肿瘤靶点。2010年11月;1(7): 620–627.
波形蛋白的氨酰化354与PIAS3抑制胶质瘤细胞迁移有关
,1,2 ,三 ,2 ,4 ,4 ,5 ,5 ,1 ,6 ,7 ,1和1,4
王黎明
1兰州大学生命科学学院,中国兰州
2美国克利夫兰克利夫兰诊所基金会勒纳研究所癌症生物学系
张健(Jian Zhang)
三美国布法罗Tartis公司
西普拉·班纳吉
2美国克利夫兰克利夫兰诊所基金会勒纳研究所癌症生物学系
劳拉·巴恩斯
4美国克利夫兰临床基金会勒纳研究所分子遗传学
文卡特斯瓦拉·萨贾
4美国克利夫兰临床基金会勒纳研究所分子遗传学
穆克什·K·阿加瓦尔
6美国克利夫兰Invenio Therapeutics公司
大卫·N·沃尔德
7美国克利夫兰凯斯西储大学病理学系
杨金波
1兰州大学生命科学学院,中国兰州
4美国克利夫兰临床基金会勒纳研究所分子遗传学
1兰州大学生命科学学院,中国兰州
2美国克利夫兰克利夫兰诊所基金会勒纳研究所癌症生物学系
三美国布法罗Tartis公司
4美国克利夫兰临床基金会勒纳研究所分子遗传学
5美国克利夫兰州立大学化学系
6美国克利夫兰Invenio Therapeutics公司
7美国克利夫兰凯斯西储大学病理学系
2010年9月30日收到;2010年11月10日接受。
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摘要
多形性胶质母细胞瘤(GBM)的侵袭性表型是恶性过程的标志,但决定这种局部侵袭行为的分子机制尚不清楚。PIAS3过度表达可有效改变细胞形状并抑制GBM细胞迁移。我们重点研究了PIAS3刺激的sumoylation的分子靶点,它在抑制GBM细胞运动中起着重要作用。在这里,我们报告了通过SUMO1抗体免疫沉淀,然后进行蛋白质组学分析,鉴定波形蛋白(vimentin354),GBM细胞中的一种核成分,作为PIAS3促进的sumoyalization的主要靶标。
关键词:SUMO化、波形蛋白、PIAS3、胶质母细胞瘤细胞迁移
简介
多形性胶质母细胞瘤(GBM)占美国所有原发性脑肿瘤的29%或每年新增5000例[1]. 这些肿瘤的浸润性生长模式妨碍了治疗性神经外科手术,并且没有任何治疗方式实质性改变了GBM患者的预后[2]. GBM通过主动细胞迁移传播,而不是通过被动血行传播[三-5]. GBM的一个主要特征是细胞的极端迁移潜能和地形扩散性,导致无法完全解剖GBM肿瘤[6]. 迫切需要新的有效治疗方法来治疗晚期和侵袭性GBM。
P(P)蛋白质我抑制剂A类激活的S公司周转时间三通过阻断STAT3的DNA结合活性和抑制STAT3介导的基因激活,首次将(PIAS3)鉴定为一种特异性抑制剂[7]. 新证据表明,PIAS3通过与ATBF1相互作用抑制STAT3介导的信号转导[8]. PIAS3还充当其他转录调节因子的结合蛋白,如雄激素受体、TIF2和NF-kappaB[9]. 最近的研究表明,PIAS3作为一种E3类连接酶,刺激小泛素样修饰物(SUMO)与靶蛋白的连接,这些靶蛋白在Wnt信号、p53信号和类固醇激素信号等重要的细胞途径中发挥作用[9,10].
