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肌动蛋白,细胞质1

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ASKHA_NBD_活性 cd10224
肌动蛋白和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);肌动蛋白是一种普遍存在的蛋白质。。。
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肌动蛋白和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);肌动蛋白是一种普遍存在的蛋白质,参与形成细胞骨架的主要成分丝。它是一个高度动态的结构蛋白网络,参与细胞收缩、细胞运动、囊泡运输、细胞内组织、胞质分裂、内吞和凋亡等过程。肌动蛋白是一种单体球状蛋白(G-Actin),可可逆聚合形成细丝(F-Actin)。每个肌动蛋白原聚体结合一个ATP分子和钙或镁离子。在低盐浓度下,肌动蛋白以单体形式存在,随着盐浓度的升高,F-肌动蛋白形成,随之ATP水解。F-肌动蛋白组装是恒定流动的,G-肌动蛋白结合发生在带倒钩的末端(+),其解离发生在尖端(-)。如果ADP被换成ATP,从尖端释放出来的肌动蛋白单体可以重复使用。F-肌动蛋白丝可以组装成高阶结构,例如分支F-肌动和应力纤维。肌动蛋白结合蛋白通过一系列功能调节肌动蛋白丝动力学,包括肌动蛋白切断、解聚、封端、稳定和从头聚合。肌动蛋白与肌球蛋白的相互作用是肌肉收缩和细胞运动的许多方面的基础。脊椎动物中有三种主要的肌动蛋白亚型,即α、β和γ。肌肉组织中的α肌动蛋白是收缩装置的主要组成部分。β肌动蛋白和γ肌动蛋白在大多数细胞类型中共存,作为细胞骨架的组成部分和内部细胞运动的介质。植物中有许多亚型,它们可能参与多种功能,如细胞质流动、细胞形状测定、顶端生长、重力感知、细胞壁沉积等。


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ASKHA_NBD_活性 cd10224
肌动蛋白和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);肌动蛋白是一种普遍存在的蛋白质。。。
6-370 0e+00

肌动蛋白和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);肌动蛋白是一种普遍存在的蛋白质,参与形成细胞骨架的主要成分丝。它是一个高度动态的结构蛋白网络,参与细胞收缩、细胞运动、囊泡运输、细胞内组织、胞质分裂、内吞和凋亡等过程。肌动蛋白是一种单体球状蛋白(G-Actin),可可逆聚合形成细丝(F-Actin)。每个肌动蛋白原聚体结合一个ATP分子和钙或镁离子。在低盐浓度下,肌动蛋白以单体形式存在,随着盐浓度的升高,F-肌动蛋白形成,随之ATP水解。F-肌动蛋白组分不断流动,G-肌动素结合发生在倒刺端(+),而其分离发生在尖端(-)。如果ADP被换成ATP,从尖端释放出来的肌动蛋白单体可以重复使用。F-肌动蛋白丝可以组装成高阶结构,例如分支F-肌动和应力纤维。肌动蛋白结合蛋白通过一系列功能调节肌动蛋白丝的动力学,包括肌动蛋白切断、解聚、覆盖、稳定和从头开始肌动蛋白聚合。肌动蛋白与肌球蛋白的相互作用是肌肉收缩和细胞运动的许多方面的基础。脊椎动物中有三种主要的肌动蛋白亚型,即α、β和γ。肌肉组织中的α肌动蛋白是收缩装置的主要组成部分。β肌动蛋白和γ肌动蛋白在大多数细胞类型中共存,作为细胞骨架的组成部分和内部细胞运动的介质。在植物中有许多异构体,它们可能参与多种功能,如细胞质流动、细胞形状决定、尖端生长、重力感知、细胞壁沉积等。


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PTZ00281型 PTZ00281型
肌动蛋白;临时的
1-375 0e+00

肌动蛋白;临时的


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肌动蛋白 智能00268
肌动蛋白;ACTIN/mreB/sugarkinase/Hsp70超家族的ACTIN亚家族
6月375日 0e+00

肌动蛋白;ACTIN/mreB/sugarkinase/Hsp70超家族的ACTIN亚家族


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肌动蛋白相关蛋白[细胞骨架];


