条目-*142620-ABHYDROLASE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 16A,磷脂酶;ABHD16A型-OMIM公司
 
*142620

含ABHYDROLASE结构域蛋白16A,磷脂酶;ABHD16A型


备选标题;符号

HLA-B相关转录因子5;电池5
D6S82E型


HGNC批准的基因符号:ABHD16A型

细胞遗传学位置:第61.33页   基因组坐标(GRCh38):6:31,686,955-31,703,324 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第61.33页 痉挛性截瘫86例,常染色体隐性遗传 619735 应收账

文本

描述

ABHD16A基因是α/β水解酶结构域蛋白家族的成员,参与脂质代谢和细胞内信号传导。ABHD16A酶是主要的脑磷脂酰丝氨酸(PS)水解酶(总结如下Yahia等人,2021年).


克隆和表达

利用连锁数据和cosmid克隆鉴定HLA-B着丝粒区域的基因(142830)在JY人B淋巴细胞母细胞的主要组织相容性复合体中,Spies等人(1989)确定的GPANK1(142610)和ABHD16A,他们分别称之为BAT4和BAT5。Northern印迹分析在所检测的所有5种人细胞系中检测到2.0kb的弱BAT5表达。

Yahia等人(2021年)注意到ABHD16A基因编码2个转录物,分别含有558和525个氨基酸。较长的在大脑、肌肉、睾丸和心脏中高度表达,而较短的主要在睾丸中表达,在大脑中表达最少。Abhd16a在小鼠大脑中有异质性表达,在小脑中富集。它是一种完整的内质网蛋白,具有胞浆导向的活性位点。


基因结构

Yahia等人(2021年)表明ABHD16A基因包含21个外显子。


映射

利用连锁数据和cosmid克隆,Spies等人(1989)定位TNF附近的BAT4和BAT5基因(191160)-TNFB(陆路交通管理局;153440)染色体6p21.3上的基因簇。


基因功能

在内质网中,ABHD16A与ABHD12共定位(613599),主要的脑溶血磷脂酰丝氨酸(lyso-PS)水解酶。这两种酶是负责大脑赖氨酸-PS代谢的主要酶:ABHD16A从PS底物中产生赖氨酸-PS,ABHD12将其分解代谢为脂肪酸和磷酸丝氨酸(总结如下Yahia等人,2021年).

ABHD16A是大脑中主要的磷脂酰丝氨酸,它将PS转化为溶血磷脂,溶血磷脂是一种富含中枢神经系统和免疫细胞的信号脂质,在中枢神经系统及免疫细胞中,它被假定调节许多过程(由Lemire等人,2021年).


分子遗传学

来自2个无血缘关系的苏丹家族的4名常染色体隐性痉挛性截瘫患者(SPG86;619735),Yahia等人(2021年)在ABHD16A基因中鉴定出纯合性功能丧失突变(142620.0001142620.0002)。这些突变是通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的,与该家族中的疾病分离。患者成纤维细胞显示ABHD16A缺乏表达。与对照组相比,PS底物水平升高,溶酶体-PS水平降低,表明变异导致ABHD16A酶功能丧失。Yahia等人(2021年)假设参与细胞信号和神经元生长的低水平lyso-PS可能导致大脑神经功能障碍。致病机制也可能与PS代谢改变有关。

来自6个不相关家族的11名SPG86患者,Lemire等人(2021年)确定ABHD16A基因中的纯合或复合杂合突变(参见,例如。,142620.0003-142620.0005)。通过外显子组测序发现突变;这些家庭是通过合作确定的。突变与所有家族中的疾病分离。共有4个错义、1个无义和1个移码突变,位于整个基因中。与对照组相比,患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示几乎没有ABHD16A蛋白。与对照组相比,这些细胞表现出广泛的增殖。患者成纤维细胞和血浆的脂质组学研究显示PS水平升高,但与对照组相比,溶酶体-PS水平没有明显变化。然而,观察到其他脂质变化。作者注意到,神经元细胞中的脂质变化可能不同,但尚未进行研究。这些发现证明了脂质代谢和体内平衡在维持神经系统中的关键作用。

