亚太癌症预防杂志。2020年5月;21(5): 1221–1226.
协会EGLN2 rs10680577前列腺癌患者危险性和临床病理特征的多态性
,1 ,1 ,2,* ,三和1,4
纳希德·拉希米
1
伊朗扎赫丹扎赫丹医科大学医学院临床生物化学系。
马赫萨·阿齐兹
1
伊朗扎赫丹扎赫丹医科大学医学院临床生物化学系。
古拉姆雷扎·巴哈里
2
伊朗扎赫丹扎赫丹医科大学儿童和青少年健康研究中心。
贝扎德·纳鲁伊
三
伊朗德黑兰Shahid Beheshti医科大学Shahid Labbafinejad医学中心泌尿系泌尿和肾脏研究中心。
穆罕默德·哈希米
1
伊朗扎黑丹医学科学大学医学院临床生物化学系。
4
伊朗扎赫丹扎赫丹医科大学非传染性疾病遗传学研究中心。
1
伊朗扎赫丹扎赫丹医科大学医学院临床生物化学系。
2
伊朗扎赫丹扎赫丹医科大学儿童和青少年健康研究中心。
三
伊朗德黑兰Shahid Beheshti医科大学Shahid Labbafinejad医学中心泌尿系泌尿和肾脏研究中心。
4
伊朗扎赫丹扎赫丹医科大学非传染性疾病遗传学研究中心。
*通信:r_b_1333@yahoo.com。
2019年1月25日收到;2020年4月13日验收。
摘要
几项研究评估了EGLN2 4-bp插入/删除(ins/del)多态性(10680577卢比)和许多癌症。然而,到目前为止,还没有研究对10680577卢比前列腺癌(PCa)风险的多态性。这项病例对照研究对170名经病理证实的PCa患者和196名无癌男性进行了检查rs10680577变异与PCa患者的风险和临床病理特征有关。通过不匹配聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)进行基因分型。研究结果不支持变异体与PCa患者的风险和临床病理特征之间的关联。当我们将我们的结果与之前的六项研究相结合时,发现表明10680577卢比变异显著增加了杂合子(OR=1.38,95%CI=1.26-1.52,p<0.00001,ins/delvs-ins/ins)、纯合子(OR=1.66,95%CI=1.05-2.61,p=0.029,del/delvs-ins/ins遗传模型。为了证实我们的发现,有必要进行更多设计良好、样本量更大的研究。
关键词:EGLN2-RERT,lncRNA,前列腺癌,多态性,indel
介绍
前列腺癌(PCa)是全球男性最常见的癌症之一(Jemal等人,2011年)。前列腺癌发生的确切机制目前尚不清楚。越来越多的证据表明,基因组和环境因素在PCa的发展和进展中发挥着作用(Cunningham等人,2003;Chokkalingam等人,2007;Zhou等人,2015;Sattarifard等人,2018)。小插入/缺失(indels)是人类基因组中第二常见的遗传变异形式,与癌症的发展有关(Mullaney等人,2010年;Hashemi等人,2018a;Hashemin等人,2018年c;Hashemis等人,2018年d)。
EGLN2(Egl九同系物2)位于第19号染色体(19q13.2)上的基因编码脯氨酰羟化酶1(PHD1)(Ryan等人,2014)。
缺氧是实体瘤的一个主要特征,会导致肿瘤细胞中基因表达的改变,以适应缺氧环境(Brahimi Horn等人,2007)。缺氧诱导因子1(HIF-1)是一种关键的转录激活因子,由缺氧诱导(Semenza,1999)。HIF-1在实体瘤的发展以及协调细胞对缺氧和氧气稳态的反应中发挥着关键作用(Maxwell和Ratcliffe,2002;塞门扎,2007年;Kaelin和Ratcliffe,2008年)。HIF-1水平受到三种PHD(PHD1、PHD2和PHD3)的严格调节(Appelhoff等人,2004;Willam等人,2004)。在常氧条件下,PHD使用氧气作为底物,在特定残基处对HIF进行羟基化。羟基化HIF与一种称为Von Hippel-Lindau蛋白(VHL)的蛋白质结合以降解,而在缺氧状态下,发生稳定和核移位,导致癌基因激活(Appelhoff等人,2004;Stolze等人,2006;Pezzuto和Carico,2018)。
一些研究调查了EGLN2 4-bp ins/del多态性之间的相关性(10680577卢比)以及对各种癌症的易感性,包括乳腺癌(Hashemi等人,2018b)、结直肠癌(Li等人,2017)、胃癌(Wang等人,2014)、肝细胞癌(HCC)(Zhu等人,2012)和肺癌(Che等人,2014;Zhu等,2018),据我们所知,没有关于EGLN2 4-bp ins/del多态性对PCa敏感性影响的数据。因此,目前的研究旨在评估这种变体对PCa发展的影响。
