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《癌症研究》作者手稿;可在PMC 2011年4月1日获得。
以最终编辑形式发布为:
癌症研究,2010年4月1日;70(7): 2789–2798.
2010年3月23日在线发布。 数字对象标识:10.1158/0008-5472.CAN-09-3541

图3

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目标SNP预测的验证

()顶部,对于两个SNP,miRNA::mRNA相互作用显示为活动等位基因(绿色)或非活动等位蛋白(红色)突出显示。与预测的相互作用miRNA共同转染的pGL3-SNP等位基因对的荧光素酶报告分析,rs799917-BRCA1::miR-638基因(左面板)和rs334348-TGFBR1::miR-628-5p(右侧面板)。荧光素酶活性相对于加扰阴性对照表达(=1);值表示在六个重复中进行的至少三个独立实验的平均+/-标准偏差。根据miRanda预测,还显示了miRNA::mRNA的相互作用,活动等位基因(绿色)或非活动等位蛋白(红色)突出显示。(b条)BRCA1(左侧面板)和TGFBR1(右侧面板)的WBmiR-638型miR-628-5p分别在携带不同rs799917-BRCA1或rs334348-TGFBR1变体的细胞系中进行转染。基因型显示在免疫印迹的顶部;以下是报告的BRCA1和TGFBR1表达水平的标准化文丘里蛋白水平,并与每个细胞系的打乱阴性对照转染(=1)进行比较。(c(c))miRNA转染后分析的所有细胞中BRCA1和TGFBR1蛋白减少的平均值(分别为左面板和右面板),与每个基因型的打乱自然对照(=1)相比。

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