y、Guntert P、Tanaka A、Kigawa T、Yokoyama S蛋白质类。2008年7月9日;74(1):133-144. PMID:18615715[1]
来自美国国家医学图书馆数据库MEDLINE®/PubMed®。
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- ↑Ohnishi S、Paakkonen K、Koshiba S、Tochio N、Sato M、Kobayashi N、Harada T、Watanabe S、Muto Y、Guntert P、Tanaka A、Kigawa T、Yokoyama S。来自人类RNA解旋酶II/Gubeta的GUCT域的溶液结构揭示了RRM折叠,但RNA相互作用难以置信。蛋白质。2008年7月9日;74(1):133-144. PMID:18615715数字对象标识:10.1002/防护22138