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状态 |
2024年6月12日公开 |
职务 |
勃起功能正常大鼠海绵体的空间转录组测序 |
有机体 |
褐家鼠 |
实验类型 |
其他
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总结 |
海绵体微环境的组成和细胞异质性已经得到表征,但在分子水平上的空间异质性和物种之间的进化差异尚未探索。在本研究中,我们整合了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组测序,以全面绘制正常和疾病条件下人类和大鼠CC的空间细胞景观。我们根据海绵状动脉、果胶隔和白膜等特殊结构对CC进行了分区,并描述了不同区域细胞组成和信号网络的空间异质性。此外,我们观察到人类和大鼠之间内皮细胞(EC)、平滑肌细胞(SMC)和成纤维细胞(FB)的细胞亚型和标记基因比例的差异。虽然在人类和大鼠之间,翻译等基本生物过程中涉及的许多信号相对保守,但它们在炎症反应等途径中表现出显著的物种差异。基于FB生态位分析,我们还发现机械力信号在CC内具有显著的空间异质性,并与不同FB亚型的空间分布相关。体外,软质和硬质细胞外基质(ECM)分别诱导FB分化为APO+FB和COMP+FB亚型,并重新编程其脂质代谢。总之,我们的研究在单细胞水平上提供了一个具有高空间分辨率的CC跨物种和生理-病理转录图谱,有助于进一步了解阴茎勃起的分子解剖和调控。
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总体设计 |
对功能正常的大鼠CC组织的空间转录组进行组织切片和冠状切片。
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缺少引文 |
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生物项目 |
PRJNA1086026项目 |
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提交日期 |
2024年3月13日 |
上次更新日期 |
2024年6月13日 |
联系人姓名 |
赵良玉 |
电子邮件 |
zhaoly37@mail.sysu.edu.cn
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电话 |
+86 18801902577
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组织名称 |
上海交通大学医学院中山大学附属第五医院
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街道地址 |
中国珠海市梅花路52号
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西蒂 |
珠海 |
省/自治区 |
广东 |
邮政编码 |
519000 |
国家 |
中国 |
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平台(1) |
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样品(1) |
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