材料和方法
这项病例对照研究对170例经组织学证实的前列腺癌患者和196名无癌男性进行了研究。研究设计和登记程序已在前面解释过(Hashemi等人,2017a;Hashemi-等人,2017 b;Sattarifard等人,2018)。这项研究得到了扎赫丹医科大学伦理委员会的批准,所有参与者都被要求提供书面知情同意书。在EDTA管中采集全血样本,用盐析法纯化基因组DNA。
基因分型
EGLN2 4-bp ins/del基因分型(10680577卢比)如前所述,通过错配聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)进行多态性分析(Hashemi等人,2018b)。正向和反向引物分别为5`-CCGTATAAAAAGATACTTAAAATACAC-3`和5`-TTGGAATCAAGTGGTCGTCG-3`。PCR使用Prime Taq Premix(Genet Bio,韩国)实现,PCR产物用AleI限制性内切酶消化。del等位基因消化并产生224和31 bp片段,而ins等位蛋白未消化(259 bp)。
统计分析
所有分析均采用SPSS 22统计软件包进行。χ2分类数据和连续数据分别采用独立样本t检验。通过logistic回归分析估计比值比(OR)和95%置信区间(95%置信区间)。P值<0.05被认为具有统计学意义。
合并分析
使用STATA 14.1软件将我们的结果与之前发表的六项研究进行汇总。在电子数据库中搜索所有描述EGLN2 4-bp ins/del多态性与癌症易感性之间关系的文章。纳入汇总分析的研究特征如所示EGLN2多态性与癌症风险之间的关系通过合并OR及其95%CI进行评估。通过Z检验评估合并OR的显著性,P<0.05被认为具有统计学意义。通过I2检验和Q检验确定研究之间的异质性。I2≥50%或PQ<0.1表明存在异质性。如果存在异质性,则应用随机效应模型。我们使用Begg漏斗图和Egger检验确定了发表偏倚。为了评估数据的稳定性,进行了敏感性分析。
表3
作者 | 年份 | 国家 | 种族 | 癌症类型 | 控制来源 | 基因分型方法 | 病例/对照 | 案例
| 控制
|
---|
| | | | | | 输入/输入 | 输入/输出 | 删除/删除 | 英寸 | 德尔 | 输入/输入 | 输入/输出 | 删除/删除 | 英寸 | 德尔 |
---|
胆碱酯酶 | 2014 | 中国 | 亚洲的 | NSLC公司 | HB公司 | PCR-页面 | 406/812 | 241 | 154 | 11 | 636 | 176 | 536 | 252 | 24 | 1324 | 300 |
哈希米 | 2018 | 伊朗 | 亚洲的 | 乳腺癌 | HB公司 | PCR-RFLP | 134/154 | 35 | 94 | 5 | 164 | 104 | 50 | 91 | 13 | 191 | 117 |
锂 | 2017 | 中国 | 亚洲的 | CRC公司 | HB公司 | PCR-页面 | 1008/1240 | 571 | 383 | 54 | 1525 | 491 | 825 | 383 | 32 | 2033 | 447 |
王 | 2014 | 中国 | 亚洲的 | 胃癌 | HB公司 | PCR-页面 | 415/830 | 235 | 159 | 21 | 629 | 201 | 541 | 266 | 23 | 1348 | 312 |
朱 | 2018 | 中国 | 亚洲的 | 肺癌 | HB公司 | PCR-页面 | 376/419 | 222 | 117 | 37 | 561 | 191 | 283 | 125 | 11 | 691 | 147 |
朱 | 2012 | 中国 | 亚洲的 | 肝癌 | HB公司 | PCR-页面 | 1067/1692 | 607 | 406 | 54 | 1620 | 514 | 1125 | 522 | 45 | 2772 | 612 |
当前研究 | | 伊朗 | 亚洲的 | 前列腺癌 | HB公司 | PCR-RFLP | 170/196 | 51 | 109 | 10 | 211 | 129 | 59 | 118 | 19 | 236 | 156 |