PIAS3在体内外诱导前列腺癌细胞凋亡[11]. 当PIAS3在GBM细胞中过度表达时,观察到生长受到完全抑制,细胞迁移受到抑制[12]. 考虑到PIAS3的SUMO连接酶活性,一个明显的问题是PIAS3介导的凋亡/迁移途径调控因子的sumoylation是否参与抑制过程。为了表征GBM的极端迁移潜能,我们重点研究了PIAS3刺激的sumoylation对GBM细胞迁移的抑制作用。
结果
Ad/PIAS3抑制U373细胞迁移
当静止的GBM U373细胞被低滴度(5 pfu/cell)的Ad/PIAS3感染时,细胞形态发生改变,细胞变圆,失去突起(图). 如“人工伤口试验”所示,这是一个二维细胞运动系统[13]与Ad/EGFP感染的细胞相比,U373细胞迁移明显受到抑制(图). 运动抑制可以通过细胞数量的减少反映出来(图)和缩短距离(对于igure,F聚合温度为72OC)从人工伤害的源头移出。控制细胞向运动方向有很长的过程。相比之下,经Ad/PIAS处理的细胞形成的长过程很少(如果有的话),并且这些过程不会向前延伸。
Ad/PIAS3抑制U373细胞迁移答:。汇合的U373细胞在起始处被切割和提升(箭头所示),并感染5 pfu/cell Ad/PIAS3。在指定的时间用相差显微镜拍摄迁移图像(原始放大倍数×10或×20)。图像大小为:420×210 nm用于24小时,420×315 nm用于48小时,840×630 nm用于72小时。
B。从原点迁移出去的细胞数量;C、。从原点迁移的细胞的中间距离。与对照细胞相比,Ad/PIAS3感染的细胞数量减少,迁移距离缩短(三个独立实验的平均值,Student t检验P<0.01)。
D。PIAS3促进U373细胞的sumoylation。收集24小时对照组(U373)、Ad/PIAS3感染组(+PIAS3)、EGFP-SUMO1瞬时转染组(+GFP-SUMO)和EGFP-SUMO1转染后Ad/PIAS3感染的U373细胞(+GFP-SUMO+PIAS2)的相控显微图像。荧光EGFP-SUMO1清楚地表明,PIAS3增加了SUMO1的表达和细胞核中EGFP-SSUMO融合蛋白的积累(分别位于下方的两个面板)。
为了检测PIAS3是否促进sumoylation,在感染U373细胞之前,用增强型绿色荧光蛋白(EGFP)标记的SUMO1转染细胞。如图所示,PIAS3确实促进了EGFP-SUMO1融合蛋白在细胞核中的积累,这反映在Ad/PIAS3处理的GBM细胞中绿色荧光强度的增加。
PIAS3促进Vimentin354 sumoylation
下一个问题是PIAS3刺激的sumoylation的分子靶点是什么,它在抑制GBM细胞运动中起着重要作用。PIAS3主要定位于细胞核[9,12]PIAS3刺激后,荧光EGFP-SUMO1积聚在细胞核内。与过表达tag-SUMO鉴定的大多数sumoylated蛋白不同,我们的目标是检查PIAS3对内源性SUMO的刺激作用。然后,用琼脂糖偶联SUMO1抗体(Santa Cruz)进行核蛋白免疫沉淀(IP)。如图所示在Ad/PIAS3感染细胞中,SUMO抗体可鉴定出两种最显著的蛋白质,分子量约为53kDa和86kDa,表明PIAS3确实促进核蛋白的内源性sumoylation。由于western blot结果的分辨率有限,我们无法通过SUMO-IP检测到更多的sumoylated但较少的蛋白质。
PIAS3刺激的波形蛋白的验证354U373细胞细胞核中的sumoylation答:。蛋白质鉴定的代表性纳米HPLC/MS/MS分析。完整的vimentine354肽序列在顶部面板上给出。中间面板:凝胶切片胰蛋白酶消化物的纳米HPLC/MS/MS基峰色谱图,质量范围为53kDa;下面板:保留时间为63.2分钟的质谱图,以及波形蛋白特有的肽ILLAELEQLK的质谱图354蛋白质。
B和C。用Ad/PIAS3感染静止细胞24小时,制备细胞溶质或核蛋白裂解物。然后对Ad/EGFP模拟对照(C)或Ad/PIAS3(P)感染的U373细胞中由SUMO抗体(nuclear IP)免疫沉淀的80%的核蛋白进行免疫印迹,以证明两种SUMO的运动性相同(B类)和波形蛋白354(C类). 对50微克的细胞溶质和核蛋白进行印迹,以显示未修饰波形蛋白的分子量354约41.5 kDa。D类.核波形蛋白的Sumoylation354在Ad/PIAS3感染后的不同时间点。E类波形蛋白的比较354和波形蛋白466具有91%的同源性,每个都有一个丝杆结构域,对蛋白质相互作用至关重要。波形蛋白354在N末端缺乏负责DNA结合的IF头部结构域。
切除聚丙烯酰胺凝胶上分离的考马斯蓝染色核IP蛋白带,并对凝胶中的蛋白质或琼脂糖珠上的整个IP产物进行胰蛋白酶化。然后通过高效液相色谱和质谱/质谱(HPLC-MS/MS)分析消化肽。令人惊讶的是,vimentin354(登录号AAA61281)[14]在所有四个独立的SUMO-IP中进行鉴定,然后对两个MS岩芯进行MS-MS分析(图). 波形蛋白的分子量354约为41.5 kDa,当被SUMO1(MW:11 kDa)修改时,应移至52.6 kDa。山羊抗波形蛋白抗体的Western blot证实了波形蛋白的sumoylation354仅在核裂解物的IP产物中发现(图). 波形蛋白466(登录号NP_003371,分子量53.6 kDa)也从约86 kDa的带中鉴定出,但山羊抗波形蛋白抗体无法识别。当SUMO-IP从不同时间点提取核蛋白时,通过western blot分析,波形蛋白354发现随着Ad/PIAS3感染时间的延长而减少,48小时后降至检测不到的水平(图).
