图1。

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(A类)显示将甲基化DNA捕获到单链(MeDIP)或双链(MBDCap)片段群体中的示意图。(B类)总结了用MeDIP富集完全甲基化DNA的探针强度和两种基于甲基矿工的富集变化。X(X)-轴显示局部CpG密度组(1-50)。Y(Y)-轴显示对数2标度输入标准化强度。每行显示箱中探针的输入正常强度的中值(此处仅适用于GC含量为11的探针)。强度进一步标准化,使最低箱中的中值为0。CpG岛内探针的位置由灰度区域显示,对应于12到40之间的局部CpG密度分数。(C类)Affymetrix Promoter 1.0R阵列查询的相同基因组区域上1000个碱基的箱子中的总读取计数。每行代表log2读取计数中值(RCpM表示每百万映射读取计数);将汇总归一化,使bin最低的中位数为0。