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状态 |
2020年5月21日公开 |
职务 |
亚基因猪心肌组织的RNA-seq数据 |
有机体 |
苏斯克罗法 |
实验类型 |
通过高通量测序进行表达谱分析
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总结 |
心内膜心肌活检(EMB)是诊断几种心脏病的金标准,但其应用受到相对较低的诊断率和严重并发症风险的限制。为了解决这一问题,我们开发了一种外径为0.4 mm的血管内显微活检(micro-EMB)设备,以最大限度地减少操作风险、采样创伤并提高采样特异性。我们对产生的亚毫米级组织和对照组进行了RNA-seq。将Micro-EMB与传统EMB对照组以及血液和骨骼肌等阴性对照组的基因表达特征进行比较。
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总体设计 |
来自5头不同个体猪的32个显微活检样本,其中20个样本在原始心脏(基线)上采集,12个样本在随访一周后采集。来自2种不同动物的10个心脏控制样本,其中6个基线和4个随访。来自2只不同动物的6份基线血液样本。基线检查时,从2只不同的动物身上采集6块骨骼肌样本。
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贡献者 |
Chireh A公司,格兰克维斯特R,霍尔明S |
引文 |
32415191 |
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提交日期 |
2019年1月8日 |
上次更新日期 |
2020年5月21日 |
联系人姓名 |
斯塔凡·霍尔明 |
组织名称 |
卡罗林斯卡学院
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街道地址 |
Visionsgatan 4,J5:20
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西蒂 |
索尔纳 |
省/自治区 |
非美国/加拿大 |
邮政编码 |
17164 |
国家 |
瑞典 |
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平台(1) |
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样品(54)
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关系 |
生物项目 |
PRJNA513475型 |
SRA公司 |
SRP176621号文件 |