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状态 |
2015年1月15日公开 |
职务 |
3_萨斯克罗法 |
样品类型 |
SRA公司 |
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源名称 |
皮下脂肪组织
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有机体 |
苏斯克罗法 |
特点 |
组织:皮下脂肪 biologial_state:低 性别:f
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提取的分子 |
总核糖核酸 |
提取协议 |
Rneasy脂质迷你套件 TruSeq RNA样品制备(Illumina)
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图书馆战略 |
RNA-Seq号 |
库源 |
转录组学的 |
库选择 |
cDNA |
仪器型号 |
Illumina HiSeq 2500公司 |
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数据处理 |
对齐:STAR 过滤:SAM标志1792(非主要校准,读取未通过平台/供应商质量检查,读取为PCR或光学副本) 读取计数:HTSeq 库大小因子估计:DESeq 读数标准化:voom(limma),样本性别校正 表达式小于5的读取筛选 基因组构建:SScrofa10.2.72 Supplementary_files_forma_and_content:以逗号分隔的文件,包含原始计数和标准化计数
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提交日期 |
2014年9月9日 |
上次更新日期 |
2019年5月15日 |
联系人姓名 |
哈贾·N·卡达尔米丁 |
电子邮件 |
hajak@dtu.dk
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组织名称 |
丹麦技术大学
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部门 |
应用数学与计算机科学系
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门诊化验室 |
定量基因组学、生物信息学和计算生物学(QBC)小组
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街道地址 |
Richard Petersens Plads,324号楼
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西蒂 |
康根斯·林比 |
邮政编码 |
2800 |
国家 |
丹麦 |
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平台ID |
GPL19176型 |
系列(1) |
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关系 |
SRA公司 |
SRX698201型 |
生物样品 |
SAMN03031514号 |