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蛋白质分类
双链断裂修复蛋白MRE11(域体系结构ID 1903556)
双链断裂修复蛋白MRE11是MRN复合体的组成部分，在双链断裂（DSB）修复、DNA重组、维持端粒完整性和减数分裂中起着重要作用
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| mre11超级家族 |
第44331条 |
DNA修复蛋白（mre11）；这个家族中功能已知的所有蛋白质都是。。。 |
10-402 |
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DNA修复蛋白（mre11）；这个家族中功能已知的所有蛋白质都是由包括MRE11和RAD50同源物在内的多种蛋白质组成的核酸酶复合物的亚单位。这种核酸酶复合物的功能包括重组修复和非同源末端连接。这个家族是基于JA Eisen的系统发育分析（1999年，斯坦福大学博士论文）。该家族中的蛋白质与细菌SbcCD复合体中的蛋白质有远亲关系。[DNA代谢、DNA复制、重组和修复]
检测到与超家族成员的实际对齐钨极氩弧焊00583:
Pssm-ID：273153[多域]Cd长度：405 比特分数：502.83 E值：7.61e-174页
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DNA修复蛋白（mre11）；这个家族中功能已知的所有蛋白质都是由包括MRE11和RAD50同源物在内的多种蛋白质组成的核酸酶复合物的亚单位。这种核酸酶复合物的功能包括重组修复和非同源末端连接。这个家族是基于JA Eisen的系统发育分析（1999年，斯坦福大学博士论文）。该家族中的蛋白质与细菌SbcCD复合体中的蛋白质有远亲关系。[DNA代谢、DNA复制、重组和修复]
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| MPP_Mre11_N |
cd00840 |
Mre11核酸酶，N-末端金属磷酸酶结构域；Mre11（在大肠杆菌中也称为SbcD）。。。 |
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8.41e-64页 |
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Mre11核酸酶，N-末端金属磷酸酶结构域；Mre11（在大肠杆菌中也称为SbcD）是MRX蛋白复合物的一个亚单位。该复合物包括：Mre11、Rad50和Xrs2/Nbs1，并在真核生物中的几个核过程中发挥重要作用，包括DNA双链断裂修复、端粒长度维持、细胞周期检查点控制和减数分裂重组。在双链断裂修复过程中，需要MRX复合物将断裂染色体的两端固定在一起。体外研究表明，Mre11在dsDNA模板上具有3'-5'核酸外切酶活性，在dsDNA和ssDNA模板上具有核酸内切酶活性。除了N末端磷酸酶结构域外，该家族的真核生物MRE11成员还有一个C末端DNA结合结构域（不包括在该比对模型中）。MRE11样蛋白存在于原核生物和古生菌中，也存在于真核生物中。Mre11属于金属磷酸酶（MPP）超家族。MPP功能多样，但都共享一个保守的结构域，该结构域具有由两个金属离子（通常为锰、铁或锌）组成的活性位点，通过组氨酸、天冬氨酸和天冬酰胺残基笼与八面体几何结构相协调。MPP超家族包括：Mre11/SbcD-like核酸外切酶、Dbr1-like RNA lariat脱支酶、YfcE-like磷酸二酯酶、紫色酸性磷酸酶（PAPs）、YbbF-like UDP-2,3-二烷基葡萄糖胺水解酶和酸性鞘磷脂酶（ASMases）。保守结构域是一个双β-板三明治，其双金属活性位点由位于板的C末端侧的残基组成。该领域被认为允许生产金属配位。
Pssm-ID：277319[多域]Cd长度：186 比特分数：209.82 E值：8.41e-64页
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| Mre11_DNA_绑定 |
pfam04152型 |
Mre11 DNA结合推定结构域；Mre11复合物是一种多亚单位核酸酶，是。。。 |
294-461 |
5.89e-63页 |
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Mre11 DNA结合推定结构域；Mre11复合物是一种多亚单位核酸酶，由Mre11、Rad50和Nbs1/Xrs2组成，参与检查点信号和DNA复制。Mre11具有内在的DNA结合活性，由Rad50单独或与Nbs1结合刺激。
Pssm-ID：461198 Cd长度：175 比特分数：207.45 E值：5.89e-63页
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齿轮0420 |
DNA修复外切酶SbcCD核酸酶亚基[复制、重组和修复]； |
13-308 |
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DNA修复外切酶SbcCD核酸酶亚基[复制、重组和修复]；
Pssm-ID：440189[多域]Cd长度：250 比特分数：94.59 E值：1.59e-21
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| MPP_Mre11_N |
cd00840 |
Mre11核酸酶，N-末端金属磷酸酶结构域；Mre11（在大肠杆菌中也称为SbcD）。。。 |
14-275 |
8.41e-64页 |
