图1

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微阵列和qRT-PCR验证分析的研究设计和样本选择。从共120名参与表柔比星/泰索帝新佐剂试验的患者中,使用从25名新佐剂治疗前后患者中获得的79份样本进行微阵列分析(左边). 这些样本包括未分离的骨髓以及经过EpCAM或其他六种细胞表面抗原免疫选择的匹配骨髓样本。对于通过EpCAM免疫选择富集的样本,其中10个样本来自任何治疗前的患者,23个样本来自四个化疗周期后的患者,9个样本来自诊断后1y-16个月的患者,2个样本来自正常志愿者。对12例患者的双侧骨髓样本进行分析。在6例患者中,对新辅助治疗前后骨髓样本的表达谱进行了长期比较。在用六种抗体中的一种选择EpCAM后,来自两名患者的四份骨髓样本也进行了第二次浓缩。最后,对17个EpCAM选择的骨髓进行微阵列分析,但均未产生生物素化靶点(n个=7)或导致阵列上的探测集调用非常低(n个=10),表明没有从样品中捕获细胞。在任何治疗之前,从同一试验中的30名患者中选取50个样本作为独立组进行生物标记物验证(正确的).