陆军和焦点SCNA的计算分离.(a)箱线图显示了TCGA中178 GBM剖面上放大焦点(长度<染色体臂的98%)和臂水平(长度>染色体臂的98%)SCNA的拷贝数变化分布。黑色虚线表示用于消除伪SCNA的典型低电平幅度阈值,而绿色虚线表示GISTIC前一版本中用于消除臂级SCNA的标准高电平幅度阈值。(b)直方图显示了在178 GBM样本中观察给定长度SCNA的频率。正好占据一个染色体臂的高频率事件使我们能够区分局灶性和臂水平的SCNA。(c)热图显示TCGA GBM集合的总分段拷贝数剖面(最左侧面板),以及通过计算将这些样本分为臂级剖面(中间面板)和焦点剖面(最右侧面板)的结果,方法是将臂级和焦点SCNA相加。在每个热图中,染色体从上到下垂直排列,样本从左到右排列。红色和蓝色分别代表收益和损失。