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病毒名称

2021年11月。

提交给GenBank时选择病毒或噬菌体名称的建议。

以下文本包含在提交给GenBank时为新噬菌体或病毒选择名称的建议。它由两部分组成。第一部分广泛讨论了在为尚未被ICTV正式识别的病毒或噬菌体选择名称时的良好命名原则，而第二部分专门讨论了宏基因组病毒和噬菌体。

提交给GenBank时选择病毒名称的一般建议

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为新噬菌体或病毒选择名称时，请首先检查该名称是否已在GenBank或ICTV中使用。不应将预先存在的名称用于不相关的新病毒。同样，建议新病毒的名称不应通过单个连字符或其他标点符号与现有名称不同，因为如果已经存在另一个名为“Lizard virus XYZ17”的病毒，则类似“Lizaard virus XXZ-17”的名称可能会导致混淆。

如果不需要特定的名称，则可以使用基于有效的ICTV分类单元名称的sp.名称，例如“Sapovirus sp.”。然而，如果需要唯一的名称，建议避免使用仅由宿主或区域名称和分类单元名称组成的名称。随着时间的推移，像“鼠环病毒”这样的名字可能会包括几个刚好在小鼠体内发现的不相关的环病毒。添加一个数字，如“蜥蜴细小病毒1”，可以增加更多的特异性，但如果蜥蜴体内存在不止一种细小病毒，它也可能变得模棱两可。另一方面，具有复杂唯一标识符的名称，如“蜥蜴病毒XYZ17”，很可能会被无意中复制。

请避免在病毒名称中使用“like”一词。如果你不确定你的病毒是否属于Ourmiavirus属，你可以使用下一个更正式的分类单元名称，例如“Botourmiaviridae XY17”，而不是称其为“Ourmia-like virus XY17”。此外，避免在病毒名称中使用“unclassified”一词。例如，不要将其命名为“Sisal-associated Unclassified virus A”，而应将其命名成“Sisal associate virus A（Sisal-Associate未分类病毒A）”，它将在GenBank分类数据库中的未分类病毒中进行分类。

对于噬菌体名称，ICTV标准名称格式为“[宿主属]噬菌体[ID]”。噬菌体名称中不包括细菌宿主物种的特异性上皮，例如“大肠杆菌噬菌体CBA120”，而不是“大肠杆菌巨噬细胞CBA120。”。如果宿主细菌的身份未知，噬菌体名称可以仅由单词“噬菌体”和唯一标识符组成（例如“噬菌器LM4”）。细菌病毒名称中“病毒”一词的使用是为国际病毒分类委员会（ICTV）创建和认可并在病毒元数据资源（VMR）中发布的细菌病毒物种名称保留的。对于非ICTV名称，应使用“噬菌体”一词。

除了病毒有机体名称之外，还可以在GenBank记录的/隔离限定符上提供识别信息，并且可以将各种实验室名称、地点、日期、主机名或人名或缩写组合成一个唯一的字符串，例如/isolate=“bat/Berlin/XYZ-58/2021”。然而，请注意，仅位置信息（例如马里兰州）并不能提供有意义的隔离限定符。相反，应在/country限定符上填写位置信息，例如/country=“USA:Maryland”。

为GenBank提交的宏基因组病毒和噬菌体命名建议

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宏基因组集合中的序列可以以生物体名称格式“Taxon sp.”提交给GenBank，其中Taxon是提交者可以安全识别其序列的正式ICTV名称排名属或更高的属。例如“Sapovirus sp.”、“Siphoviridae sp.”或“Cressdnaviricota sp.”。元基因组病毒和噬菌体也可以有单独的名称，特别推荐用于具有医学重要性的病毒、出版物中使用的唯一名称或其他具有单独特征的病毒。

腕足类分类

苔藓

最近，根据Buck和Goffinet（2000）的分类，对苔藓（Musci）进行了重组，以更准确地反映我们目前对苔藓系统发育的理解。新分类的主要特征包括：苔藓分支上升为苔藓植物门（不要与“苔藓类”混淆，指由苔藓、苔类和花生菌组成的副系群），以及对三个新的主要分支的识别，即Andreaeobryopsida、Takakiopsida和Polytrichopsida，它们与Bryposida具有同等的等级，Sphagnopsida和Andreaeopsida。Vitt（1984）确认的15个苔藓亚目大部分被折叠成苔藓纲的四个亚纲（苔藓科、双壳类、双壳科和蚤科）。

引用的参考文献：

Takifugu和Fugu

什么是口中肠？

最近，真鲷（Euteleostomi）的名称被纳入了单系类群的分类数据库中，该类群包括真鲷类（“鳞鳍鱼类”和四足类）和裸鳍鱼类（“裸鳍鱼”）。该组以前在数据库中被命名为“骨质脊椎动物”。

此前，骨鱼类的名称也被用于单系真骨动物或“骨脊椎动物”然而，骨鱼类的名称传统上被用于“多骨鱼类”，这是一个由放线鱼和沙棘鱼减去四足类组成的副系群。因此，将骨鱼类这一名称应用于所有肉鱼和放线鱼的单系群并不被广泛接受。Euteleostomi这个名字最初是作为一个替代品提出的，以克服这些问题，在：

鲨鱼和鳐鱼

分类数据库中的弹性鳃类（鲨鱼和鳐鱼）部分已经修订。鳃亚纲分为两个主要分支：鳃亚科（包括鳃亚目和异齿亚科）和鳞亚科。Hypnosqualea包括Squatiniformes、Pristiophoriformes和Batoidea，Batoidea之前被命名为Rajiformes（Rajiformes目前仅限于Rajidae〔slites〕）。蝙蝠侠的相互关系已经被修正，尽管它们仍然是谜一样的。因此，这里提出的分类和系统发育并不是一个确定的。然而，它旨在提供一个实用且信息丰富的综合假设，这些假设是在以下最新的埃尔萨莫分支相互关系概述中提出的：