各种内源性逆转录病毒（ERV）和传染性逆转录病毒（包括埃博拉病毒和人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1））跨膜亚单位的七肽重复序列1-七肽重复序列2区（胞外域）
该结构域超家族跨越了各种内源性逆转录病毒（ERV）和感染性逆转录酶病毒（包括埃博拉病毒gp2、Rous肉瘤病毒gp37、人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）gp41）的糖蛋白/跨膜亚基的七肽重复序列，以及各种ERV的包膜蛋白。在埃博拉病毒和RSV的HR1-HR2区，两个重复序列之间的连接区包括CKS17样免疫抑制区和CX6C基序，后者形成亚单位内二硫键；MMTV、HIV-1、HERV-K内源性逆转录病毒及其相关序列缺乏典型的CSK17-like序列和CX6C基序。HR1-HR2区域的N末端是融合肽（FP），C末端是膜跨区（MSR）。病毒感染包括形成一个三螺旋结构（三个HR1螺旋，由三个HR2螺旋支撑，呈反平行方向）。在这种结构中，FP（插入宿主细胞膜）和MSR（插入病毒膜）非常接近。ERV可能起源于由活性逆转录病毒引起的古代细菌系感染。一些现代ERV，即那些整合到宿主基因组后物种形成中的ERV，具有当前活跃的外源性对应物，如雅格西克羊逆转录病毒（JSRV）、猫白血病病毒（FeLV）和禽白血病病毒（ALV）。一些ERV在宿主中发挥特殊作用，包括胎盘发育、保护宿主免受相关致病性和外源性逆转录病毒的感染以及基因组可塑性。属于该超家族的人类ERV（HERV）包括Syncytin-1（HERV-W_c7q21.2/ERVWE1）和Syncytin-2（HERV-FRD_6p24.1），它们在胎盘中表达，是融合性的，尽管它们具有不同的融合细胞特异性。Syncytin-2具有免疫抑制作用，但Syncytin-1没有；其免疫抑制结构域可以保护胎儿免受母亲免疫系统的影响。Syncytin-1可能参与胎盘滋养层细胞的形成；它还与癌细胞与宿主细胞之间、癌细胞之间的细胞融合以及人类破骨细胞融合有关。该超家族还包含人类HERV-R_c7q21.2（ERV-3），该病毒也在胎盘中表达，但不是融合性的，具有免疫抑制结构域，但缺乏融合肽。目前尚不清楚ERV-3是否具有关键的生物学作用。该超家族中包括来自家养绵羊的ERV，这些ERV与羊传染性肺癌病原体JSRV有关；例如，enJSRV-26保留了完整的基因组。这些内源性JSRV保护绵羊免受JSRV感染，并且是绵羊胎盘发育所必需的。
