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波形蛋白

蛋白质分类

中间丝族蛋白(域体系结构ID 12057329)

中间丝族蛋白类似于结蛋白,结蛋白是一种肌肉特异性III型中间丝,对肌肉的正常结构和功能至关重要

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姓名 加入 描述 间隔 E值
长丝 pfam00038型
中间丝蛋白;
102-410 2.52e-132

中间丝蛋白;


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Pssm-ID:459643[多域]Cd长度:313  比特分数:384.66  E值:2.52e-132
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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
14-101 1.56e-18

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


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中间丝蛋白;


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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
14-101 1.56e-18

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


Pssm-ID:461414[多域]Cd长度:83  比特分数:80.13  E值:1.56e-18
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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
95-423 2.09e-12年

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:69.70  E值:2.09e-12年
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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
131-405 1.05e-11号机组

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:67.27  E值:1.05e-11号机组
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46 PHA02562型
核酸内切酶亚基;临时的
119-400 1.95e-05年

核酸内切酶亚基;临时的


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姓名 加入 描述 间隔 E值
长丝 pfam00038型
中间丝蛋白;
102-410 2.52e-132

中间丝蛋白;


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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
14-101 1.56e-18

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
95-423 2.09e-12年

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
131-405 1.05e-11号机组

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:67.27  E值:1.05e-11号机组
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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
137-412 4.76e-11号

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:65.46  E值:4.76e-11号
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线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。。。
132-465 3.35e-10

线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。功能未知。


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
95-348 2009年2月25日

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:59.95  E值:2009年2月25日
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合同编号4913 合同编号4913
未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];
150-405 1.39e-08年

未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];


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合同编号4913 合同编号4913
未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];
148-388 2007年4月37日

未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];


Pssm-ID:443941[多域]Cd长度:1089  比特分数:52.61  E值:2007年4月37日
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DUF4515型 pfam14988型
未知函数域(DUF4515);这种蛋白质家族存在于细菌和。。。
162-349 6.93e-07年

未知函数域(DUF4515);这种蛋白质家族存在于细菌和真核生物中。这个家族中的蛋白质长度通常在198到469个氨基酸之间。有两个完全保守的L残基可能在功能上很重要。


Pssm-ID:405647[多域]Cd长度:206  比特分数:49.77  E值:2007年9月3日
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邮编:pfam14988 171ELLQ公司L(左)智商电子TQ公司美国铝业公司埃克斯克LE公司NRKQRLK公司电子 198
SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
118-383 2007年9月9日

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:51.61  E值:2007年9月9日
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合同编号:TIGR02169 464最小二乘法K(K)Y(Y)EQELYD公司L(左)韩国电子伊德维克电子LSKLQ公司重新L(左) 492
环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
151-378 2006年12月23日

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


Pssm-ID:443969[多域]Cd长度:377  比特分数:50.53  E值:2006年12月23日
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抄送:COG4942  26电子A类电子低爆炸当量L(左)QQEIAE公司L(左)埃克尔A类ALKK公司电子埃卡L(左)LKQLAA型L(左)ERRIALARIRIRAL公司电子质量工程L(左)澳大利亚L(左)RAEL公司电子AQK公司电气工程师 105
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环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
179-416 1.28e-06

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


Pssm-ID:443969[多域]Cd长度:377  比特分数:50.53  E值:1.28电子-06
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吉110347570 411有限合伙人L(左)P(P) 416
抄送:COG4942  253GK公司有限合伙人W公司P(P) 258
SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
103-367 2006年2月22日

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:50.45  E值:2006年2月22日
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环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
98-365 2006年4月43日

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
101-388 6.04至06

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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口香糖C COG3206号机组
胞外多糖输出蛋白/结构域GumC/Wzc1[细胞壁/膜/包膜生物发生];
110-359 8月14日至06日

胞外多糖输出蛋白/结构域GumC/Wzc1[细胞壁/膜/包膜生物发生];


