表1
用于表示PSM的功能
前十个特征由SEQUEST计算。
第3.6节中使用了特征18-37。
1
XCorr公司
计算光谱和观测光谱之间的相互关系
2
Δ
C类
n个
电流和次优XCorr之间的分数差
三
Δ
C类
c(c)
L(左)
当前和第五个最佳XCorr之间的分数差
4
服务提供商
肽与预测片段离子值的初步评分
5
ln(rSp)
基于Sp得分的比赛排名的自然对数
8
质量
观测质量[M+H]
+
6
ΔM
计算质量与观测质量的差异
7
abs(ΔM)
计算质量和观测质量差异的绝对值
9
离子压裂
匹配的b和y离子的分数
10
ln(数量)
指定m/z范围内数据库肽数量的自然对数
11
enzN公司
布尔值:肽前面有酶(胰蛋白酶)位点吗?
12
enzC公司
布尔值:肽有酶(胰蛋白酶)C末端吗?
13
enzInt公司
缺失的内部酶(胰蛋白酶)位点数量
14
pepLen蛋白
匹配肽的长度,以残基计
15–17
充电1–3
指示充电状态的三个布尔特征
18–37
A、 …,是
20种氨基酸的计数