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推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X2[小家鼠]

蛋白质分类

ASXH和PHD_3结构域蛋白(域体系结构ID 10523827)

含蛋白质结构域HARE-HTH、ASXH、PHA03247和PHD_3

图形摘要

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姓名 加入 描述 间隔 E值
ASXH公司 pfam13919型
Asx同源结构域;具有特征性LXXLL基序的保守α螺旋结构域。这个。。。
261-382 1.81e-38页

Asx同源结构域;具有特征性LXXLL基序的保守α螺旋结构域。LXXLL基序在多种转录因子、辅活化因子和辅抑制因子中检测到,并参与调节它们之间的相互作用。ASXH结构域存在于动物、真菌和植物中,预计在调节转录因子和染色质相关复合物之间的接触方面发挥作用。在果蝇Asx和人类ASXL1中,ASXH结构域被预测会介导与Calypso和BAP1双歧化酶(DUBs)的相互作用,这两种酶进一步属于DUBs的UCHL5/UCH37分支。


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博士_3 pfam13922型
转录增强子的PHD结构域,Asx;这是附加…上的DNA绑定域。。。
1355-1415 5.13e-28条

转录增强子的PHD结构域,Asx;这是额外性梳样1蛋白上的DNA结合域。Asx蛋白在果蝇中显示双向同源表型时作为三疣和多疣的增强子,这表明它是维持Hox基因激活和沉默所必需的。Asx是正常成人造血所必需的,其功能取决于其细胞环境。


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Pssm-ID:316444  Cd长度:68个比特分数:108.06  E值:第5.13页至第28页
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线束-HTH pfam05066型
HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域;一个有翼螺旋-转螺旋结构域存在于。。。
11-82 9.35e-19日

HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域;植物HB1、脊椎动物ASXL、幽门螺杆菌限制性内切酶HpyAIII(HgrA)、革兰氏阳性细菌的RNA聚合酶δ亚基(RpoE)和几种限制性内切酶中存在一个有翼的螺旋-转螺旋结构域。该结构域的区别在于在螺旋-3和之前的保守螺旋之间存在一个保守的单圈螺旋。它在具有广泛基因体甲基化的真核生物物种中的多样结构暗示着染色质功能。含有HARE-HTH的ASXL与甲基胞嘧啶羟基化Tet2蛋白的遗传相互作用表明该结构域在区分DNA修饰序列(如hmC)中起作用。细菌版本包括与多种限制性内切酶的融合,以及在检测修饰DNA时可能发挥类似作用的DNA糖基化酶。HARE-HTH结构域的某些细菌版本显示与RNA聚合酶α亚单位的螺旋-发夹-螺旋结构域以及西格玛因子区域3和4中发现的HTH结构域融合。这些版本被预测为RNA聚合酶与转录起始位点结合的新抑制剂,类似于芽孢杆菌δ蛋白。


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PHA03247超级系列 第33720条
大表皮蛋白UL36;临时的
528-972 1.19e-07日

大表皮蛋白UL36;临时的


检测到与超家族成员的实际对齐PHA03247型:

Pssm-ID:223021[多域]Cd长度:3151  比特分数:56.87  E值:1.19e-07日
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姓名 加入 描述 间隔 E值
ASXH公司 pfam13919型
Asx同源结构域;具有特征性LXXLL基序的保守α螺旋结构域。这个。。。
261-382 1.81e-38页

Asx同源结构域;具有特征性LXXLL基序的保守α螺旋结构域。LXXLL基序在多种转录因子、辅活化因子和辅抑制因子中检测到,并参与调节它们之间的相互作用。ASXH结构域存在于动物、真菌和植物中,预计在调节转录因子和染色质相关复合物之间的接触方面发挥作用。在果蝇Asx和人类ASXL1中,ASXH结构域被预测会介导与Calypso和BAP1双歧化酶(DUBs)的相互作用,这两种酶进一步属于DUBs的UCHL5/UCH37分支。


Pssm-ID:464041  Cd长度:129  比特分数:140.12  E值:1.81e-38页
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博士_3 pfam13922型
转录增强子的PHD结构域,Asx;这是附加…上的DNA绑定域。。。
1355-1415 第5.13页至第28页

转录增强子的PHD结构域,Asx;这是额外的性梳样1蛋白上的DNA结合结构域。Asx蛋白在果蝇中显示双向同源表型时作为三疣和多疣的增强子,这表明它是维持Hox基因激活和沉默所必需的。Asx是正常成人造血所必需的,其功能取决于其细胞环境。