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吉924183513 9VV公司D类N个G公司新加坡通用汽车公司K一个G公司-F类一个GDDA公司P(P)-----R(右)成人影片F类PS(聚苯乙烯)体外受精RPRHQ公司G公司V(V)M(M)V(V)G公司MG公司q个KDSY公司VGDE公司AQS公司-----KRG公司书信电报LKYP公司IEH公司GIV公司T型 77
抄送:COG5277  12GI公司D类F类G公司TSYV公司KY(Y)G公司第页一个韭菜P(P)rviqt公司R(右)德国劳埃德船级社F类左后体外受精ESKLL公司G公司P(P)M(M)E类G公司LS(负载感应)-RGLV公司VGDE公司VSK公司ylssv病毒雷达雷达注册护士LKYP公司LRD公司吉夫R(右) 90
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吉924183513 78-----N个W公司DDMEKIWHH公司TF公司YNE公司R(右)V(V)一个体育课E类H(H)P(P)--V(V)LLTEAP公司N个P(P)重新KMTQ公司M(M)T型F类---NT公司PA公司迈瓦伊AVLSLY公司一个新加坡政府 147
抄送:COG5277  91rdded的一个W公司RVLKELLRY公司TF公司AQF公司V(V)V(V)D类体育课F类H(H)G公司佛罗里达州V(V)VVALSA公司一个P(P)DYM公司重新RLFD公司H(H)V(V)F类看见通用航空公司PA公司VTIIP公司普拉瓦一个EKA公司 170
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抄送:COG5277  171V(V)T型个人简历V(V)VEA公司G公司H(H)G公司NSQVA公司圆周率SR公司G公司-皮雷格尔瓦NRG公司G公司埃及伊蚊伊利诺伊州KD(分子量)RGYS公司D类T型E类Y(Y)-V(V)虚拟现实VV公司韩国一个德国劳埃德船级社V(V)公共关系D类拉凯 248
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抄送:COG5277  329SIMKCDV公司E类QDE公司S公司N个LSGG公司AFNW公司高级副总裁PG公司LE公司D类vavdsvtR(右)V(V)E类伦敦证交所LAP公司-电致发光KVNVRLVSDPQ公司YSVW公司KG公司人工智能YGYAL公司 407
410
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合同编号:COG527  408P(P)F类SVK公司W公司开关T型KEGWYFL公司 424
丁香胶 NF040575号
丁香胶;丁香凝集素是正常真核蛋白肌动蛋白的密切同源物,发现于。。。
303-374 2.59e-35

丁香胶;丁香凝集素是正常真核蛋白肌动蛋白的密切同源物,存在于植物病原体丁香假单胞菌及其相关物种中。创建这个模型的部分目的是为了澄清这个家族是真实的和独特的,而不是真核生物污染细菌基因组序列数据的产物。在这个HMM创建之初,这个家庭是没有特点的。


Pssm ID:468549[多域]Cd长度:132  比特分数:125.86  E值:2.59e-35
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吉924183513 303TTMYP公司G公司IADRMQ公司KE类信息技术美国铝业公司AP公司STMK公司KIIAP公司P(P)ERKYSV公司W公司G公司GSIL公司一个SLST公司F类QQ(QQ)M(M)W公司S公司KQEYDESGPSIVHRKC公司 374
抄送:NF040575 61RVNES公司G公司FYEKLK年度KS公司信息技术EK公司AP公司KGAL公司GMTLD公司P(P)KPESAA公司W公司R(右)G公司美国汽车制造商协会一个ASEG公司F类价值工程M(M)一个T型千年发展目标 132
 
姓名 加入 描述 间隔 E值
ASKHA_NBD_活性 cd10224
肌动蛋白和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);肌动蛋白是一种普遍存在的蛋白质。。。
6-370 0e+00

