Beclin1有一个BH3-样结构域，包含非典型苏氨酸和暴露的疏水补丁（A） M11–Beclin1（101–150）（左）和BCL-X的结构比较L（左）–不良综合体（右）。M11和BCL-XL（左）显示为曲面模型。木条中显示的Beclin1和BAD残基对应于五个BH3残基，它们对与抗凋亡BCL-2家族成员的相互作用至关重要[21]. 它们在两个结构物的BH3结合槽处占据同等位置。表面着色方案如下：Val、Leu、Ile、Tyr、Phe、Trp、Met和Ala为黄色；蓝色代表Lys、Arg和His；红色代表Glu和Asp；灰色代表其他氨基酸。
（B） 小鼠Beclin1的BH3-样结构域与各种BH3结构域的序列比较。保存的残留物以红色或粉红色列突出显示。箭头表示（A）中所示的五个BH3残留物。其中，Beclin1的Thr117（红色箭头）不保守。
（C） 序列对齐。Beclin1同源基因的BH3-样结构域对齐（mm，小鼠；hs，人类；xl，非洲爪蟾; 土耳其，红色Takifugu; dm、，黑腹果蝇; 供应链，酿酒酵母). 顶部的箭头表示BH3残留物，如（A）所示。这些残基在所有物种中都高度保守，除了Beclin1小鼠的Thr117，它只在脊椎动物中保守。结构中暴露的Beclin1保守疏水残基由底部的蓝色箭头指示。
（D） α-螺旋轮表示。与M11结合的Beclin1α-螺旋与与BCL-X结合的BADα-螺旋进行了比较L（左）Beclin1螺旋与BAD螺旋不同，在BH3结合槽的另一侧有一个疏水补丁（用星号表示）。
