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| 状态 |
2019年1月15日公开 |
| 职务 |
L1N1：脊髓 |
| 样品类型 |
SRA公司 |
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| 源名称 |
脊髓
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| 有机体 |
褐家鼠 |
| 特点 |
菌株：Sprague Dawley
组织：上脊髓
组：伤后23天不训练
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| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
取出脊髓，在液氮中快速冷冻，然后收获RNA。
库是根据CEL-Seq2协议构建的，并在Illumina HiSeq1500平台上进行准备。
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| 图书馆战略 |
RNA-Seq号 |
| 库源 |
转录组学的 |
| 库选择 |
cDNA |
| 仪器型号 |
Illumina HiSeq 1500公司 |
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| 数据处理 |
使用HISAT2（2.0.4版）将原始序列读数与大鼠参考基因组（Rnor_6.0）对齐。
使用HTSeq（版本0.6.0）执行读取计数，以便删除UMI重复项。
基因组构建：Rnor_6.0
补充文件_format_and_content:txt文件包含UMI计数矩阵。
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| 提交日期 |
2018年5月31日 |
| 上次更新日期 |
2019年1月15日 |
| 联系人姓名 |
大川康之 |
| 电子邮件 |
yohkawa@biorg.kyushu-u.ac.jp
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| 组织名称 |
生物调节医学研究所
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| 门诊化验室 |
转录组学司
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| 街道地址 |
3-1-1迈达西
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| 西蒂 |
福冈 |
| 邮政编码 |
8128582 |
| 国家 |
日本 |
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| 平台ID |
GPL18404公司 |
| 系列（1） |
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| 关系 |
| 生物样品 |
SAMN09288702号 |
| SRA公司 |
SRX4167849型 |
