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PubMed出版物摘要

在染色质的不同区域选择性地发现了特定组蛋白赖氨酸残基的单、二和三甲基化状态，从而暗示了这些标记的特殊生物功能，从异染色质的形成到X染色体的失活和转录调控。染色质生物学的一个主要挑战集中在定义特定甲基化状态和影响功能的不同生物读出之间的联系。例如，在赖氨酸4（H3K4me3）处三甲基化的组蛋白H3与活性基因的转录起始位点相关，但与H3K4me3尾部特异性识别相关的分子“效应器”仍知之甚少。在这里，我们证明了人类BPTF（溴代多巴胺和PHD域转录因子）的植物同源域（PHD）指对H3（1-15）K4me3（组蛋白H3在K4处三甲基化的残基1-15）进行特异性识别的分子基础，BPTF是ATP依赖性染色质重塑复合体NURF（核小体重塑因子）的最大亚单位。我们报道了BPTF在游离态和H3（1-15）K4me3结合态下溴代多巴胺-最大PHD指的晶体结构和核磁共振结构。H3（1-15）K4me3通过PHD手指表面上的反平行β-片形成相互作用，精氨酸2（R2）和K4me3的长侧链紧贴在相邻的预先形成的表面口袋中，包围着不变的色氨酸。观察到的非相邻R2和K4me3的缝合作用为H3K4me3位点特异性提供了分子解释。结合研究表明，BPTF PHD指对K4me3-表现出适度的偏好，而非含有K4me2-的H3肽，并区分了单甲基化和未修饰的对应物。此外，我们从H3（1-15）K4me3与PHD指点突变体的结合研究中确定了关键特异性决定残基。我们的发现引起了人们对PHD指的关注，PHD指是一种以前在大量染色质相关蛋白中发现的未经特征化的染色质结合模块。

NURF的BPTF PHD指定点读出组蛋白H3K4me3的分子基础。，Li H、Ilin S、Wang W、Duncan EM、Wysocka J、Allis CD、Patel DJ Nature。2006年7月6日；442(7098):91-5. Epub 2006年5月21日。PMID:16728978^[1]

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