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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
104-341 1.28e-05

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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46 PHA02562型
核酸内切酶亚基;临时的
119-400 1.95e-05年

核酸内切酶亚基;临时的


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合同编号4913 合同编号4913
未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];
104-342 2008年2月5日

未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];


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吉110347570 251电子-----QHVQI公司D类M(M)D类VS公司关键性能指标TAA公司L(左)RDVRQQYESVAAKN公司L(左)电子A类电气工程师wyks公司K(K)F类AD公司L(左)SEANRNN公司--D类A类L(左)RQAKQESN公司电子YRRQV公司 323
抄送:COG4913  795A类fnrew公司帕埃塔D类L(左)D类AD公司----发射脱离系统L(左)PEYLLDRLEEDG公司L(左)P(P)电子Y(Y)电气工程师----R(右)F类韩国L(左)LNENSIEF公司va公司D类L(左)L(左)SKLRRAIR公司电子IKERI公司 866
250
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吉110347570 324QT公司L(左)tcevdalkgt公司N个电子SL公司电子R(右) 342
抄送:COG4913  867DP公司L(左)----------N个D类SL公司K(K)R(右) 875
氯丙酸 COG0542号机组
ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚单位ClpA[翻译后修饰,蛋白质。。。
152-242 3.55e-05号

ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚单位ClpA[翻译后修饰,蛋白质周转,伴侣];


Pssm-ID:440308[多域]Cd长度:836  比特分数:46.23  E值:3.55e-05年
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吉110347570 152电气工程师先生电致发光R(右)R(右)质量VDQL公司TND公司K(K)ARVEV公司电子R(右)D类--------N个L(左)AEDIMR公司L(左)R(右)电子K(K)L(左)q个电子EMLQ公司R(右)电子EAE公司装货单L(左)----SFRQDVDNASLARLD公司 219
抄送:COG0542  411电气工程师劳埃德电致发光电子R(右)RLE公司QL公司电子工程师K(K)EALKK公司电子D类埃斯费拉电子L(左)RDELAE公司L(左)电子电子电子L(左)-电子阿尔卡R(右)W公司EAE公司韩国L(左)ieei公司ELKEELEQRYGKIPE公司 489
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吉110347570 220LE公司RKVES公司L(左)电气工程师A类F类L(左)KK公司L(左)高清电气工程师 242
抄送:COG0542  490LE公司凯莱L(左)电子电气工程师L(左)A类电子L(左)AP公司L(左)左后电气工程师V(V) 512
CwlO1公司 COG3883公司
肽聚糖水解酶CwlO[功能。。。
181-385 2005年8月8日

肽聚糖水解酶CwlO的非特征化N-末端卷曲-卷曲结构域[功能未知];


Pssm-ID:443091[多域]Cd长度:379  比特分数:45.98  E值:2005年8月8日
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抄送:COG3883  157不良事件L(左)EALKAE公司LE公司AAKA公司电子L(左)电子质量保证局-电子QEALLAQLSAEEAAEAQLA公司电子LEAE公司L(左)美国原子能机构 210
CCDC158公司 pfam15921型
线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。。。
90-384 5.28e-05

线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。功能未知。


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吉110347570  358Y(Y)QD公司T型G公司R(右)LQD公司电子IQNM公司K(K)埃马尔勒电子Y(Y) 384
抄送:pfam15921 823C类QD公司R(右)量化宽松政策电子SVRL公司K(K)LQHTLDVK公司电子L(左) 849
Mplasa_alph_rch公司 钨极氩弧焊R04523
富螺旋支原体蛋白;这个家族的成员严格属于。。。
92-382 5.88e-05号

富螺旋支原体蛋白;这个家族的成员严格属于支原体物种的一个子集。成员平均长度为750个氨基酸,包括信号肽。序列被预测(Jpred 3)几乎完全是α螺旋的。这些序列具有很强的周期性(与长α螺旋结构一致)和低复杂性,富含D、E、N、Q和K。编码这些蛋白质的基因通常是串联的。功能未知。


