EM断层扫描显示OPA1-完整线粒体中的多个基质。（A和B）常规薄片的电子显微照片显示线粒体似乎包含多个基质室，线粒体位于A的右下方，线粒体位于B的左下方和右下方。（C和D）根据分段电子断层图计算的三维模型视图。两者都显示线粒体至少有两个独立的基质区室。外层膜呈半透明蓝色。（C）中的线粒体包含一个大的基质室，由一个呈白色的内界膜包围，其中一个大嵴呈红色，一个小嵴呈黄色，另外三个单独的膜室呈红色、洋红和绿色，与本节内的内界薄膜不相连；一个较小的单独矩阵隔间在顶部呈现为绿松石色。D中的线粒体包含一个较小的基质室，底部呈绿松石色，较大的基质室呈白色。后者包含另一个由红色和黄色的双层膜包围的大隔间。
