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GSE124783系列 查询GSE124783的数据集
状态 2020年5月21日公开
职务 亚基因猪心肌组织的RNA-seq数据
有机体 苏斯克罗法
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
总结 心内膜心肌活检(EMB)是诊断几种心脏病的金标准,但其应用受到相对较低的诊断率和严重并发症风险的限制。为了解决这一问题,我们开发了一种外径为0.4 mm的血管内显微活检(micro-EMB)设备,以最大限度地减少操作风险、采样创伤并提高采样特异性。我们对产生的亚毫米级组织和对照组进行了RNA-seq。将Micro-EMB与传统EMB对照组以及血液和骨骼肌等阴性对照组的基因表达特征进行比较。
 
总体设计 来自5头不同个体猪的32个显微活检样本,其中20个样本在原始心脏(基线)上采集,12个样本在随访一周后采集。来自2种不同动物的10个心脏控制样本,其中6个基线和4个随访。来自2只不同动物的6份基线血液样本。基线检查时,从2只不同的动物身上采集6块骨骼肌样本。
 
贡献者 Chireh A公司,格兰克维斯特R,霍尔明S
引文 32415191
提交日期 2019年1月8日
上次更新日期 2020年5月21日
联系人姓名 斯塔凡·霍尔明
组织名称 卡罗林斯卡学院
街道地址 Visionsgatan 4,J5:20
西蒂 索尔纳
省/自治区 非美国/加拿大
邮政编码 17164
国家 瑞典
 
平台(1)
GPL19176型 Illumina HiSeq 2500(Sus scrofa)
样品(54)
GSM3553966标准 1
GSM3553967标准
GSM3553968标准 4
关系
生物项目 PRJNA513475型
SRA公司 SRP176621号文件

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