解散
波形蛋白已被用作GBM和星形细胞瘤的分子标记物[15-17]. 激光捕获微核检测的GBM细胞的基因表达谱显示肿瘤核心中波形蛋白水平较高[18]. 理论分析预测了两种高概率赖氨酸(K261和K201)和一种低概率赖氨碱(K111)[19]作为假定的SUMO站点。根据western blot上的分子量计算,只有一个SUMO附着在波形蛋白上354,导致SUMO-IP上的主频带预计为53 kDa。波形蛋白的亚细胞定位354经理论计算,其可靠性为76.7%[20],这与我们的观察结果相吻合。与丰富的波形蛋白相比466位于细胞核和细胞质中的核波形蛋白354表达水平很低,因此,波形蛋白354荧光免疫组化无法显示(数据未显示)。哺乳动物SUMO的C末端缺乏赖氨酸或精氨酸残基,这使得绘制sumoylation位点很困难[21]这可能解释了我们在MS/MS分析中未能识别SUMO肽的原因。
波形蛋白是细胞骨架和核膜的原始成分,属于间充质细胞中发现的III类中间丝(IF)。波形蛋白的从头表达经常参与上皮-间充质转化(EMT),与上皮细胞和癌细胞的侵袭/迁移特性增加相关[22]. 在前列腺癌细胞中,波形蛋白的表达水平与细胞运动性相关,大多数低分化癌症和骨转移瘤细胞中波形蛋白表达较高[23]. 当波形蛋白在实验中减少时,细胞的侵袭潜力可以在在体外基质侵入试验[24]. 波形蛋白在乳腺癌模型中的过度表达导致体外运动性和侵袭性增强,波形蛋白反义寡核苷酸可暂时下调其表达[25]. 利用体外创伤愈合模型,已经证明波形蛋白与乳腺上皮细胞的迁移状态短暂相关,并可能在功能上参与其迁移状态[26]. 我们的观察提示,sumoylation可能是去除功能性波形蛋白的另一种方式,从而抑制GBM细胞的运动。
与波形蛋白相比466,波形蛋白354在N末端缺少112个残基,代表IF头部(DNA结合)序列,该序列能够改变核结构和染色质分布。与波形蛋白具有91%的同源性466(图),波形蛋白354具有相同的B-Box型锌指、锌结合域、RING-finger(Really Interest New Gene)域,参与介导蛋白质相互作用,具有信号转导和发育等广泛功能。迁移与细胞形状和细胞骨架的力学密切相关。除了目前认为黏性流体状细胞质和弹性膜是主要承重元件的模型外,还提出了“硬线”跨膜受体、细胞骨架丝(包括波形蛋白)和核支架负责细胞形状控制的观点[27]. 波形蛋白354可能作为细胞核中的末端连接分子来容纳整个IF网络,这对于支持细胞骨架的三维形状至关重要。
SUMO-1的翻译后修饰是真核细胞中一个高度保守的过程,在许多细胞过程中起着重要的调节作用。自从vimentin354是PIAS3刺激后细胞核内源性sumoylation的主要靶点,可能在维持GBM细胞的正常细胞形状和运动中起关键作用。靶向细胞运动成分肌动蛋白已被提议用于对抗癌细胞迁移[28]. 我们的数据表明波形蛋白354可添加到治疗靶点以对抗GBM。
材料和方法
细胞培养与Ad/PIAS3感染
胶质母细胞瘤U373细胞在含有5%胎牛血清和抗生素的Dulbecco改良Eagles培养基(DMEM)中培养。细胞在含5%CO的增湿空气中37℃培养2构建了带有PIAS3的腺病毒5。通过RT-PCR扩增人类PIAS3(Genbank登录号NM_006099)的整个编码序列,克隆到pShuttle-CMV载体中,并送往克利夫兰诊所基金会病毒核心进行腺病毒构建和纯化。通过将病毒稀释至培养基中的适当浓度进行感染。使用腺病毒5载体作为对照。
细胞计数
将50000个U373细胞接种在12孔组织培养板的每个孔中,并感染100 pfu/cell Ad/PIAS3。在不同时间点对细胞进行胰蛋白酶消化,通过台盼蓝排除法计算细胞总数或细胞存活率。从三口井得到了平均误差和标准误差的数量。
SDS-PAGE分离和考马斯染色凝胶的凝胶内消化