在两个同胞中,他们的父母没有血缘关系,患有常染色体隐性遗传SPG86,Miyake等人(2022)在ABHD16A基因中发现了纯合无义突变(142620.0006)。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。它不在gnomAD数据库中。未对变异体和患者细胞进行功能研究,但预计会导致功能丧失。作者指出,该基因在各种人体组织中表达,可以解释复杂的表型。


ALLELIC变体( 6精选示例):

.0001 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体收缩

ABHD16A,ARG114TER公司
   RCV001568340。。。

2名兄弟出生于苏丹近亲父母(F37家族),患有常染色体隐性遗传痉挛性截瘫-86(SPG86;619735),Yahia等人(2021年)在ABHD16A基因中鉴定出纯合c.340C-T转换(c.340C-T,NM_021160.2),导致arg114-ter(R114X)替换。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。gnomAD数据库中不存在变体。患者成纤维细胞显示ABHD16A蛋白缺失,酶活性降低,与功能丧失一致。


.0002 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体移植

2名同胞为苏丹近亲(F69家族),患有常染色体隐性遗传痉挛性截瘫-86(SPG86;619735),Yahia等人(2021年)在ABHD16A基因中鉴定出纯合c.1370G-a转换(c.1370G-a,NM_021160.2),导致arg457-to-gln(R457Q)替换。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。该变体曾在gnomAD数据库中以杂合状态出现过一次(4 x 10(-6))。在硅片分析中,该变体可能改变剪接。患者成纤维细胞显示ABHD16A蛋白缺失,酶活性降低,与功能丧失一致。


.0003 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体收缩

来自2个无血缘关系的法裔加拿大家族(家族1和2)的4名常染色体隐性痉挛性截瘫患者(SPG86;619735),Lemire等人(2021年)在ABHD16A基因中鉴定出纯合c.353G-a转换(c.353G/a,NM_021160.2),导致在高度保守的残基处发生arg118-to-his(R118H)替换。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。在gnomAD数据库中发现了两次(频率为0.0008)。单倍型分析表明存在创始人效应。患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示几乎没有ABHD16A蛋白,与功能丧失一致。


.0004 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体移植

ABHD16A,LEU409ARG公司
   RCV001720321。。。

在2个同胞中,出生于有血缘关系的亚美尼亚父母(家庭3),患有常染色体隐性痉挛性截瘫-86(SPG86;619735),Lemire等人(2021年)在ABHD16A基因中鉴定出纯合c.1226T-G颠倒(c.1226T-G,NM_021160.2),导致在高度保守的残基处发生leu409-to-arg(L409R)替换。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。它不在gnomAD数据库中。未进行变体的功能研究和患者细胞的研究。


.0005 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体移植

埃及近亲父母(家族5)所生的2个姐妹患有常染色体隐性遗传痉挛性截瘫-86(SPG86;619735),Lemire等人(2021年)在ABHD16A基因中鉴定出纯合c.362A-T颠倒(c.362A-T,NM_021160.2),导致asn121-to-ile(N121I)替代。通过外显子组测序发现的突变与该家族中的疾病分离。它不存在于gnomAD数据库中。患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示几乎没有ABHD16A蛋白,与功能丧失一致。


.0006 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体收缩

ABHD16A,GLN279TER公司
   RCV001834545型

在2个同胞中,出生于无亲属关系的智利父母,患有常染色体隐性痉挛性截瘫-86(SPG86;619735),Miyake等人(2022年)在ABHD16A基因第9外显子中鉴定出纯合c.835C-T转换(c.835C-T,NM_021160),导致gln279-ter(Q279X)替换。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。它不在gnomAD数据库中。未对变异体和患者细胞进行功能研究,但预计会导致功能丧失。作者指出,该基因在各种人体组织中表达,这可以解释复杂的表型。


参考文献

  1. Lemire,G.,Ito,Y.A.,Marshall,A.E.,Chrestian,N.,Stanley,V.,Brady,L.,Tarnopolsky,M.,Curry,C.J.,Hartley,T.,Mears,W.,Derksen,A.,Rioux,N.和其他12人。ABHD16A缺乏导致一种复杂的遗传性痉挛性截瘫,与智力残疾和大脑异常相关。Am.J.Hum.遗传学。108: 2017-2023, 2021.[公共医学:34587489,相关引文][全文]