结果
研究组包括170名经组织学证实的前列腺癌患者(平均年龄:61.2±6.6岁)和196名无癌男性(平均年龄为64.5±8.9岁)。病例组和对照组之间的年龄差异具有统计学意义(p<0.05)。基因型和等位基因的频率分布如所示结果表明,EGLN2 4-bp ins/del多态性与PCa易感性在杂合子(OR=0.98,95%CI=0.61-1.57,p=0.816)、纯合子(OR=0.50,95%CI=0.21-1.21,p=0.126)、显性(OR=0.91,95%CI=0.58-1.45,p=0.695)、隐性(OR=1.95,95%Cl=0.87-4.41,p=107)和等位基因(OR=0.92,95%CI=0.69-1.25,p=0.649)中均不相关遗传模型。
表1
基因型和等位基因频率EGLN2型PCa和对照中的rs10680577(4-bp ins/del)多态性
4-bp ins/del多态性 | 案例 n(%) | 控制 n(% | *或(95%置信区间) | *P(P) |
---|
共显性的 | | | | |
英寸/英寸 | 51 (30.0) | 59 (30.1) | 1 | - |
输入/输出 | 109 (64.1) | 118 (60.2) | 0.98 (0.61-1.57) | 0.816 |
删除/删除 | 10 (5.9) | 19 (9.7) | 0.50 (0.21-1.21) | 0.126 |
占主导地位 | | | | |
英寸/英寸 | 51 (30.0) | 59 (30.1) | 1 | - |
ins/del+del/del | 119 (70.0) | 137 (69.9) | 0.91 (0.58-1.45) | 0.695 |
隐性的 | | | | |
Ins/del+Ins/Ins | 160 (94.1) | 177 (90.3) | 1 | - |
De/del(删除/删除) | 10 (5.9) | 19 (9.7) | 1.95 (0.87-4.41) | 0.107 |
阿勒 | | | | |
英寸 | 211 (62.0) | 236 (60.2) | 1 | - |
德尔 | 129 (38.0) | 156 (39.8) | 0.92 (0.69-1.25) | 0.649 |
确定变异与年龄、分期、前列腺特异性抗原(PSA)水平、Gleason评分、神经侵袭和手术切缘等临床病理特征之间的关系(). 结果表明,变异与临床病理特征之间没有显著关系。
表2
前列腺癌患者EGLN2 4-bp-ins/del多态性与临床特征的关系
患者特征 | EGLN2 4-bp英寸/磅
| 第页 |
---|
输入/输入 | 输入/输出 | 删除/删除 |
---|
诊断年龄(年,n) | | 0.32 |
≤60 | 22 | 54 | 7 | |
>60 | 28 | 55 | 三 | |
阶段 | | | | 0.554 |
第1页 | 2 | 5 | 1 | |
第2页a | 三 | 20 | 2 | |
第2页b | 2 | 8 | 1 | |
第2页 | 30 | 50 | 5 | |
pT3a型 | 三 | 6 | 1 | |
pT3b型 | 10 | 20 | 0 | |
诊断时PSA水平(ng/ml),n | | 0.923 |
≤4 | 1 | 1 | 0 | |
4-10 | 26 | 54 | 6 | |
>10 | 23 | 54 | 4 | |
格里森得分,n | | | | 0.228 |
≤7 | 40 | 84 | 10 | |
>7 | 10 | 25 | 0 | |
神经周侵袭,n | | | | 0.567 |
积极的 | 31 | 72 | 5 | |
阴性 | 19 | 37 | 5 | |
手术切缘,n | | | | 0.883 |
积极的 | 17 | 40 | 三 | |
阴性 | 33 | 69 | 7 | |
主要汇总分析结果
与之前六项已发表研究的汇总结果支持EGLN2的4-bp ins/del多态性与癌症易感性之间的关联。杂合子(OR=1.38,95%CI=1.26-1.52,p<0.00001,ins/delvs-ins/ins)、纯合子(OR=1.66,95%CI=1.05-2.61,p=0.029,del/delvs-ins/ins,和等位基因(OR=1.32,95%CI=1.18-1.49,p<0.00001,del vs ins)遗传模型(和).