切除含有感兴趣蛋白带的考马斯染色聚丙烯酰胺凝胶。用50%乙腈在100 mM碳酸氢铵中去除凝胶,然后用100%乙腈去除凝胶。蛋白质在室温下用20 mM二硫苏糖醇(DTT)在凝胶中还原30分钟,然后在100 mM碳酸氢铵中用50 mM碘乙酰胺在黑暗中烷基化30分钟。处理后,去除试剂,用100 mM碳酸氢铵清洗凝胶片,然后在乙腈中脱水。然后将干燥的凝胶片在测序级的溶液中再水化,将改性胰蛋白酶放入50 mM碳酸氢铵中消化过夜。用在5%甲酸中的50%乙腈从凝胶中提取胰蛋白酶肽。LC-MS/MS分析在Bruker HCT 3000+ESI-InTrap质谱仪和安捷伦1100 HPLC系统上进行。另一台岛津LC-10ADvp HPLC泵用于装载样品。将经胰蛋白酶消化的样品注入并首先装入Rheodyne肽捕获剂(Michrom BioResources,Inc.),然后通过毛细管RP-HPLC柱洗脱(10 cm长,300μm ID,5ºC18,来自Grace Vydac)。洗脱梯度为:2%B,10分钟;5%-45%B持续200分钟;45%-85%B持续30分钟;85%B持续30分钟。离子阱质谱仪设置为自动ms/ms模式;前驱体离子的数量为3。收集的MS/MS数据由3.1版Bruker data Analysis进行处理(化合物发现和反褶积)。
免疫组织化学
从Imgenex购买人体正常器官和各种肿瘤的载玻片。用二甲苯去除石蜡,然后进行顺序乙醇清洗。通过将载玻片在10 mM硝酸钠(pH 6.0)中煮沸5分钟来回收抗原,并在PBS中重新水化。首先用0.5%BSA和0.2%冷水鱼明胶(PBG)在PBS上印迹载玻片,然后用抗PIAS3抗体在PBG中孵育。将生物素化二级抗体和与辣根过氧化物酶偶联的链亲和素(ABC试剂盒,Vector Labs)应用于载玻片,按照制造商的说明使用DAB试剂盒(Vector Labs)进行显色。所有图像都是在相同的光照强度、亮度和对比度下拍摄的。
人脑肿瘤RNA
所有原始脑肿瘤均取自克利夫兰临床基金会神经外科,经手术病理确诊为胶质母细胞瘤、星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤。新鲜脑肿瘤块在液氮中快速冷冻,研磨成细粉进行RNA分离。
蛋白质印迹
U373细胞在含有蛋白酶抑制剂的1%Triton X-100裂解缓冲液中进行裂解。通过离心法去除细胞碎片。每个样品中的20 mg蛋白质在SDS-PAGE凝胶上分离,转移到PVDF膜上,并用抗PARP抗体进行印迹。按照制造商的指示,使用ECL-Plus试剂盒(Amersham-Pharmacia)检测印迹上的阳性条带。
PIAS3 mRNA序列的RT-PCR扩增
从正常白质和脑肿瘤中提取的总RNA被反转录为cDNA。通过在95°C下变性1',在55°C下退火1',并在72°C下聚合1'30“,扩增了从核苷酸1到861的PIAS3编码序列。为了进行质量控制,还扩增了516 bp的β-肌动蛋白片段。
胶质瘤细胞运动的测定
如前所述,通过“人工伤口”方法测量细胞迁移[8]. 将汇合在12孔组织培养板中的U373细胞用剃刀切割(伤口),并将50 pfu/cell Ad/PIAS3添加到培养基中进行感染。对照细胞感染相同浓度的Ad/GFP。使用相差显微镜上的数码相机拍摄细胞迁移的图像。在每个孔中,选择三个随机字段来计算穿过原点的细胞数,并计算细胞迁移的中间距离。来自三个重复孔的数据表示为迁移细胞数量的平均值和标准误差以及中间距离。所有实验都至少做了三次。
致谢
我们感谢克利夫兰诊所基金会(CCF)的Ratan Maitra博士制作Ad/PIAS3,并感谢CCF的Jeff Y.Chang和Li Wang提供技术援助。作者感谢CCF的乔治·斯塔克博士和迈克尔·沃格鲍姆博士的支持和有益的评论,并感谢CCF克里斯汀·卡斯巴编辑了手稿。这项工作得到了美国癌症协会凯霍加分会向L.W提供的试点拨款的部分支持;NIH向B.G授予HG01815和CA81653;教育部NCET-08-0260,科技部2009DFA30990;0708WCGA149甘肃省科技厅致J.Y。
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