  2. Miyake,N.、Silva,S.、Troncoso,M.、Okamoto,N.,Andachi,Y.、Kato,M.和Iwabuchi,C.、Hirose,M.,Fujita,A.、Uchiyama,Y.和Matsumoto,N。纯合子ABHD16A变异体可导致复杂的遗传性痉挛性截瘫,伴有发育迟缓、言语缺失和面部特征。临床。遗传学。101: 359-363, 2022.[公共医学:34866177,相关引文][全文]

  3. Spies,T.、Blank,G.、Bresnahan,M.、Sands,J.、Strominger,J.L。人类主要组织相容性复合体中的一组新基因。《科学》243:214-2172989年。[公共医学:2911734,相关引文][全文]

  4. Yahia,A.、Elsayed,L.E.O.、Valter,R.、Hamed,A.A.A.、Mohammed,I.N.、Elsed,M.A.、Salih,M.A、Esteves,T.、Auger,N.、Abubaker,R.,Koko,M.、Abozar,F.和其他17人。ABHD16A的致病性变体导致一种新型精神运动发育障碍伴痉挛性截瘫。前面。神经醇。12: 720201, 2021.[公共医学:34489854,图像,相关引文][全文]


Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年1月2日
Patricia A.Hartz-更新时间:2014年3月25日
创建日期:
维克托·麦库西克:1989年2月2日
阿洛佩兹:2022年9月2日
ckniffin:2022年1月2日
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卡罗尔:2001年7月18日
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日期:1989年10月27日
根:1989年2月2日

*142620

含ABHYDROLASE结构域蛋白16A,磷脂酶;ABHD16A型


备选标题;符号

HLA-B相关转录因子5;电池5
D6S82E型


HGNC批准的基因符号:ABHD16A

细胞遗传学位置:6p21.33   基因组坐标(GRCh38):6:31686955-31703324 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第61.33页 痉挛性截瘫86例,常染色体隐性遗传 619735 常染色体隐性

文本

描述

ABHD16A基因是α/β水解酶结构域蛋白家族的成员,参与脂质代谢和细胞内信号传导。ABHD16A酶是主要的脑磷脂酰丝氨酸(PS)水解酶(由Yahia等人总结,2021年)。


克隆和表达

Spies等人(1989)利用连锁数据和共粒克隆来鉴定JY人类B淋巴细胞母细胞主要组织相容性复合体中HLA-B(142830)着丝粒区域的基因,分别鉴定出GPANK1(142610)和ABHD16A,他们称之为BAT4和BAT5。Northern blot分析检测到所有5个被检测的人类细胞系中BAT5在2.0 kb处弱表达。

Yahia等人(2021年)指出,ABHD16A基因编码2个转录物,分别含有558和525个氨基酸。较长的在大脑、肌肉、睾丸和心脏中高度表达,而较短的主要在睾丸中表达,在大脑中表达最少。Abhd16a在小鼠大脑中有异质性表达,在小脑中富集。它是一种完整的内质网蛋白,具有胞浆导向的活性位点。


基因结构

Yahia等人(2021年)指出,ABHD16A基因包含21个外显子。


映射

Spies等人(1989)利用连锁数据和共粒克隆,将BAT4和BAT5基因定位在染色体6p21.3上TNF(191160)-TNFB(LTA;153440)基因簇附近。


基因功能

在内质网中,ABHD16A与ABHD12(613599)共定位,ABHD12是主要的脑溶血磷脂酰丝氨酸(lyso-PS)水解酶。这两种酶是负责大脑溶血磷脂代谢的主要酶:ABHD16A从PS底物生成溶血磷脂,ABHD12将其分解为脂肪酸和磷酸丝氨酸(Yahia等人,2021年总结)。

ABHD16A是大脑中主要的磷脂酰丝氨酸,可将PS转化为溶血磷脂,溶血磷脂是中枢神经系统和免疫细胞中丰富的一种信号脂质,在中枢神经系统及免疫细胞中被假定调节许多过程(Lemire等人,2021年总结)。