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线束-HTH pfam05066型
HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域;一个有翼螺旋-转螺旋结构域存在于。。。
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HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域;植物HB1、脊椎动物ASXL、幽门螺杆菌限制性内切酶HpyAIII(HgrA)、革兰氏阳性细菌的RNA聚合酶δ亚基(RpoE)和几种限制性内切酶中存在一个有翼的螺旋-转螺旋结构域。该结构域的区别在于在螺旋-3和之前的保守螺旋之间存在一个保守的单圈螺旋。它在具有广泛基因体甲基化的真核生物物种中的多样结构暗示着染色质功能。含有HARE-HTH的ASXL与甲基胞嘧啶羟基化Tet2蛋白的遗传相互作用表明该结构域在区分DNA修饰序列(如hmC)中起作用。细菌版本包括与多种限制性内切酶的融合,以及在检测修饰DNA时可能发挥类似作用的DNA糖基化酶。HARE-HTH结构域的某些细菌版本显示与RNA聚合酶α亚单位的螺旋-发夹-螺旋结构域以及西格玛因子区域3和4中发现的HTH结构域融合。这些版本被预测为RNA聚合酶与转录起始位点结合的新抑制剂,类似于芽孢杆菌δ蛋白。


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大表皮蛋白UL36;临时的
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大表皮蛋白UL36;临时的


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抄送:PHA03247 2922qpp公司P(P)PPQPQPP项目P(P)PPPPRPQP项目P(P)LAP公司TDPAG公司A类通用电气公司P(P)蒸汽发生器A类V(V)P(P)PWL公司G公司美国铝业公司副总裁GRVAV公司P(P)RFRVPQPAPSRE公司 2987
疱疹_BLLF1 pfam05109型
疱疹病毒主要外膜糖蛋白(BLLF1);这个家族由BLLF1。。。
719-936 6.41至03

疱疹病毒主要外膜糖蛋白(BLLF1);该家族由BLLF1病毒晚期糖蛋白组成,也称为gp350/220。它是疱疹病毒病毒包膜中表达最丰富的糖蛋白,是刺激体内产生中和抗体的主要抗原。


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吉568978066  719P(P)V(V)装货单N个公斤PTL公司ELA公司G公司TGSRGG公司重新L(左)P(P)CGPQPE公司TN公司MPGQ公司A类质量策划(QP)-P(P)GI公司S公司G公司A类QL公司qq时间SV公司P(P)G公司AS公司新加坡黄金协会CTSV公司P(P)L(左)P(P)AHIEI公司-S公司 796
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抄送:pfam05109 500E类S公司灵魂P(P)DMTSP公司SAVTT公司P(P)第页NATS公司P(P)TPAVTTPTPNA公司S公司P(P)L(左)GKTSP公司S公司---A类及物动词PT公司P(P)N个A类S公司PTP公司A类vtt(录像机)P(P)P(P)N个A类提示lgk公司 576
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吉568978066  870A类P(P)APLDM公司不锈钢P(P)及物动词ASLEKLPV公司性能确认ISG公司ATST公司G公司树液不锈钢S公司TL公司P(P)原子吸收光谱S公司LKTPG公司TSA(交通安全管理局)NMN公司G公司乘客信息系统TSSS公司 936
抄送:pfam05109 577S公司P(P)TSAVT公司PT公司P(P)不适用SPTVGETS公司性能确认ANT公司国家税务局G公司---通用技术S公司装货单P(P)可变气门正时(VVT)S公司PPKNA公司TSA(交通安全管理局)VTT公司G公司QHNI公司TSSS公司 640
 
姓名 加入 描述 间隔 E值
ASXH公司 pfam13919型
Asx同源结构域;具有特征性LXXLL基序的保守α螺旋结构域。这个。。。
261-382 1.81e-38页

Asx同源结构域;具有特征性LXXLL基序的保守α螺旋结构域。LXXLL基序在多种转录因子、辅活化因子和辅抑制因子中检测到,并参与调节它们之间的相互作用。ASXH结构域存在于动物、真菌和植物中,预计在调节转录因子和染色质相关复合物之间的接触方面发挥作用。在果蝇Asx和人类ASXL1中,ASXH结构域被预测会介导与Calypso和BAP1双歧化酶(DUBs)的相互作用,这两种酶进一步属于DUBs的UCHL5/UCH37分支。


