HMGB1包含两个折叠的DNA结合基序,称为A盒和B盒。它的尾巴呈酸性,含有一串谷氨酸和天冬氨酸。HMGB1是一个高度保守的跨物种,小鼠和人类之间的序列同源性超过98%。HMGB1有三个半胱氨酸,其中两个位于A框中的23和45位,另一个位于B框中的106位。此外,HMGB1包含两个NLS,一个位于A框中(aa 28–44),另一个位于B框中(aa 179–185)。K、 高乙酰化目标赖氨酸。
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