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Mre11核酸酶，N-末端金属磷酸酶结构域；Mre11（在大肠杆菌中也称为SbcD）是MRX蛋白复合物的一个亚单位。该复合物包括：Mre11、Rad50和Xrs2/Nbs1，并在真核生物中的几个核过程中发挥重要作用，包括DNA双链断裂修复、端粒长度维持、细胞周期检查点控制和减数分裂重组。在双链断裂修复过程中，需要MRX复合物将断裂染色体的两端固定在一起。体外研究表明，Mre11在dsDNA模板上具有3'-5'核酸外切酶活性，在dsDNA和ssDNA模板上具有核酸内切酶活性。除了N末端磷酸酶结构域外，该家族的真核生物MRE11成员还有一个C末端DNA结合结构域（不包括在该比对模型中）。MRE11样蛋白存在于原核生物和古生菌中，也存在于真核生物中。Mre11属于金属磷酸酶（MPP）超家族。MPP功能多样，但都共享一个保守的结构域，该结构域具有由两个金属离子（通常为锰、铁或锌）组成的活性位点，通过组氨酸、天冬氨酸和天冬酰胺残基笼与八面体几何结构相协调。MPP超家族包括：Mre11/SbcD-like核酸外切酶、Dbr1-like RNA lariat脱支酶、YfcE-like磷酸二酯酶、紫色酸性磷酸酶（PAPs）、YbbF-like UDP-2,3-二烷基葡萄糖胺水解酶和酸性鞘磷脂酶（ASMases）。保守结构域是一个双β-板三明治，其双金属活性位点由位于板的C末端侧的残基组成。该领域被认为允许生产金属配位。
Pssm-ID：277319[多域]Cd长度：186 比特分数：209.82 E值：8.41e-64年
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抄送：cd00840 1射频我HTA公司D类W公司HLG公司YPLYGLS公司第页R（右）电气工程师D类F类F类KAFE公司工程安装虚拟磁盘洛杉矶我E类EK公司VDF公司V（V）我IA公司GDLF公司DS公司N个N个PS（聚苯乙烯）豌豆我吉隆坡国际机场E类G公司左后右心室C类--------- 71
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抄送：cd00840 90---V（V）A类我YGL公司PYLR公司DERL公司E类R（右）我F类EDLE公司---轻轨列车RLLKPD公司WFN公司ILLL公司高质量GVDGA公司G公司屏蔽门蛇四、体育课DL公司我对D类GF公司D类Y（Y）V（V）美国铝业公司GH公司我H（H）K（K） 163
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250 260
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| Mre11_DNA_绑定 |
pfam04152型 |
Mre11 DNA结合推定结构域；Mre11复合物是一种多亚单位核酸酶，是。。。 |
294-461 |
5.89e-63页 |
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Mre11 DNA结合推定结构域；Mre11复合物是一种多亚单位核酸酶，由Mre11、Rad50和Nbs1/Xrs2组成，参与检查点信号和DNA复制。Mre11具有内在的DNA结合活性，由Rad50单独或与Nbs1结合刺激。
Pssm-ID：461198 Cd长度：175 比特分数：207.45 E值：5.89e-63页
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抄送：pfam04152 80RV汽车E类Y（Y）T型GGFE公司VENPQ公司射频G公司问R（右）FV公司G公司RVANP公司N个D类VVQ公司F类Y（Y）R（右）KKKARR公司K（K）KKKDKAADG公司埃得我本地设计院对EKLDE公司LRVEDLVK公司E类Y（Y）LAAQ公司- 158
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| SbcD公司 |
齿轮0420 |
DNA修复外切酶SbcCD核酸酶亚基[复制、重组和修复]； |
13-308 |
1.59e-21 |
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DNA修复外切酶SbcCD核酸酶亚基[复制、重组和修复]；
Pssm-ID：440189[多域]Cd长度：250 比特分数：94.59 E值：1.59e-21
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抄送：COG0420 1物料回收设施我HTA公司D类W公司HLG公司KPLHG公司A类S公司R（右）重新D类QLAA公司劳埃德RLVD（RLVD）洛杉矶我E类EK公司虚拟磁盘成人影片我IA公司GDLF公司DSAN公司PS（聚苯乙烯）佩弗拉E类A类左后R（右）----------- 69
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| CpdA公司 |
COG1409公司 |
3'，5'-环AMP磷酸二酯酶CpdA[信号转导机制]； |
13-277 |
2.85e-08 |
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3'，5'-环AMP磷酸二酯酶CpdA[信号转导机制]；
Pssm-ID：441019[多域]Cd长度：234 比特分数：55.08 E值：2.85e-08
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吉1057866489 93ILSDQ公司svnfg公司FSKFP公司wvnyqdgnlnis公司我光伏FSIH公司GNHD公司DPTGADAL公司卡尔迪斯卡FVNH公司FG公司RSMSVEK公司---我D类网络服务提供商V（V）陆上通信线 169
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| MPP_YkuE_C公司 |
cd07385 |
枯草芽孢杆菌YkuE及其相关蛋白、C末端金属磷酸酶结构域；YkuE是一个。。。 |
13-247 |
1.55e-07日 |
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枯草芽孢杆菌YkuE及其相关蛋白、C末端金属磷酸酶结构域；YkuE是一种未经特征化的枯草芽孢杆菌蛋白，具有C末端金属磷酸酶结构域和N末端双精氨酸（RR）基序。来自枯草芽孢杆菌YkuE蛋白的RR-信号肽可以直接在青链霉菌中分泌依赖Tat的琼脂酶。这表明YkuE是通过枯草芽孢杆菌Tat（双精氨酸易位）途径机制转运的。YkuE属于金属磷酸酶（MPP）超家族。MPP功能多样，但都共享一个保守的结构域，该结构域具有由两个金属离子（通常为锰、铁或锌）组成的活性位点，通过组氨酸、天冬氨酸和天冬酰胺残基笼与八面体几何结构相协调。MPP超家族包括：Mre11/SbcD-like核酸外切酶、Dbr1-like RNA lariat脱支酶、YfcE-like磷酸二酯酶、紫色酸性磷酸酶（PAPs）、YbbF-like UDP-2,3-二烷基葡萄糖胺水解酶和酸性鞘磷脂酶（ASMases）。保守结构域是一个双β-板三明治，其双金属活性位点由位于板的C末端侧的残基组成。该领域被认为允许生产金属配位。
