图6

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利用全基因组拼接阵列鉴定Ntera2细胞KAP1靶点

(A) ●●●●。显示了包含ZNF基因簇的19号染色体(和一个200-kb亚区)上的KAP1结合模式。染色体位置(Mb)显示在x轴上。黑条表示ZNF433的转录区,灰条表示其他转录区(ZNF样转录物)。

(B) 使用KAP1扩增子的单独生物复制品对六个KAP1结合位点进行PCR分析。4个KAP1结合位点位于19号染色体上ZNF基因的转录区(ZNF554、ZNF426、ZNF333和ZNF433),2个KAP1-结合位点位于7号染色体(ZNF479和ZNF679)上ZNF-基因TSS的100kb以上。第8号染色体的基因间区域被用作KAP1结合缺失的对照。与总染色质DNA相比,KAP1和H3me3K9富集;IgG扩增子作为阴性对照进行分析。