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单元格。作者手稿;PMC 2013年10月25日提供。
以最终编辑形式发布为:
单元格。2013年4月25日;153(3): 601–613.
数字对象标识:2016年10月10日/j.cell.2013.03.028

图3

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肝星状细胞中的VDR和SMAD3 Cistromes

(A) 和(E)饼图,说明经16小时钙泊三醇(100nM)预处理后4小时处理的LX-2细胞(钙泊三酚(100nM)和TGFβ1(1ng/ml)中VDR和SMAD3结合位点的基因组位置,FDR<0.0001)。启动子区域,来自TSS的<2kb;基因间区域,不是启动子、内含子或外显子。(B) 和(F)代表性ChIP-Seq分别读取与CYP24A1和ID1基因对齐的VDR和SMAD3。(C) 和(G)用VDR和SMAD3结合位点注释的基因的基因本体(GO)分类。(D) 和(H)从头开始对VDR和SMAD3峰值100bp内的序列进行模体分析(FDR<0.0001)。另请参见图S3和S4.

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