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在40%体积分数的三氟乙醇中测定丙氨酸肽中氨基酸的螺旋传播和N-帽倾向。
摘要
在40%体积分数的三氟乙醇（40%TFE）中，测量了丙氨酸基肽中氨基酸的螺旋传播和N-帽倾向，以确定这种螺旋稳定溶剂是否均匀影响所有氨基酸。将40%TFE中的倾向与丙氨酸基肽在水中螺旋参数的修正值进行了比较。水中倾向的修正是重新定义封顶统计权重和评估螺旋形核常数的结果，其中N封顶明确包含在螺旋线圈模型中。相对于水，所有氨基酸在40%TFE中的繁殖倾向增加，但增加的幅度变化很大。在水中，所有β-支链氨基酸和β-取代氨基酸都是螺旋破胶剂。在40%的TFE中，非极性氨基酸的传播倾向大大增加，留下带电和中性极性的β-取代氨基酸作为螺旋破胶剂。甘氨酸和脯氨酸在这两种溶剂中都是强螺旋破胶剂。丙氨酸和其他非极性氨基酸在水中螺旋传播的自由能差（delta delta G）是侧链构象熵预测值的两倍，但40%TFE中的delta deltaG值接近侧链熵预测值。δ-δG对溶剂的依赖性表明了水在确定非极性氨基酸的相对螺旋倾向方面的特殊作用。N-cap倾向在40%TFE中收敛到一个共同值，这表明水的差异溶剂化有助于氨基酸显示的N-cap值的多样性。
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文章来自蛋白质科学：蛋白质学会的出版物由以下人员提供蛋白质学会
