图2

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建立一流的PRMT5特异性抑制剂。(A) rPRMT1的晶体结构视图(aa 41-353,蛋白质数据库[PDB]ID1或8,灰色带状表示)叠加在hPRMT5模型的C末端结构域上(aa 310-637,绿色带状表示),显示了PRMT家族催化结构域的保守性质。辅因子SAM和底物精氨酸残基结合囊分别显示为红色和蓝色区域。(B) rPRMT3晶体结构显示共结晶SAH和精氨酸残留物(紫色碳棒表示)。(C) hPRMT5模型显示对接SAH和精氨酸残基的取向与rPRMT3晶体结构相似。(D) 与hPRMT5模型对接的SAH和精氨酸(棒状代表;紫色碳)的特写视图(绿色丝带和绿色碳棒状代表中的关键残基)。(E) CMP5(棒状代表;紫色碳)与hPRMT5模型对接(绿色丝带和绿色碳棒状代表中的关键残基),显示了与残基的初始预测相互作用。为了清楚起见,图中未显示覆盖催化部位表面的残留物。(F) 使用针对对称(S)二甲基化S2Me-H4R8和S2Me-H3R8的抗体,用DMSO、CMP5或CMP6处理的JeKo细胞(MCL细胞系)的免疫荧光染色。DAPI(4,6-二氨基-2-苯基吲哚)染色细胞核。(G) 选择性PRMT5抑制剂CMP5和非反应性对照CMP6的化学结构。(H) 在DMSO、CMP5(10-100μM)或CMP6(10-100µM)存在的情况下,按照“方法”中所述进行组蛋白甲基转移酶分析。(一) hPRMT5(aa 310-637,PDB ID 4GQB,蓝带表示)C端畴的晶体结构视图叠加在hPRMT五型(绿带表示)上。(J) 叠加hPRMT5晶体结构(蓝色带和蓝色碳棒表示法)和模型(绿色带和绿色碳棒表示)的近距离催化位置视图。共晶SAM模拟物和底物精氨酸残基分别显示为黄色碳棒和线条表示。(K) CMP5(黄色碳棒表示)在优化hPRMT5晶体结构的活性部位的对接构象视图。相互作用的氨基酸残基以蓝色棒状显示。(五十) 相等的数字(0.5×106)正常B细胞(静止或激活)或指定的DLBCL细胞系(Pfeiffer和SUDHL-2)用增加浓度的CMP5处理,24小时后通过膜联蛋白V-碘化丙啶(PI)染色和流式细胞术测定细胞活力。(M) 用增加的CMP5浓度处理来自3个不同健康供体的正常B细胞,并在24、48和72小时通过annexin V-PI染色和流式细胞术测定细胞死亡。(N-O)转化细胞系(60A)和永生化细胞系(D-9)用增加浓度的CMP5处理,并在24和48小时通过annexin V–PI染色和流式细胞术测定细胞死亡。数据显示为annexin V的百分比负极圆周率负极细胞(活细胞),并将其归一化为未经处理的对照*P(P)< .05; **P(P)< .01. 误差条表示平均值的标准误差(SEM)。