结构亮点
功能
RPAB3_胡曼依赖于DNA的RNA聚合酶利用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的常见成分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA,以及小RNA,如5S rRNA和tRNA。[1]
进化保护
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PubMed出版物摘要
RPB8亚基存在于所有三种真核RNA聚合酶中,在进化过程中高度保守。它是核基因转录所需的基本亚单位,但其与不同亚单位和寡核苷酸的相互作用的详细机制仍不清楚。在此,我们报道了通过NMR光谱测定的高分辨率人RPB8(hRPB8)的三维结构。蛋白质折叠包括一个八标记的β-桶、六个短螺旋和一个大的非结构化欧米茄。hRPB8的整体结构与酿酒酵母的yRPB8相似,属于寡核苷酸/寡糖结合折叠。然而,这两种蛋白质的三级结构的几个特征明显不同。特别是,hRPB8与RNA聚合酶的最大亚单位RPB1有一个更聚集的带正电荷的结合界面。我们采用生物化学方法来检测其与不同单链DNA序列的相互作用。此外,还进行了单链DNA滴定实验,以确定与不同DNA序列非特异性结合的残基。此外,我们表征了hRPB8与单链DNA结合时的毫秒级构象灵活性。目前的结果表明,hRPB8与单链DNA发生了非特异性的相互作用,并发生了显著的构象变化,而hRPB8/单链DNA复合物是一个快速交换系统。溶液结构结合生物化学和动力学研究揭示了该亚基在分子组装和人类核RNA聚合酶生物功能中的新方面。
人类RNA聚合酶hRPB8亚单位的结构、生化和动力学特征。,Kang X,Hu Y,Li Y,Guo X,Jiang X,Lai L,Xia B,Jin C生物化学杂志。2006年6月30日;281(26):18216-26. Epub 2006年4月21日。PMID:16632472[2]
来自美国国家医学图书馆数据库MEDLINE®/PubMed®。
另请参见
工具书类
- ↑Kershnar E,Wu SY,Chiang CM。从有条件表达多蛋白复合物表位标记亚单位的克隆细胞系中纯化人转录因子IIH和RNA聚合酶II的免疫亲和性和功能特性。生物化学杂志。1998年12月18日;273(51):34444-53. PMID:9852112
- ↑Kang X,Hu Y,Li Y,Guo X,Jiang X,Lai L,Xia B,Jin C.人类RNA聚合酶hRPB8亚基的结构、生化和动力学特征。生物化学杂志。2006年6月30日;281(26):18216-26. Epub 2006年4月21日。PMID:16632472数字对象标识:http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M513241200