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组蛋白H3.1[智人]

蛋白质分类

组蛋白H3(域体系结构ID 10794185)

组蛋白H3是核小体的核心成分,它将DNA包裹并压缩成染色质,限制了需要DNA作为模板的细胞机制对DNA的访问

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PTZ00018型 PTZ00018型
组蛋白H3;暂定
1-136 2.04e-90页

组蛋白H3;暂定


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HFD_H3型 cd22911
组蛋白H3和类似蛋白中发现的组蛋白折叠结构域;组蛋白H3是一种核心成分。。。
40-133 2.34e-63页

组蛋白H3和类似蛋白中发现的组蛋白折叠结构域;组蛋白H3是核小体的核心成分,它将DNA包裹并压缩成染色质,限制了需要DNA作为模板的细胞机制对DNA的访问。因此,组蛋白在转录调控、DNA修复、DNA复制和染色体稳定性中发挥着中心作用。DNA可及性是通过组蛋白的一系列复杂的翻译后修饰(也称为组蛋白密码)和核小体重塑来调节的。核小体是一种组蛋白八聚体,包含H2A、H2B、H3和H4中的两个分子,分别组装在一个H3-H4异四聚体和两个H2A-H2B异二聚体中。八聚体包裹约147 bp的DNA。


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1月132日 2.66e-53页

核心组蛋白H2A/H2B/H3/H4;


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组蛋白H3;暂定
1-136 2.04e-90页

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HFD_H3型 cd22911型
组蛋白H3和类似蛋白中发现的组蛋白折叠结构域;组蛋白H3是一种核心成分。。。
40-133 2.34e-63页

组蛋白H3和类似蛋白中发现的组蛋白折叠结构域;组蛋白H3是核小体的核心成分,它将DNA包裹并压缩成染色质,限制了需要DNA作为模板的细胞机制对DNA的访问。因此,组蛋白在转录调控、DNA修复、DNA复制和染色体稳定性中发挥着中心作用。DNA可及性是通过组蛋白的一系列复杂的翻译后修饰(也称为组蛋白密码)和核小体重塑来调节的。核小体是一种组蛋白八聚体,包含两个H2A、H2B、H3和H4分子,组装在一个H3-H4异四聚体和两个H2A-H2B异二聚体中。八聚体包裹约147 bp的DNA。


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核心组蛋白H2A/H2B/H3/H4;


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PLN00161号 PLN00161号
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组蛋白H3;暂定


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吉21071021  122PKD公司克拉里格E类 134
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HFD_SF(高频) cd00076
组蛋白折叠结构域(HFD)超家族;组蛋白折叠结构域(HFD)在结构上是一个。。。
68-128 1.18e-04页

组蛋白折叠结构域(HFD)超家族;组蛋白折叠结构域(HFD)是一个结构保守的相互作用基序,参与核心组蛋白的异二聚体化及其组装成核小体八聚体。组蛋白折叠异二聚体在基因调控中起着关键作用。最小HFD由三个阿尔法螺旋线组成,由两个短的非结构化环连接。HFD存在于核心组蛋白、TATA盒结合蛋白相关因子(TAF)和许多其他转录因子中。HFD通过保存组蛋白相互作用在核小体核心颗粒中发挥作用;其中包含多个HFD。核小体核心粒子的结构有两种具有最大相互作用表面的模式,即H3-H4和H2A-H2B异二聚体相互作用。一些TAF通过组蛋白折叠(HF)基序相互作用。转录因子II D(TFIID)中描述了五个含HF的TAF对:TAF6-TAF9、TAF4-TAF12、TAF11-TAF13、TAF8-TAF10和TAF3-TAF10。


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HFD_CENP-T公司 cd22920
着丝粒蛋白T(CENP-T)和类似蛋白中发现的组蛋白折叠结构域;CENP-T,也。。。
70-132 1.10e-03日

着丝粒蛋白T(CENP-T)和类似蛋白中发现的组蛋白折叠结构域;CENP-T,也称为间期着丝粒复合物蛋白22(ICEN22),是CENPA-NAC(核小体相关)复合物的组成部分,在动粒蛋白组装、有丝分裂进程和染色体分离中起着核心作用。CENPA-NAC复合物招募CENPA-CAD(核小体远端)复合物,可能参与将新合成的CENPA并入着丝粒。CENP-T也是核小体相关复合物的一部分,与含有CENPA的核小体相反,该复合物在着丝粒特异性地与组蛋白H3的核小体结合。此外,CENP-T是异四聚体CENP-T-W-S-X复合物的一个组成部分,它结合并超包裹DNA,在动粒组装中起着重要作用。CENP-T在动粒组装和功能中具有基本作用。它是一种内动粒蛋白,与大多数下游蛋白结合。它是正常染色体组织和有丝分裂正常进展所必需的。


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吉21071021 70R(右)低压雷亚克d日FKTDL公司R(右)FQSS公司A类虚拟机美国铝业公司E类自动控制E类AYLVG公司L(左)FE公司D类TNLC公司A类K(K)R(右)V(V)技术信息MP公司杜兰特-智商L(左)应收账R(右)R(右) 132
抄送:cd22920 6S公司低压KKLFK公司-高频锁相环R(右)VSKE公司A类LE公司美国铝业公司E类E类E类效率L(左)标准偏差D类LEAY公司A类D类G公司R(右)K(K)技术信息杜兰特v(v)EL公司L(左)迈克科尔斯R(右)R(右) 68
HFD_古菌类_组蛋白样 cd22909
组蛋白折叠结构域主要存在于古生物组蛋白中,类组蛋白转录。。。
65-130 5.76e-03年

组蛋白折叠结构域主要存在于古生物组蛋白、类组蛋白转录调节因子和类似蛋白中;该家族包括许多古老的组蛋白折叠蛋白和类组蛋白转录调节剂,它们可以结合和压缩DNA(95到150个碱基对),形成含有阳性DNA超螺旋的核小体样结构。它们可以增加DNA对热变性的抵抗力。


Pssm-ID:467034  Cd长度:64  比特分数:33.29  E值:5.76e-03年
10 20 30 40 50 60
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吉21071021 65K(K)L(左)P(P)频率R(右)LVREI公司aqdfk公司TDL公司R(右)FQSS公司A类VMA公司L(左)QEAC公司E类AYLVGLF公司E类DTNLC公司A类K(K)R(右)V(V)T型IMPK公司设计院洛杉矶右后 130
抄送:cd22909 4K(K)A类P(P)VK公司R(右)IIKKA公司-----GAE公司R(右)VSED公司A类AEE公司L(左)AKLL公司E类EIAEEIA(环境影响评估)E类EAVKL公司A类K(K)G公司R(右)K(K)T型VKAE公司设计院E类洛杉矶VK公司 64
 
爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • Wang J等人(2023),“2023年的保守域数据库”,核酸研究51(D) 公元384-388年。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”,核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”,核酸研究45(D) 2003年3月。
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