Pssm-ID:275316[多域]Cd长度:745  比特分数:45.78  E值:5.88e-05号
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吉110347570  92英寸TE公司FK公司NT公司R(右)T型NEKVELQ公司电子L(左)N个DRFANYID公司K(K)虚拟现实基金低爆炸当量NK公司LLA公司电气工程师QLKG公司G公司堪萨斯州RLG公司分力------------------Y(Y)电子电气工程师 153
抄送:TIGR04523 244KT公司TE公司NT公司T型昆士兰州电子N个KIKKQLSE公司K(K)QKE公司低爆炸当量N个NK公司-KIK(基克)电气工程师KQLN公司L(左)堪萨斯州环境影响报告分力nnqkeqdwnkelkselkn公司电子KK公司 322
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吉110347570  154先生电子LRR公司虚拟磁盘-------L(左)TNDKARVEV公司电子研发N个莱迪姆雷克L(左)电子EMLQR公司电子EAESTL公司质量体系法国数字化视频光盘N个ASLARL公司DLE公司R(右)K(K)可变作用力转向(VES) 226
抄送:TIGR04523 323LE公司电子IQN公司nnkiisq公司L(左)NEQISQLKK公司电子书信电报N个SESENSEKQRE公司L(左)电子电子KQNEI公司电子KLKKEN公司质量体系YK公司EIK公司N个列斯琴DLE公司K(K)IQN公司 402
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吉110347570  297D类LS(负载感应)欧洲账户管理局N个RNNDA公司L(左)R(右)AKQ公司电子SNEYRRQVQT公司L(左)总费用电子德国船级社L(左)KGTNES公司L(左)ERQMREME公司电子N个---FSV公司电子AANYQDT公司希腊L(左)判定元件IQNMK公司 373
抄送:TIGR04523 472V(V)LS(负载感应)RSI公司N个KIKQN公司L(左)电子KQK公司电子LKSKEKELKK公司L(左)电子KKE公司L(左)EEKVKD公司L(左)TKKISSLK公司电子K(K)iek公司发射脱离系统电子KKEKESK公司标准偏差L(左)电子判定元件LNKDD公司 551

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吉110347570  374电子电子马勒电子 382
抄送:TIGR04523 552F类电子LKKENL公司电子 560
拉德50 钨极氩弧焊(TIGR00606)
rad50;这个家族中功能已知的所有蛋白质都参与重组。。。
104-466 2005年10月6日

rad50;该家族中功能已知的所有蛋白质都参与重组、重组修复和/或非同源末端连接。它们是具有MRE11同源物的核酸外切酶复合物的组成部分。该家族与细菌蛋白的SbcC家族有远亲关系。该家族基于JA Eisen的系统发育分析(1999年,斯坦福大学博士论文)。


