表1

LX-1和LX-2细胞系与原代肝星状细胞(HSC)的差异基因表达:基因在LX-1与LX-2中表达相似,但与原代HSC的差异表达

NM_014501型泛素载体蛋白(E2-EPF)
NM_001316染色体分离1(CSE1L)
NM_005496号染色体相关多肽C(CAP-C)
NM_006342号转化,含有蛋白3的酸性卷曲线圈
NM_014791号母胎亮氨酸拉链激酶
NM_000358号转化生长因子β诱导(TGFBI)
NM_004221号自然杀伤细胞转录物4(NK4)
NM_001786号细胞分裂周期2(CDC2)
NM_003752真核翻译起始因子3,亚基8
NM_014390EBNA-2协同活化剂
NM_001168号杆状病毒IAP重复序列含有5(survivin)(BIRC5)
NM_003258号胸苷激酶1(TK1)
NM_018131号未知
NM_031299未知
AK026920公司未知
纳米_000389细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(第21页,CIP1)
纳米_000428潜在转化生长因子β结合蛋白2(LTBP2)
NM_002206整合素,α7(ITGA7)

如方法部分所述,对LX-1细胞与原代HSC以及LX-2细胞与原发HSC进行DNA微阵列分析。使用SNOMAD(微阵列数据的标准化和非标准化)基因表达数据分析工具对所得数据集进行标准化和成对比较,该工具可在http://pevsnerlab.kennedykrieger.org/smograminput.html.12z评分>5或⩽5且表达率大于5倍的基因被视为差异表达。列出了与原代HSC相比在细胞系中差异表达的基因选择(上调基因(↑);下调基因(↓))。名称(“NM_”)指GenBank登录号。