与BAC CGH数据相比，p501阵列产生的扩增和缺失示例以及基因分型数据。(顶部面板）p501阵列的荧光比率图，显示样品的平滑荧光强度数据除以参考样品的数字。（第二个面板）第页-通过与29个正常DNA的平均值和标准偏差进行比较，计算出单个SNP的值图，缺失用红线表示，扩增用绿色表示。（第三和第四组）分别为肿瘤和匹配正常样本的基因型；纯合子SNP由中心点下方的红线表示，而杂合标记由中心点上方的绿线表示。(底部中的面板C类和D类仅）基于BAC阵列的CGH的结果（如果可用）。(A类)前列腺细胞系COR-L96-CAR第8号染色体C-MYC位点（箭头）的基因组扩增。(B类)肾癌细胞株LB1047第9染色体上p16/INK4位点的纯合缺失（箭头）。(C类)乳腺癌细胞系HCC1937的18号染色体。（i） 从pter到18q12.1，该染色体的拷贝数为2（强度比为1）。（ii）从18q12.1到18qter，拷贝数下降到1（强度比为0.5），尽管基因分型数据表明该系在18号染色体全长上是杂合的。(D类)小细胞肺癌细胞系NCI-H209的5号染色体。该染色体显示出一个复杂的模式，p臂部分扩增（i），随后荧光强度下降到0.5，相应的LOH由基因分型数据（ii）确定，直到5q23.2（iii），其中强度比恢复到1（拷贝数为2）；然而，该区域仍然代表由基因分型数据确定的LOH，因此代表单个亲本染色体的重复。5q14.3处也有纯合缺失（箭头）。BAC阵列没有检测到这一点，因为该阵列没有覆盖该区域的克隆。