表4
EGLN2 4-bp ins/del多态性与癌症易感性之间关联的合并OR和95%CI
遗传模型 | 关联测试
| 异质性测试
| 出版偏见
|
---|
| OR(95%置信区间) | Z | 第页 | χ2 | 我2(%) | P(P) | 艾格试验p | 贝格试验p |
---|
ins/del与ins/ins | 1.38 (1.26-1.52) | 6.98 | <0.00001 | 2.68 | 0 | 0.848 | 0.109 | 0.051 |
del/del与ins/ins | 1.66 (1.05-2.61) | 2.18 | 0.029 | 21.46 | 72 | 0.002 | 0.115 | 0.099 |
ins/del+del/del vs ins/ins | 1.44 (1.32-1.58) | 8.15 | <0.00001 | 3.61 | 0 | 0.729 | 0.044 | 0.099 |
del/del vs ins/del+ins/ins | 1.45 (0.90-2.32 | 1.54 | 0.12 | 24.15 | 75 | 0 | 0.133 | 0.099 |
del与ins | 1.32 (1.18-1.49) | 4.73 | <0.00001 | 13.39 | 55 | 0.04 | 0.081 | 0.176 |
EGLN2 4-bp ins/del多态性与ins/del vs-ins/ins(A)、del/del vs ins/ins(B)、ins/del+del/delvs-ins/ins(C)、dels/delvs-ins/del+del/del(D)和del vs-ins(E)癌症易感性关系的森林图。
汇总分析中包含的研究之间的异质性如所示研究结果表明杂合子和显性遗传模型没有异质性。
Begg的漏斗图和Egger的测试发现,除显性遗传模型外,所有遗传模型均无发表偏倚().
我们进行了敏感性分析,以评估每项研究对总体估计的影响。除纯合模型外,合并的OR没有实质性变化,这表明当前的合并分析是稳定可靠的。
讨论
由EGLN2基因编码的脯氨酸羟化酶1(PHD1)参与了特定残基的脯氨酸羟基化对HIF-1的催化降解。一些研究检查了EGLN2 4-bp ins/del多态性的作用和一些癌症的风险(Zhu等人,2012年;Che等人,2014年;Wang等人,2014;Li等人,2017年;Hashemi等人,2018b;Zhu等,2018年)。在本研究中,我们首次检测了EGLN2 4-bp ins/del多态性与前列腺癌风险和临床病理特征之间的相关性。我们的研究结果表明,这种变异与PCa患者的易感性以及临床病理特征之间没有关联。此外,对我们的结果与六项先前发表的研究进行的汇总分析表明,杂合、纯合、共显性和等位基因遗传模型中的变异与整体癌症风险之间存在显著关联。
长非编码RNA(lncRNAs)是一类长度超过200个核苷酸的非编码转录物,参与基因表达的表观遗传、转录和转录后调控(Ponting等人,2009年)。越来越多的证据表明,lncRNA的失调表达有助于各种癌症的发展和进展,因为其作为原癌基因或抗癌基因的功能(Pibouin等人,2002;Calin等人,2007;Lin等人,2007年;He等人,2016;Tian等人,2016年;Pei等人,2017年)。
RERT-lncRNA位于EGLN2的近端启动子内,长2849个碱基对,具有4 bp ins/del多态性(10680577卢比)属于PERT-lncRNA(Zhu等人,2012)。同于rs10680577变异体位于RERT-lncRNA内,该变异体可能通过影响其折叠结构来影响RERT-lncRNA的表达水平。最近,Zhu等人(2018)报告称,4-bp ins/del多态性(10680577卢比)影响EGLN2和PERT lncRNA的表达。他们发现ins/del+del/del基因型携带者增加了RERT lncRNA和EGLN2的表达水平。
总之,我们的研究结果表明,EGLN2 4-bp ins/del多态性与伊朗人群PCa的易感性和临床病理特征无关。我们的研究结果与先前发表的研究结果的汇总分析表明,4-p-ins/del变体显著增加了整体癌症的风险。
致谢
本研究得到扎赫丹医科大学研究副教授的论文资助(NR#6802硕士论文)。
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