分子遗传学

Yahia等人(2021)在来自2个无亲缘关系的苏丹常染色体隐性痉挛性截瘫家族的4名患者中发现了ABHD16A基因的纯合功能缺失突变(142620.0001和142620.0002)。这些突变是通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的,与该家族中的疾病分离。患者成纤维细胞显示ABHD16A缺乏表达。与对照组相比,PS底物水平升高,溶酶体-PS水平降低,表明变异导致ABHD16A酶功能丧失。Yahia等人(2021年)假设,参与细胞信号和神经元生长的低水平lyso-PS可能导致大脑神经功能障碍。致病机制也可能与PS代谢改变有关。

Lemire等人(2021年)在来自6个SPG86无关家族的11名患者中,确定了ABHD16A基因的纯合或复合杂合突变(参见例如142620.0003-14262.0005)。突变是通过外显子组测序发现的;这些家庭是通过合作确定的。突变与所有家族中的疾病分离。有4个错义、1个无义和1个移码突变位于整个基因中。与对照组相比,患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示几乎没有ABHD16A蛋白。与对照组相比,这些细胞表现出广泛的增殖。患者成纤维细胞和血浆的脂质组学研究显示PS水平升高,但与对照组相比,溶酶体-PS水平没有明显变化。然而,观察到其他脂质变化。作者注意到,神经元细胞中的脂质变化可能不同,但尚未进行研究。这些发现证明了脂质代谢和体内平衡在维持神经系统中的关键作用。

Miyake等人(2022年)在两个同胞中发现了ABHD16A基因的纯合无义突变(142620.0006),这两个同胞均为非亲缘智利父母所生,患有常染色体隐性SPG86。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。它不在gnomAD数据库中。未对变异体和患者细胞进行功能研究,但预计会导致功能丧失。作者指出,该基因在各种人体组织中表达,可以解释复杂的表型。


ALLELIC变体 6个精选示例):

.0001 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体收缩

ABHD16A,ARG114TER公司
单号:rs2151256799,临床变量:RCV001568340、RCV001826350

Yahia等人(2021年)在2名兄弟中发现ABHD16A基因中存在纯合c.340C-T转换(c.340C-T,NM_021160.2),导致arg114-ter(R114X)替代,这2名兄弟出生于苏丹近亲父母(F37家族),患有常染色体隐性遗传痉挛性截瘫-86(SPG86;619735)。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。gnomAD数据库中不存在变体。患者成纤维细胞显示ABHD16A蛋白缺失,酶活性降低,与功能丧失一致。


.0002 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体移植

ABHD16A,ARG457GLN({dbSNP rs774259910})
SNP:rs774259910,gnomAD:rs774259910,临床变量:RCV001568339、RCV001826349

Yahia等人(2021年)在2个同胞中发现ABHD16A基因中存在纯合c.1370G-a过渡(c.1370G-a,NM_021160.2),导致arg457-to-gln(R457Q)替代,这2个同胞出生于苏丹近亲父母(F69家族),患有常染色体隐性痉挛性截瘫-86(SPG86;619735)。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。该变体曾在gnomAD数据库中以杂合状态出现过一次(4 x 10(-6))。在硅片分析中,该变体可能改变剪接。患者成纤维细胞显示ABHD16A蛋白缺失,酶活性降低,与功能丧失一致。


.0003 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体收缩

ABHD16A,ARG118HIS公司
SNP:rs149790845,gnomAD:rs149790845,临床变量:RCV001720320,RCV001827481

Lemire等人(2021)在来自两个不相关的法裔加拿大家庭(家庭1和2)的4名常染色体隐性痉挛性截瘫患者中发现了ABHD16A基因中的纯合c.353G-a转换(c.353G-a,NM_021160.2),导致在高度保守的残基处arg118到his(R118H)的取代。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。在gnomAD数据库中发现了两次(频率为0.0008)。单倍型分析表明存在创始人效应。患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示几乎没有ABHD16A蛋白,与功能丧失一致。


