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GSE137293系列 GSE137293的查询数据集
状态 2020年4月27日公开
职务 幼猪心脏缺血/再灌注损伤后的RNA-seq分析。
有机体 苏斯克罗法
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
总结 这项研究是一项大型研究的一部分,该研究评估了小猪对心脏缺血/再灌注(IR)损伤的反应。对断奶后(1个月)的猪采用轻度心脏损伤方法(IR),以评估幼年大型哺乳动物短暂缺血损伤后的再生修复。雌性和雄性猪在出生后第二天(P)30只,通过阻断左前降支再灌注(IR)或假手术,使心脏缺血(1小时)。缺血2小时后循环心肌肌钙蛋白I增加,表明IR猪发生心肌损伤。此外,缺血2小时后心脏射血分数(EF)显著降低,EF降低持续至4周研究终点。组织学证明,在2个月龄的多核CMs中,无论是半手术猪还是IR猪,都存在CM细胞循环的证据。IR后,在IR后4周观察到损伤附近心外膜区域的局部瘢痕形成和炎症。发现心脏功能和胶原沉积的性别差异,突出了在心脏损伤研究中代表两性的重要性。总之,我们的结果描述了一种有效的新型1月龄猪心脏损伤模型,当时CM仍在循环。然而,受IR影响的猪表现出心脏功能持续下降,并形成局部小疤痕,炎症加剧。总之,这些数据表明,1个月大的猪在短暂IR损伤后,心肌不再生,而是形成疤痕。
 
总体设计 对16个样本的心肌组织总RNA进行RNA-seq分析。本研究使用了8只猪(4只假手术,4只缺血/再灌注(IR))。每头猪有2个样本送去分析,1个来自疤痕区,1个来自损伤部位的边界区。雄性和雌性猪都有代表。
 
贡献者 Agnew EJ公司,Velayutham北部,Ortiz总经理,Alfieri CM公司,摩尔五世,索具KW,贝克RS,吉布森A,Ponny SR公司,Alsaied T公司,扎法尔F,Yutzey KE公司
引文 31861331
提交日期 2019年9月11日
上次更新日期 2020年4月27日
联系人姓名 凯瑟琳·尤兹
电子邮件 katherine.yutzey@cchmc.org
电话 513-636-8340
组织名称 Cinicnnati儿童医院医疗中心
部门 分子心血管生物学系
街道地址 阿尔伯特·萨宾路240号
西蒂 辛尼卡蒂
省/自治区
邮政编码 45229
国家 美国
 
平台(2)
GPL19176型 Illumina HiSeq 2500(Sus scrofa)
GPL26351型 Illumina NovaSeq 6000(Sus scrofa)
样品(16)
GSM4074795标准 猪2_疤痕
GSM4074796标准 Pig2_边框
GSM4074797标准 猪4疤痕
关系
SRA公司 SRP221400型
生物项目 项目编号:165030

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