Pssm-ID:129694[多域]Cd长度:1311  比特分数:45.81  E值:2005年10月6日
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吉110347570  104千伏ELQE公司LNDRFANYI公司----丹麦VRFL(VRFL)电子QQN公司K(K)伊利诺伊州--KGQ公司G公司KSRLG公司分力Y(Y)电子电子电子先生ELR公司RQVDQLTN公司D类灵魂R(右)车辆/车辆ERDN公司 177
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吉110347570  178洛杉矶电子D类imrlr公司电子K(K)L(左)QEEMLQR公司电气工程师AESTLQSFRQDVDNASLARL公司D类L(左)ERK公司船只QEEIAFLKK左侧D类电子工程师学会ELQAQI公司质量工程QHVQI公司D类 257
抄送:TIGR00606 767工业工程电子-----电子T型L(左)LGTIMPE公司电气工程师SAKVCLTDVTIMERFQMELK公司D类V(V)ERK公司IAQQAAKLQGSDL公司--D类实时电视QVNQEK公司质量工程KQHEL公司D类 839
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吉110347570  258医学博士VSK公司PD公司L(左)TAA公司L(左)远程虚拟现实是的(yesv)AAKN公司L(左)QEAEEWY公司堪萨斯州KFADLSEAN公司R(右)N个非dalR(右)AKQESN公司电子YRRQ公司VQ公司T型L(左)总费用电子VDAL公司K(K)全球技术网络 337
抄送:TIGR00606 840电视VSK公司工业工程L(左)国家可再生能源公司L(左)质量保证部电子----七小时L(左)KSKTNEL公司堪萨斯州EKLQIGTNLQ公司R(右)R(右)----FEEQLV公司电子LSTE公司VQ公司L(左)红外电子IKDA公司K(K)EQD公司 911
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抄送:TIGR00606 912服务提供商LE公司TFLEKDQQEKEELISSKETSKKA公司QD公司KVNDI公司韩国KVKNIHGYMK公司D类工业工程N个基奇奇德YLKQKET公司电子液态氮T型越南船级社LE公司欧盟委员会电子K(K) 991
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吉110347570  410R(右)-------L(左)PLPNFSSLNLR公司电子TN公司L(左)-D类L(左)P(P)L(左)VDTHSKRTLLIKTVETRDGQV公司----INETS公司H(H)H(H)尽职调查LE公司 466
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齿轮1340 齿轮1340
未表征的线圈蛋白,包含DUF342结构域[功能未知];
98-378 6.38至05

未表征的线圈蛋白,包含DUF342结构域[功能未知];


Pssm-ID:440951[多域]Cd长度:297  比特分数:44.90  E值:第6.38页至第05页
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吉110347570 98NTRTNEKVE公司L(左)电致发光NDRFANYIDKVRF公司L(左)EQQNKI公司L(左)洛杉矶电致发光均衡L(左)K(K)gqgksrlgdlye公司电子电子病历电致发光相对应力QV(质量价值)DQ值L(左)TNDKARVE公司研发N个 177
抄送:COG1340  1SKTDELSSS公司L(左)电子电致发光EEKIEELREEEE(易趣)L(左)KEKRDE公司L(左)电致发光韩国L(左)A类------------电子韩元电致发光不适用QV(质量价值)韩国L(左)REEAQELREK公司研发电子 68
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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
180-411 2005年7月5日

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:45.44  E值:2005年7月45日
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PLN02939 PLN02939
转移酶,转移糖基
82-382 1.07年04月

转移糖基转移酶


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Mplasa_alph_rch公司 钨极氩弧焊R04523
富螺旋支原体蛋白;这个家族的成员严格属于。。。
87-412 1.09e-04号

富螺旋支原体蛋白;该科的成员严格出现在支原体属的一个亚群中。成员平均长度为750个氨基酸,包括信号肽。预计序列(Jpred 3)几乎完全是字母顺序。这些序列具有很强的周期性(与长α螺旋结构一致)和低复杂性,富含D、E、N、Q和K。编码这些蛋白质的基因通常是串联的。功能未知。


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CCDC158公司 pfam15921型
线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。。。
110-399 2004年12月4日

线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。功能未知。


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sbcc公司 钨极氩弧焊(TIGR00618)
核酸外切酶SbcC;这个家族中功能已知的所有蛋白质都是。。。
124-407 1.61e-04页

核酸外切酶SbcC;该家族中功能已知的所有蛋白质都是具有sbcD同源物的外显核酸复合物的一部分。这种复合物参与重组的启动,以调节DNA中回文序列的水平。该家族基于JA Eisen的系统发育分析(1999年,斯坦福大学博士论文)。【DNA代谢、DNA复制、重组和修复】


Pssm-ID:129705[多域]Cd长度:1042  比特分数:44.19  E值:1.61e-04页
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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
104-312 2.19e-04日