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吉568978066  261R(右)M(M)K(K)RTKC公司A类D类DVET公司P(P)D类S公司LVN公司TN公司LRAL公司NK公司HTFSV公司有限合伙人GDC公司QQ(QQ)R(右)陆上通信线L(左)低密度聚乙烯E类虚拟磁盘RQVG公司PD公司GLMKLN公司--G公司S公司美国铝业公司内夫时间A类A类 338
抄送:pfam13919 5A类K(K)K(K)GKWE公司A类E类有限责任公司P(P)K(K)S公司P(P)LVN公司广告LRAL公司L(左)NK公司AAWDC公司有限合伙人撒尿QQ(QQ)E类陆上通信线S公司有限责任合伙D类虚拟磁盘HILD公司PD公司TDDSRP(TDDSRP)P(P)S公司左后NNEFF公司右侧A类C类 84
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吉568978066  339QGWK公司E类R(右)L(左)S公司E类F类体育课MQVRIRQ公司E类IEK公司E类K(K)-K(K)VEL公司WKE公司卡塔尔金融中心FE公司纽约GQ公司 382
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博士_3 pfam13922型
转录增强子的PHD结构域,Asx;这是附加…上的DNA绑定域。。。
1355-1415 5.13e-28条

转录增强子的PHD结构域,Asx;这是额外性梳样1蛋白上的DNA结合域。Asx蛋白在果蝇中显示双向同源表型时作为三疣和多疣的增强子,这表明它是维持Hox基因激活和沉默所必需的。Asx是正常成人造血所必需的,其功能取决于其细胞环境。


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吉568978066  1355M(M)NP公司SSHG公司TIPV公司全氟辛烷磺酸N个S公司E类D类TP(转移定价)---------S公司KC公司Y(Y)CRL公司K(K)调幅感应电动机C类公斤CGAFCHDDCIG公司P(P)SKLCVSC公司低压 1415
抄送:pfam13922 1NP公司QQQQ(质量QQ)HPLL公司LAH公司--S公司G公司E类N个TP(转移定价)普涅塔塔N个KC公司A类CRL公司N个调幅不及物动词C类QQ(QQ)CGAFCHDDCIG公司A类SKLCVSC公司不及物动词 68
线束-HTH pfam05066型
HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域;一个有翼螺旋-转螺旋结构域存在于。。。
11-82 9.35e-19日

HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域;植物HB1、脊椎动物ASXL、幽门螺杆菌限制性内切酶HpyAIII(HgrA)、革兰氏阳性细菌的RNA聚合酶δ亚基(RpoE)和几种限制性内切酶中存在一个有翼的螺旋-转螺旋结构域。该结构域的区别在于在螺旋-3和之前的保守螺旋之间存在一个保守的单圈螺旋。它在具有广泛基因体甲基化的真核生物物种中的多样结构暗示着染色质功能。含有HARE-HTH的ASXL与甲基胞嘧啶羟基化Tet2蛋白的遗传相互作用表明该结构域在区分DNA修饰序列(如hmC)中起作用。细菌版本包括与多种限制性内切酶的融合,以及在检测修饰DNA时可能发挥类似作用的DNA糖基化酶。HARE-HTH结构域的某些细菌版本显示与RNA聚合酶α亚单位的螺旋-发夹-螺旋结构域以及西格玛因子区域3和4中发现的HTH结构域融合。这些版本被预测为RNA聚合酶与转录起始位点结合的新抑制剂,类似于芽孢杆菌δ蛋白。


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吉568978066  11R(右)华盛顿州欧洲账户管理局千吨VLE公司KYPN公司t吨P(P)MSH公司KEI公司LQV公司智商重新GL公司KEI公司新加坡时间P(P)L(左)A类C类L(左)N个A类M(M)L(左)H(H)国家统计局E类埃吉F类YK公司V(V)-PG公司马来西亚令吉G公司VYTL公司 82
邮编:pfam05066 1G公司LK语言欧洲账户管理局FQ公司VLE公司EEGR公司-P(P)低频KEI公司AEE公司智商EK公司GL公司ISL公司新加坡千吨P(P)E类A类L(左)A类A类L(左)Y(Y)DIK公司-E类数字用户线F类虚拟现实V(V)PG公司TF公司G公司轻轨开关 71
PHA03247型 PHA03247型
大表皮蛋白UL36;临时的
528-972 1.19e-07日

