图5

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ERE样序列富集在假定靶基因的扩展启动子区域。(a)使用先前发布的模型和优化的灵敏度设置进行ERE预测。根据统计显著性排序,对最重要的推测ER靶基因和非响应基因的扩展启动子区域(-3000到+500,两条链)进行预测模型测试。这个-轴表示结合位点预测的相对频率,由具有预测位点的基因数除以总基因数决定。查询的最重要基因的数量显示在x个-轴。推测靶基因中ERE预测的频率明显更高(第页=0.0027)。结合位点预测也使用位置权重矩阵来描述(b)Sp1、,(c)AP-1和(d)已知Sp1和AP-1都参与调节某些靶基因的ER结合。GATA1位点被列为阴性对照。这些位点在假定的靶基因中没有显著富集(参见第页-图中的值)。