Pssm-ID：277331[多域]Cd长度：224 比特分数：52.67 E值：1.55e-07日
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吉1057866489 245H（H）E类H（H） 247
抄送：cd07385 164H（H）T型H（H） 166
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| YaeI公司 |
COG1408公司 |
预测磷酸水解酶，MPP超家族[仅限一般功能预测]； |
13-247 |
2007年3月20日 |
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预测磷酸水解酶，MPP超家族[仅限一般功能预测]；
Pssm-ID：441018[多域]Cd长度：268 比特分数：52.49 E值：2007年3月20日
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| COG2129公司 |
COG2129公司 |
预测的磷酸酯酶，与Icc蛋白相关[仅限一般功能预测]； |
14-293 |
3.99至07 |
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预测的磷酸酯酶，与Icc蛋白相关[仅限一般功能预测]；
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170 180 190 200 210 220 230 240
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吉1057866489 174tkial公司Y（Y）GLG公司硅---对DERL公司Y（Y）风险管理基金---VNKKVTM公司左后对K（K）E类密集FNLFVI公司H（H）-----------QNRSKH公司GS公司TNF公司知识产权EQFLDD公司 236
抄送：COG2129 96-----A类GLG公司GS公司rpt公司对FGTP公司Y（Y）眼睛电子工程师IEERLAK公司左后E类K（K）D类-----VDILLT公司H（H）appygttldrv（批准）EDGPHV公司GS公司KAL公司--救济 163
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250 260 270 280 290
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吉1057866489 237F类-身份证件低压信息战GH公司E类高等教育C类kiaptkneqql公司FYISQP公司G公司小型蒸汽发生器V（V）ts秒LS（负载感应）PG公司EAVKKHVG公司我LRIKG公司R（右）K（K） 293
抄送：COG2129 164F类q个PK（主键）低压左侧GH公司我高等教育S公司-----------RGVDKI公司G公司全球技术法规V（V）--越南PG公司斯莱盖亚我IDLED指示灯R（右）S公司 208
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| 金属磷 |
pfam00149型 |
钙调磷酸酶；这个家族包括多种磷酸酯酶。。。 |
13-131 |
1.76e-06年 |
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钙调磷酸酶；该家族包括多种磷酸酯酶，包括蛋白磷酸丝氨酸磷酸酶、核苷酸酶、鞘磷脂磷酸二酯酶和2’-3’cAMP磷酸二酯酶类以及核酸酶，如细菌SbcD或酵母MRE11。这个超家族中最保守的区域以金属螯合残基为中心。
Pssm-ID：459691[多域]Cd长度：114 比特分数：47.21 E值：1.76e-06年
10 20 30 40 50 60 70 80
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吉1057866489 13FK公司ILV公司自动变速箱D类我HL公司G公司fmekdavrgn公司DTFVT公司我D类E类我我R（右）-我逆商E类新能源汽车D类金融机构我LG公司GDL公司FHENK公司PS（聚苯乙烯）rktl公司HTC公司LELL公司韩国ycmgdrpvqf公司 91
编号：pfam00149 1先生ILV公司IG公司D类我HL公司对----------吉尔吉斯斯坦共和国我我E类我我K（K）k个我LE公司E类GKP公司D类低压我哈GDL公司VDRGP公司PS（聚苯乙烯）----电动汽车LELL公司急诊室---------- 56
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90 100 110 120
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吉1057866489 92eilsdqsvnfgfskfpwvnyqdgn公司我NISI公司光伏FSIH公司GNHD公司D类 131
编号：pfam00149 57------------------------我IKYV公司光伏YLVR公司GNHD公司F类 72
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| 爆破搜索参数 |
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数据来源：
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预计算数据，版本=cdd.v.3.21 |
| 预设选项： | 数据库：CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器：没有基于成分的调整：是的E值阈值： 0.01 |
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