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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MukB公司 COG3096号机组
染色体凝聚蛋白MukBEF、ATP酶和DNA-结合亚单位MukB[细胞周期控制,细胞。。。
104-386 2004年3月30日

染色体凝聚蛋白MukBEF、ATP酶和DNA-结合亚单位MukB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


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330
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吉110347570 374埃马尔R(右)电子Y(Y)QDL公司 386
抄送:COG3096  1094KRLRKAE公司R(右)D类Y(Y)KQE公司 1106
伊哈恩 合同编号4717
未表征的保守蛋白YhaN,包含AAA结构域[功能未知];
106-255 2004年3月20日

未表征的保守蛋白YhaN,包含AAA结构域[功能未知];


Pssm-ID:443752[多域]Cd长度:641  比特分数:43.22  E值:2004年3月20日
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高尔金_A5 pfam09787
Golgin亚家族A成员5;这个蛋白质家族的成员参与维持。。。
106-256 4.53e-04页

Golgin亚家族A成员5;这个蛋白质家族的成员参与维持高尔基体的结构。它们刺激高尔基体堆积和条带的形成,并参与高尔基体内的逆行运输。已经表征了两种主要的相互作用:一种与被GTP结合激活的RAB1A相互作用,另一种与CUTL1的同型CASP相互作用。


Pssm-ID:462900[多域]Cd长度:305  比特分数:42.05  E值:4.53e-04页
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吉110347570  106电子L(左)QELNDRF公司A类N个Y(Y)身份证件K(K)VRFLE公司QNKI公司L(左)L(左)A类电子L(左)EQLK(均衡锁定)G公司QGKSRLGDLYEE公司电子先生ELR公司RQV公司D类L(左)TNDKARVEVERDN公司L(左)AEDIMR公司L(左) 185
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PRK02224号 PRK02224号
DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;
119-379 5.31e-04页

DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;


Pssm-ID:179385[多域]Cd长度:880  比特分数:42.72  E值:5.31e-04页
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吉110347570 372迈克科尔斯电子相对长度单位A类右侧 379
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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
150-416 5.72e-04年

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:42.75  E值:5.72e-04年
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46 PHA02562型
核酸内切酶亚基;临时的
104-382 2004年6月45日

核酸内切酶亚基;临时的


Pssm-ID:222878[多域]Cd长度:562  比特分数:42.31  E值:2004年6月45日
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抄送:PHA02562 173K(K)丹麦国际铁路公司ELN公司QQIQTLDM公司K(K)IDHIQ公司QQ(QQ)K(K)T型ynk公司NIE公司电子QRKKN公司G公司埃尼亚R(右)KQNK公司Y(Y)D类电子lve公司电子AKTIKAEIEE公司书信电报DELLNLVMDIED公司 252
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编号:PHA02562 253PSAALNK公司L(左)NT公司----------------------------A类AAKIKS公司K(K)电子卡塔尔金融中心千伏KMYE公司K(K)-GGVCPTCT公司-电子G公司----- 297
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吉110347570 338e(电子)SLERQM公司雷姆电子NFSV公司电子AANYQDTIGR公司LQDE公司IQNMKEEMARHLR公司电子 382
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氯丙酸 COG0542号机组
ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚单位ClpA[翻译后修饰,蛋白质。。。
169-281 2004年7月33日

ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚单位ClpA[翻译后修饰,蛋白质周转,伴侣];


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DR0291号文件 COG1579公司
预测核酸结合蛋白DR0291,包含C4型Zn-ribbon结构域[概述。。。
169-332 2008年9月4日

预测核酸结合蛋白DR0291,包含C4型Zn-ribbon结构域[仅适用于一般功能预测];


