表2。
验证方法。
总结结果以验证纯合子缺失、基因型、LOH、拷贝数、断点和扩增。
使用的统计数据包括真阳性率和假阳性率(TPR、FPR)、正确呼叫的百分比和平均误差
数据类型
验证集
测试集
统计的
PICNIC公司
鸟套装
副本编号
天空
HCC1806(二倍体)
%正确
65.35%
59.83%
副本编号
天空
HCC1187(三倍体)
%正确
80.56%
52.55%
副本编号
天空
ZR-75-30(四倍体)
%正确
77.67%
6.43%
纯合子缺失
7种已知TSG的验证性PCR
102个细胞系
总生产成本
77.55% (0.15%)
59.18% (0.15%)
基因型
cDNA-hom基因分型
108个细胞系
%正确
96.45%
70.13%
洛
400个微卫星标记
755个细胞系
TPR(FPR)
58.20% (5.34%)
不适用
断点
天空
HCC1806(二倍体)
TPR公司
55.41%
56.76%
断点
天空
HCC1187(三倍体)
TPR公司
46.81%
48.94%
断点
天空
ZR-75-30(四倍体)
TPR公司
75.51%
63.27%
扩增子
GLO1扩增簇的qPCR
58个细胞系
平均误差
5.44%
11.51%