Implications of AlphaFold2 for crystallographic phasing by molecular replacement

Airlie J. McCoy; Massimo D. Sammito; Randy J. Read

doi:10.1107/S2059798321012122

PMC全文：

晶体学报D结构生物学。2022年1月1日；78（第1部分）：1-13。

2022年1月1日在线发布。数字对象标识：10.1107/S2059798321012122

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表3

CASP14中34种感兴趣晶体结构的相位调整总结AlphaFold公司2种型号

文中讨论了粗体列出的晶体和目标。

水晶	目标	PDB代码	d日 _最小值(Å)	反射次数	Z轴 ^†	域	过滤器^‡	TFZ公司^§	R（右） _自由的	R（右） _自由的变形后
1	T1024型	6t1z	2.9	12686	1	1	不	24.7	0.52	0.42
2 ^¶	T1030型	6便便	3	7525	1	2	不	20.4	0.53
三 ^¶	T1031型	6伏4	3.5	92907	2
	T1033型
	T1035年
	T1037型
	T1039型
	时间1040
	T1041型
	T1042型
	T1043型
4	T1032型	6n64号	3.3	27936	6	1	0.7	16.1	0.47	0.44
5	T1034型	6毫米	2.1	47702	4	1	不	31.9	0.45
6	T1038型	6年2月	2.5	20426	三	1	不	24.3	0.35
7	T1046s1型	6像素4	1.7	69112	2	2	不	31.8	0.35
7	T1046s2型	6像素4	1.7	69112	2	2	不	31.8	0.35
8 ^††	T1048型	6月9日	2.8	19203	4
9	T1049型	6年4月	1.8	12228	1	1	不	23.7	0.34
10	T1050型		2.7	97731	三	1	不	39	0.30
11	时间1052		2	88914	2	1	不	48.6	0.43
12	T1053型	7月7日	3.2	49627	4	1	不	51	0.35
13	T1054型	6伏4伏	1.7	25547	1	1	不	33.2	0.34
14	T1056型	6yj1年	2.3	17863	2	1	不	19.7	0.37
15	T1058型	7磅	3.1	20228	2	1	不	25.5	0.44
16	T1064型	7jtl型	2	16787	2	1	不	19.1	0.41
17	T1065s1型	7米5英尺	1.6	35695	1	2	不	48.7	0.22
17	T1065s2型	7米5英尺	1.6	35695	1	2	不	48.7	0.22
18	T1067型		1.4	51025	1	1	不	57.2	0.26
19	T1070型		2.5	25412	1	1	不	6.8	0.49	0.42
20	T1073型		1.9	27326	4	1	1	24.1	0.39
21	T1074型	7立方厘米9	1.5	25800	1	1	不	21.1	0.29
22	T1079型		3.2	47985	4	1	不	33.6	0.38
23	T1080型		1.7	100570	6	1	不	20.9	0.39
24	T1082型	6x6像素	1.1	97672	2	1	不	33.6	0.44	0.31
25	T1083型		1.3	81236	4	1	0.6	30	0.48	0.35
26	T1084型		1.9	23901	三	1	不	32.1	0.38
27	T1085型		2.5	10758	1	三	不	22	0.40
28	T1086型		2.3	21887	1	1	不	18.7	0.41
29	T1087型		1.4	69617	4	1	不	43.2	0.25
30	T1089型		2.2	55192	2	1	不	63.5	0.29
31	T1090型	7千瓦	1.8	22947	1	1	不	27.2	0.29
32	T1091型		2.2	62789	1	4	不	22.5	0.44
33	T1100型		3.1	36829	4	1	不	31.1	0.48	0.45
34	T1101型		1.4	58030	1	1	不	16.2	0.34

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^†非对称单元中的副本数。

^‡从模型中删减残留物的预测RMSD阈值。

^§翻译-功能Z轴-分数，衡量MR解决方案的重要性。

^¶部分解决方案。

^††没有解决方案。