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图1。

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SAGE-Seq标签对齐和排序错误最小化。(A类)最佳标记是指紧邻poly(A)尾部的最3′端NlaIII位点(CATG)的标记。(B类)根据补充图S3中的标签对齐管道,样本N1的标签对齐统计。其他数据集的详细映射如补充电子表格1所示。(C类)标签映射过程中发现的推测测序错误。所有列出的标签都是唯一映射到同一RefSeq基因“NM_001010”的最佳标签。(并非列出了在同一位置唯一映射到此基因的每个标签。)X(X)-axis是按标签计数的降序列出的标签序列。最有可能由测序错误引起的序列中的单基差异用红色标记。此特定示例的测序错误最小化步骤按以下方式进行:将所有这些标记的计数相加,并将其分配给标记“CATGGCGTCCGCCTGCTA”,并删除所有其他标记。

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