大表皮蛋白UL36;临时的


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吉568978066 528S公司KN(千牛)AG公司LQK公司P(P)IIK公司P(P)V(V)A类ea公司S公司P(P)液态氮PD公司MKM公司聚丙烯A类tvtdqiqeslk电视台R(右)KSSLTD公司E类E类A类时间S公司WEK(周)RP公司-------R(右)ITENRQHQQPFQVS项目 600
抄送:PHA03247 2545S公司AG公司DPP公司P(P)PLP公司P(P)A类A类--P(P)P(P)AA公司PD公司RSV公司聚丙烯P(P)-----------R(右)PAPRPS系统E类P(P)A类及物动词S公司风险调整比率RP公司dappqsa公司R(右)PRAPVDDRGDPRGP公司 2611
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吉568978066 601性能确认P(P)FLNRG公司D类右心室QVR千伏聚丙烯LKI公司P(P)VSRISPMLFSTSQVS公司P(P)RARF公司P(P)ISITS公司P(P)Y(Y)R(右)TGARTL公司A类DIKAK公司A类QLVKAQKAAAAAA公司AA公司A类 680
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吉568978066 681美国汽车协会S公司VGGTIPG公司P(P)G公司P(P)GGGQS公司P(P)重新格格RKIAGGGSAGSD公司P(P)VSTNGKG公司P(P)L(左)EL公司A类GTGSRGGTRELL公司P(P)C类普通合伙人-----P(P)E类NM公司P(P) 755
抄送:PHA03247 2690PTVG公司S公司长期服务水平协议P(P)P(P)P(P)PPTPE公司P(P)AP公司---HALVSATPLPPG公司P(P)AAARQAS公司P(P)A类L(左)PA公司A类PAPPAVPAGPAT公司P(P)G公司普通合伙人A类rparp(旋转木马)P(P)AG公司P(P) 2766
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吉568978066 756GQAQ公司聚丙烯地理信息系统A类QLQQTSSV公司P(P)TGLAS公司S公司GACT公司S公司V(V)P(P)L(左)P(P)AHIEISNSEKPNHK公司A类周转时间AASP公司CHLQD公司P(P)RS系列克雷克肌萎缩性脊髓侧索硬化症PT公司G公司聚丙烯L(左) 835
抄送:PHA03247 2767爸爸聚丙烯美国儿科学会A类GPPRRLTR公司P(P)AVASL公司S公司ESRE公司S公司L(左)P(P)S公司P(P)WDPADPAAVAVLAPAA公司A类LPP程序AASP公司AGPLP公司P(P)PT公司-----SAQ公司PT公司A类聚丙烯P(P) 2841
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吉568978066 836G公司ASTVYFVAD公司G公司V(V)E类P(P)KAGSNKNA公司P(P)KP公司S公司美国铝业公司阿拉斯加州TT公司阿帕--P(P)LDMTSS系统P(P)VTTA公司S公司L(左)E类KLPV公司P(P)QISGTATSTGS公司AP公司SSSTL公司-- 911
抄送:PHA03247 2842聚丙烯G公司PPPPSLPLG公司G公司S公司V(V)A类P(P)GGDVRRRP公司P(P)SR公司S公司PA公司阿拉斯加州PA公司阿帕快速成型P(P)VRRLAR公司P(P)AVSR公司S公司E类SFAL公司P(P)数据处理程序AP公司PPPQP公司质量保证 2921
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吉568978066 912---P(P)AASSLKT公司P(P)GTSANMNG公司P(P)情报、监视与侦察SSSIP公司A类NN公司P(P)--L(左)V(V)有限责任公司G公司杜兰特副总裁LEQIL公司P(P)KPLTKIEMKTVP公司 972
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疱疹_BLLF1 pfam05109型
疱疹病毒主要外膜糖蛋白(BLLF1);这个家族由BLLF1。。。
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疱疹病毒主要外膜糖蛋白(BLLF1);该家族由BLLF1病毒晚期糖蛋白组成,也称为gp350/220。它是疱疹病毒病毒包膜中表达最丰富的糖蛋白,是刺激体内产生中和抗体的主要抗原。


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吉568978066  797N个S公司EK公司P(P)NLHKA公司ATAAS公司P(P)C类-HLQD公司P(P)RSCRLEKALSP公司G公司P(P)P(P)L(左)ISGAS公司V(V)yfv公司A类DG公司价值工程P(P)K(K)A类G公司S公司NKN公司A类---P(P)K(K)P(P)S公司A类韩国--- 869
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吉568978066  870A类P(P)APLDM公司不锈钢P(P)及物动词ASLEKLPV公司性能确认国际标准化组织ATST公司G公司活力不锈钢S公司TL公司P(P)原子吸收光谱S公司LKTPG公司TSA(交通安全管理局)NMN公司G公司乘客信息系统TSSS公司 936
密码:pfam05109 577S公司P(P)TSAVT公司PT公司P(P)不适用SPTVGETS公司性能确认ANT公司国家税务局G公司---通用技术S公司装货单P(P)可变气门正时(VVT)S公司PPKNA公司TSA(交通安全管理局)VTT公司G公司QHNI公司TSSS公司 640
 
爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • 王杰等(2023),“2023年的保守域数据库”,核酸研究51(D) 公元384-388年。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”,核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”,核酸研究45(D) 2003年3月。
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