优柔美是一个可以轻松观看、移动、旋转、学习和欣赏生物分子3D结构的网站。请参见Yorodumi文件了解更多详细信息。
网址：https://pdbj.org/yorodumi/
灰分是一个执行三维结构对齐的程序。在ASH主页上，您可以通过web运行该程序或免费下载该软件。
网址：https://pdbj.org/ash网址/
马夫塔什是一个从序列和结构计算多序列比对的工具。
网址：http://pdbj.org/mafftash网站/
CRNPRED公司是一项基于网络的服务，它可以根据氨基酸序列预测一维蛋白质结构，包括二级结构、接触数和残余接触顺序。
网址：http://pdbj.org/crnpred/
扳手是一个结构同源性建模程序，也就是说，它将特定的氨基酸序列连接到特定的PDB结构上，尽可能地填补空白。
网址：http://pdbj.org/扳手/
SFAS公司（Sequence to Function Annotation Server）是一种基于web的工具，用于预测氨基酸序列的结构。SFAS运行多个外部程序进行序列比对和结构建模，并组织其结果。SFAS不进行任何复杂的计算。目前有多个对齐选项和一个结构建模选项。未来，选择的数量将增加。
网址：http://pdbj.org/sfas/
gmfit公司是一个使用高斯混合模型快速拟合三维对象的程序。两个EMDB密度图或PDB结构之间的拟合服务通过WEB提供。
网址：http://pdbj.org/gmfit/
HOMCOS公司是一种服务，用于从序列或化学结构中搜索PDB中的3D复杂结构，并基于找到的模板结构建模3D复杂结构。
网址：http://homcos.pdbj.org/？LANG=en
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2024-06-26年的PDB条目
