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PMC全文:
自然方法。作者手稿;PMC 2009年7月1日发布。
以最终编辑形式发布为:
自然方法。2009年1月;6(1): 99–103.
2008年11月30日在线发布。 数字对象标识:10.1038/nmeth.1276

图3

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绘制纯合子缺失的染色体断点

(a-c公司)对齐序列的断点映射读取位置:()的UTRN公司位点;(b条)的PTPRD公司位点;或(c(c))的HS3T3A1型轨迹。每个点表示与NCI-H2347(蓝色)肿瘤细胞系或其匹配的正常NCI-BL2347(黑色)对齐的序列读取位置。垂直绿线表示通过对跨越每个纯合子缺失的PCR产物进行测序绘制的确切染色体断点。对于每个断点,我们报告预测断点位置和实际断点位置之间的差异。(d-f型)使用Affymetrix SNP 6.0阵列进行断点映射,其中每个点表示日志2数组probeset查询的copy-number比率:(d日)的UTRN公司位点;(e(电子))的PTPRD公司位点;或((f))的HS3T3A1型轨迹。日志的最小值2拷贝数比率设置为-7。蓝色水平线表示通过圆形二进制分割算法推断的副本编号段28.

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