肌动蛋白和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);肌动蛋白是一种普遍存在的蛋白质,参与形成细胞骨架的主要成分丝。它是一个高度动态的结构蛋白网络,参与细胞收缩、细胞运动、囊泡运输、细胞内组织、胞质分裂、内吞和凋亡等过程。肌动蛋白是一种单体球状蛋白(G-Actin),可可逆聚合形成细丝(F-Actin)。每个肌动蛋白原聚体结合一个ATP分子和钙或镁离子。在低盐浓度下,肌动蛋白以单体形式存在,随着盐浓度的升高,F-肌动蛋白形成,随之ATP水解。F-肌动蛋白组装是恒定流动的,G-肌动蛋白结合发生在带倒钩的末端(+),其解离发生在尖端(-)。如果ADP被换成ATP,从尖端释放出来的肌动蛋白单体可以重复使用。F-肌动蛋白丝可以组装成高阶结构,例如分支F-肌动和应力纤维。肌动蛋白结合蛋白通过一系列功能调节肌动蛋白丝的动力学,包括肌动蛋白切断、解聚、覆盖、稳定和从头开始肌动蛋白聚合。肌动蛋白与肌球蛋白的相互作用是肌肉收缩和细胞运动的许多方面的基础。脊椎动物中有三种主要的肌动蛋白亚型,即α、β和γ。肌肉组织中的α肌动蛋白是收缩装置的主要组成部分。β肌动蛋白和γ肌动蛋白在大多数细胞类型中共存,作为细胞骨架的组成部分和内部细胞运动的介质。植物中有许多亚型,它们可能参与多种功能,如细胞质流动、细胞形状测定、顶端生长、重力感知、细胞壁沉积等。


Pssm-ID:466823  Cd长度:365  比特分数:938.33  E值:0e+00
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PTZ00281型 PTZ00281型
肌动蛋白;临时的
1-375个 0e+00

肌动蛋白;暂定


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ASKHA_NBD_actin_Arp-T1-3型 cd13397
肌动蛋白的核苷酸结合域(NBD)、肌动蛋白相关蛋白T1-T3(Arp-T1-3)和类似蛋白。。。
6-366 0e+00

肌动蛋白的核苷酸结合域(NBD)、肌动蛋白相关蛋白T1-T3(Arp-T1-3)和类似蛋白;该家族包括肌动蛋白和人类肌动蛋白相关蛋白T1、T2和T3。肌动蛋白是一种普遍存在的蛋白质,参与形成细胞骨架的主要成分丝。它是一个高度动态的结构蛋白网络,参与细胞收缩、细胞运动、囊泡运输、细胞内组织、胞质分裂、内吞和凋亡等过程。Arp-T1由睾丸中表达的ACTRT1/ARPT1基因编码,负调控Hedgehog(SHH)信号传导,与SHH信号传导介质GLI1的启动子结合,并抑制其表达。Arp-T2(也称为肌动蛋白相关蛋白M2;由在睾丸和各种其他细胞类型中表达的ACTRT2/ARPM2基因编码)和Arp-T3(也称为肌动分子相关蛋白M1;由所有测试人体组织中表达的ARTRT3/ARPM1基因编码的)与其他细胞质肌动蛋白有关蛋白一样,在细胞骨架的组织中发挥着一般作用。


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抄送:cd13397  1P(P)一个V(V)V(V)DNGSG公司卡格法格E类D类PRAVFPS公司V(V)VGRP公司凯卡(KYKA)虚拟机G公司一个GQK公司电动汽车YVGDEAQ公司E类KRG公司V(V)长期贷款S公司YPIEHGIVTNWDDMEKI公司 80
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抄送:cd13397  81WHHTF公司E类NELRV公司KPEEHPVLLTEAPLNPK公司国家可再生能源管理局不良事件IMFETF公司全球价值PA公司F类伊瓦伊卡夫利S公司SGRTTG公司V(V)DSGDGVTHTVPI公司 160
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抄送:cd13397  239QVI(质量指数)KIG公司S公司ERFRCPEALF公司R(右)PS(聚苯乙烯)G公司R(右)E类AP公司GIH公司笨重的NSIMKCD公司德克德利S公司N个VLSGG公司S公司TM(TM)F类PG公司液化石油气R(右)QKE公司LE公司ALAPS公司装货单 318
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PTZ00004型 PTZ00004型
肌动蛋白-2;临时的
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肌动蛋白-2;临时的