Pssm-ID:441187[多域]Cd长度:236  比特分数:40.68  E值:2008年9月4日
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抄送:COG1579  93A类LQ公司韩国ESLKRR公司------分力爱德勒梅里电子电子-LEEE公司L(左)A类电子L(左)电子阿莱尔A类电子L(左)电子电子凯尔迪L(左)AELEA公司电子LE公司电子LEAER公司 165

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环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
90-248 2004年9月37日

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
211-428 1.04电子03

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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COG2433公司 COG2433公司
核糖核酸酶H折叠,RuvC/YqgF家族的可能核酸酶【仅用于一般功能预测】;
150-251 1.58e-03号

核糖核酸酶H折叠,RuvC/YqgF家族的可能核酸酶【仅用于一般功能预测】;


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伊哈恩 合同编号4717
未表征的保守蛋白YhaN,包含AAA结构域[功能未知];
174-384 1.80e-03号

未表征的保守蛋白YhaN,包含AAA结构域[功能未知];


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以斯拉 pfam06160型
分离环形成调节剂EzrA;在细菌细胞周期中,微管蛋白样。。。
108-279 2.05e-03年

分离环形成调节剂EzrA;在细菌细胞周期中,微管蛋白样细胞直径蛋白FtsZ聚合成环状结构,确定了新生分裂位点的位置。EzrA调节FtsZ环形成的频率和位置。该结构包含5个类光谱α螺旋重复序列。


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电子病历 COG1566公司
多药耐药外排泵EmrA[防御机制];
150-257 2.21e-03号

耐多药外排泵EmrA[防御机制];


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伊哈恩 齿轮4717
未表征的保守蛋白YhaN,包含AAA结构域[功能未知];
106-399 5.36e-03号

未表征的保守蛋白YhaN,包含AAA结构域[功能未知];


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MAEBL;临时的
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MAEBL;临时的


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DUF3584型 pfam12128型
功能未知蛋白(DUF3584);这种蛋白质存在于细菌和真核生物中。。。
159-387 6.89电子03

功能未知蛋白(DUF3584);这种蛋白质存在于细菌和真核生物中。这个家族中的蛋白质长度通常在943到1234个氨基酸之间。这个家族含有一个P-环基序,表明它是一种核苷酸结合蛋白。它可能参与复制。


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加利福尼亚州1 pfam07888
钙结合和卷曲-卷曲结构域(CALCOCO1)样;在这个家族中发现的蛋白质是。。。
119-315 2003年7月17日

钙结合和卷曲-卷曲结构域(CALCOCO1)样;该家族中发现的蛋白质类似于小家鼠共表达的线圈转录辅激活蛋白(CoCoA/CALCOC1)。该蛋白与p160辅激活子的高度保守的N末端结构域结合,如GRIP1,从而增强许多核受体的转录激活。CALCOCO1有一个中心卷曲-卷曲区域,带有三个亮氨酸拉链基序,这是其与GRIP1相互作用所必需的,并可能调节C末端区域的自主转录激活活性。


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DR0291号文件 COG1579公司
预测核酸结合蛋白DR0291,包含C4型Zn-ribbon结构域[概述。。。
95-281 8.72e-03号

预测核酸结合蛋白DR0291,包含C4型Zn-ribbon结构域[仅适用于一般功能预测];


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235千Da-英尺 TIGR01612型
网织红细胞结合/菱形蛋白;这个模型代表了。。。
209-388 9.78e-03号

网织红细胞结合/菱形蛋白;该模型代表了疟原虫物种中的一组同源家族,交替注释为网织红细胞结合蛋白、235-kDa家族蛋白和菱形蛋白。Rhoptry蛋白位于细胞表面,非常大(尽管明显缺乏重复结构),对寄生虫入侵红细胞的过程很重要。这些蛋白质存在于恶性疟原虫、间日疟原虫和约氏疟原虫中。


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爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • 王杰等(2023),“2023年的保守域数据库”,核酸研究51(D) 384-8中。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”,核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”,核酸研究45(D) 2003年3月。
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