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PMC全文:
《蛋白质组研究杂志》作者手稿;PMC 2010年7月6日发布。
以最终编辑形式发布为:
蛋白质组研究杂志,2009年7月6日;8(7): 3737–3745.
数字对象标识:10.1021/pr801109k

表1

用于表示PSM的功能

前十个特征由SEQUEST计算。第3.6节中使用了特征18-37。

1XCorr公司计算光谱和观测光谱之间的相互关系
2ΔC类n个电流和次优XCorr之间的分数差
ΔC类c(c)L(左)当前和第五个最佳XCorr之间的分数差
4服务提供商肽与预测片段离子值的初步评分
5ln(rSp)基于Sp得分的比赛排名的自然对数
8质量观测质量[M+H]+
6ΔM计算质量与观测质量的差异
7abs(ΔM)计算质量与观测质量之差的绝对值
9离子压裂匹配的b和y离子的分数
10ln(数量)指定m/z范围内数据库肽数量的自然对数
11enzN公司布尔值:肽前面有酶(胰蛋白酶)位点吗?
12电子控制中心布尔值:肽有酶(胰蛋白酶)C末端吗?
13enzInt公司缺失的内部酶(胰蛋白酶)位点数量
14pepLen蛋白匹配肽的长度,以残基计
15–17充电1–3指示充电状态的三个布尔特征
18–37A、 …,是20种氨基酸的计数