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2010年4月5日在线发布。 数字对象标识:10.1093/nar/gkq211

表7。

不同BLAT设置与SpliceMap的比较

BLAT(爆炸)拼接贴图
最大内含子大小(nt)750 000750 000400 000400 000400 000
瓷砖尺寸(nt)8–128–121212不适用
Minscore公司30305050不适用
不匹配11001
接头数量1111
侧翼序列的最小长度。10101010
标准拼接信号必修的必修的
总交叉口2 404 632345 195209 67351 325160 076
有效交叉点75 14761 67145 71441 173137 965
特异性3.12%17.87%21.80%80.22%86.19%

第一列对应于BLAT中的默认设置。SpliceMap在没有成对结束信息的情况下运行。