结构亮点
功能
C1F2K5_ACIC5型
PubMed出版物摘要
我们提出了荚膜酸杆菌糖苷水解酶家族79β-葡糖醛酸酶的第一个结构,它既是β-D-葡糖醛酸(GlcA)的产物复合物,也是其捕获的共价2-氟葡糖醛酸中间体。这种酶由一个催化(β/α)(8)-桶结构域和一个具有未知功能的不规则希腊基序的β-结构域组成。该酶具有β-葡萄糖醛酸酶活性和微量的β-葡萄糖苷酶和β-木糖苷酶活性。结合诱变研究,这些结构确定催化残基为Glu(173)(酸碱)和Glu(287)(亲核),与(1)H NMR分析证明的保留机制一致。Glu(45)、Tyr(243)、Ty(292)-Gly(294)和Tyr。与此一致,Y292A突变影响Gln(293)和Gly(294)主链与GlcA羧基之间的相互作用,导致β-葡萄糖醛酸酶活性显著丧失,同时保持野生型水平的副活性。同样,尽管Y334F突变体的β-葡萄糖醛酸酶活性比野生型酶低约200倍(k(cat)/k(m)),但β-葡萄糖苷酶活性实际上是野生型酶的3倍,β-木糖苷酶的活性仅比野生型的等效参数低2.5倍,这与Tyr的作用一致(334)以识别GlcA的C6位置。Glu(45)参与识别GlcA C4位置处O-甲基的结合,这一事实表明,E45D突变体水解PNP-β-GlcA的速度比野生型酶慢约300倍(k(cat)/k(m)),而含4-O-甲基-GlcA寡糖的水解速度仅慢7倍。
荚膜酸杆菌糖苷水解酶家族79β-葡萄糖醛酸酶的结构和生化特性。,Michikawa M、Ichinose H、Momma M、Biely P、Jongkees S、Yoshida M、Kotake T、Tsumuraya Y、Withers SG、Fujimoto Z、Kaneko S J生物化学。2012年4月20日;287(17):14069-77. Epub 2012年2月24日。项目管理标识号:22367201[1]
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- ↑Michikawa M、Ichinose H、Momma M、Biely P、Jongkees S、Yoshida M、Kotake T、Tsumuraya Y、Withers SG、Fujimoto Z、Kaneko S。荚膜酸杆菌糖苷水解酶家族79β-葡萄糖醛酸酶的结构和生化特征。生物化学杂志。2012年4月20日;287(17):14069-77. Epub 2012年2月24日。PMID:22367201数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M112.346288