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在线发布2014年8月11日。 数字对象标识:10.3389/fchem.2014.00061

图4

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ASCT2人和大鼠转运体的同源模型通过Modeler 9.13软件(Sali和Blundell,1993)以谷氨酸转运体同源物的结构(PDB1XFH)为模板P.horikoshii先生(Glpth)。为了运行该软件,ClustalX2软件使用.pir输出格式对齐序列。通过Spdbv 4.1.0计算模型比较的RMSD。VMD 1.9.1对大鼠和人体结构模型进行叠加。(A)人类蛋白质(透明)在bleu中包含一个可变环,大鼠蛋白质(紫色)包含一个红色的可变环。CXXC金属结合基序的Cys残基仅存在于大鼠蛋白质中,以黄色突出显示。(B)人类蛋白质呈灰色;老鼠在布鲁。这两种蛋白质的假定糖基化位点以红色突出显示。两种同源蛋白质共同的半胱氨酸残基以浅绿色突出显示。仅存在于大鼠蛋白质中的其他Cys残基以黄色突出显示。大鼠和人类蛋白质的N端和C端几乎一致,并以单个N和C突显。

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