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图4。

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GAC超低聚物组装模型。 A类从TEM显微照片中去除高频(与噪音密切相关)突出了上部结构的右手双绞线性质,从而可以确定其几何特征。B类,手动验证交联MS/MS光谱b条交联肽的α链和β链的离子系列(在残基Lys之间181和Lys207,赖氨酸202和Lys578、和赖氨酸403和Lys512离子表示为箭头具有相应的/z(z)值。C类,四聚体中DSS连接的赖氨酸对的相对位置,如MS所鉴定。活性位点的边界由固体表面界定。†,赖氨酸578未在晶体结构中建模。提出的单链生长方向是通过N末端结构域对之间的端到端相互作用,穿过四聚体的最长轴。交替橙色黄色便于沿着单链鉴定四聚体。D类,每个交联对中的一个赖氨酸残基分别被谷氨酸取代,并测定酶活性(左侧面板)和上部结构形成(右侧面板). N末端区域突变体(GAC.K202E和GAC.K207E)增强了这两种效应。另一方面,GAC。谷氨酰胺酶域内的K512E生成一种非功能蛋白,类似于乙酰化模拟GAC。K316Q号。这个绿色区域界定GAC二聚体之间的预期斯托克斯半径(D类)和四聚体(T型),根据晶体结构尺寸计算。这个星号表示以前发布的野生型GAC结果(5).E类,手动建模双绞线(面板i),使用来自C类并遵循以下几何限制A类.英寸第二组,计算出的傅里叶F类计算map(双链模型的振幅和相位)-限制为35Å最大分辨率-是二维投影,最终结果如所示第三小组所有特征都与第四组,关于交替出现的高密度狭窄区域(表示为实心三角形)以及低密度宽圆盘状区域(由开放三角形).

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