.0004 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体移植

ABHD16A,LEU409ARG公司
SNP:rs2151222951,临床变量:RCV001720321、RCV001827482

Lemire等人(2021年)在2个同胞中发现ABHD16A基因中的纯合c.1226T-G颠换(c.1226T-G,NM_021160.2),这2个同胞出生于亚美尼亚近亲父母(家族3),患有常染色体隐性遗传痉挛性截瘫-86(SPG86;619735),导致在高度保守的残基上出现leu409-arg(L409R)取代。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。它不在gnomAD数据库中。未进行变体的功能研究和患者细胞的研究。


.0005 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体移植

ABHD16A,ASN121ILE
单号:rs1804466196,临床变量:RCV001720324,RCV001827483

Lemire等人(2021年)在两个姐妹中发现ABHD16A基因中的纯合c.362A-T颠倒(c.362A-T,NM_021160.2),这两个姐妹均为埃及近亲父母(家族5),患有常染色体隐性遗传痉挛性截瘫-86(SPG86;619735),导致asn121-to-ile(N121I)替代。通过外显子组测序发现的突变与该家族中的疾病分离。它不在gnomAD数据库中。患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示几乎没有ABHD16A蛋白,与功能丧失一致。


.0006 SPASTIC PARAPLEGIA 86,自体收缩

ABHD16A,GLN279TER公司
SNP:rs2151231096,临床变量:RCV001834545

Miyake等人(2022年)在2名同胞中发现ABHD16A基因第9外显子存在纯合c.835C-T转换(c.835C-T,NM_021160),这2名同胞均为非亲缘智利父母所生,患有常染色体隐性痉挛性截瘫-86(SPG86;619735),导致gln279-ter(Q279X)替代。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。它不在gnomAD数据库中。未对变异体和患者细胞进行功能研究,但预计会导致功能丧失。作者指出,该基因在各种人体组织中表达,这可以解释复杂的表型。


参考文献

  1. Lemire,G.、Ito,Y.A.、Marshall,A.E.、Christian,N.、Stanley,V.、Brady,L.、Tarnopolsky,M.、Curry,C.J.、Hartley,T.、Mears,W.、Derksen,A.、Rioux,N.和其他12人。ABHD16A缺乏导致一种复杂的遗传性痉挛性截瘫,与智力残疾和大脑异常相关。Am.J.Hum.遗传学。108: 2017-2023, 2021.[公共医学:34587489][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2021.09.005]

  2. Miyake,N.、Silva,S.、Troncoso,M.、Okamoto,N.,Andachi,Y.、Kato,M.和Iwabuchi,C.、Hirose,M.,Fujita,A.、Uchiyama,Y.和Matsumoto,N。纯合子ABHD16A变异体可导致复杂的遗传性痉挛性截瘫,伴有发育迟缓、言语缺失和面部特征。临床。遗传学。101:359至3632022年。[PubMed:34866177][全文:https://doi.org/10.1111/cge.14097]

  3. Spies,T.、Blank,G.、Bresnahan,M.、Sands,J.、Strominger,J.L。人类主要组织相容性复合体中的一组新基因。《科学》243:214-2172989年。[公共医学:2911734][全文:https://doi.org/10.1126/science.2911734]

  4. Yahia,A.、Elsayed,L.E.O.、Valter,R.、Hamed,A.A.A.、Mohammed,I.N.、Elsed,M.A.、Salih,M.A、Esteves,T.、Auger,N.、Abubaker,R.,Koko,M.、Abozar,F.和其他17人。ABHD16A的致病性变体导致一种新型精神运动发育障碍伴痉挛性截瘫。前面。神经醇。12: 720201, 2021.[公共医学:34489854][全文:https://doi.org/10.3389/fneur.2021.720201]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新日期:2022年1月2日
Patricia A.Hartz-更新时间:2014年3月25日

创建日期:
维克托·麦库西克:1989年2月2日

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阿洛佩兹:2022年9月2日
ckniffin:2022年1月2日
mgross:2020年8月5日
mgross:2014年3月25日
迈克尔顿:2014年3月25日
阿洛佩兹:2011年8月15日
卡罗尔:2001年7月18日
特里:2000年2月28日
卡罗尔:1999年2月22日
阿洛佩兹:1997年9月5日
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超级模特:1992年3月16日
超级模特:1990年3月20日
卡罗尔:1990年9月3日
日期:1989年10月27日
根:1989年2月2日