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合同编号:PTZ00004 2SVEETN公司一个一个VVDNGSGM公司V(V)KAGFAGDDAPR公司C类VFPSIVGRP公司KNP公司G公司MVGM公司电气工程师KD(分子量)C类YVGDEAQ公司D类KRGILTLKYPIEHGIVTNWD公司 81
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吉924183513 240YELPDG公司QV(质量价值)信息技术G公司N个ERFRCPEALFQPS公司佛罗里达州G公司M(M)E类联合国安全理事会-GIHE公司T型TF公司N个M(M)KCD公司V(V)德克德利一个N个T型VLSGGTTMY公司P(P)G公司IAD公司R(右)MQ公司韩国T型 318
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肌动蛋白 智能00268
肌动蛋白;ACTIN/mreB/sugarkinase/Hsp70超家族的ACTIN亚家族
6-375 0电子+00

肌动蛋白;ACTIN/mreB/sugarkinase/Hsp70超家族的ACTIN亚家族


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ASKHA_NBD_Arp1 cd10216
肌动蛋白相关蛋白1(Arp1)和类似蛋白的核苷酸结合结构域(NBD);Arp1。。。
8-374 0电子+00

肌动蛋白相关蛋白1(Arp1)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);Arp1,也称为中央凝集素、类肌动蛋白、α-中央凝集蛋白、肌动蛋白-RPV或与中心体相关的肌动蛋白同源物,可能是参与微管囊泡运动的多亚单位中心体复合体的组成部分。在酵母中,肌动蛋白相关蛋白对活力至关重要,并与中心体相关。在脊椎动物中,Arp1是动力蛋白复合物的核心成分,通过增加其加工性和调节其货物结合来帮助细胞质动力蛋白。dynactin复合体是纺锤体后期易位所必需的,并参与细胞壁合成检查点。ARP1形成动力蛋白杆结构的主干丝,并充当其余亚单位的支架。这是有丝分裂纺锤体正确定位所必需的。Arp1是已知的唯一形成肌动蛋白样丝的肌动蛋白相关蛋白。人类Arp1/centractin由ACTR1A基因编码。


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肌动蛋白 pfam00022型
肌动蛋白;
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肌动蛋白;


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ASKHA_NBD_Arp2 cd10220
肌动蛋白相关蛋白2(Arp2)和类似蛋白的核苷酸结合结构域(NBD);Arp2。。。
8-370 0电子+00

肌动蛋白相关蛋白2(Arp2)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);Arp2,也称为肌动蛋白样蛋白2,是Arp2/3复合物的ATP结合成分,Arp2/3复合体是一种多蛋白复合物,在核增殖因子(NPF)刺激下介导肌动蛋白聚合。Arp2/3复合物由7种蛋白质(Arp2、Arp3和5种保守蛋白质ARPC1-5)组成。它通过促进肌动蛋白丝的成核,在较老的肌动蛋白纤维一侧形成70度的分支,从而生成细胞质分支丝网络。它通过与预先存在的丝状物、促核因子和肌动蛋白单体同时结合而被激活。子枝随后从母丝上分离/脱枝。其Arp2和Arp3亚单位必须装载ATP才能启动分支肌动蛋白丝的组装。支管起始或脱支可能需要ATP水解。Arp2/3复合物也存在于细胞核中,在细胞核中起到促进从头开始肌动蛋白聚合和RNA聚合酶II依赖性转录的作用。这可能部分是通过调节核肌动蛋白聚合,就像它在细胞质中的功能一样。人类Arp2由ACTR2基因编码。


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吉924183513 8V(V)V(V)DNG公司S公司G公司国会议员K一个GFAG公司直接数据采集P(P)无线电高度表变频调速系统VGRP公司--R(右)HQGVMVGMGQ公司KD(分子量)SY公司VGDEA公司QSK公司R(右)GI公司TLK公司YP公司E类H(H)GIV公司T型NWDDME公司KI公司 85
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PTZ00466型 PTZ00466型
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肌动蛋白样蛋白;临时的


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PTZ00452型 PTZ00452型
肌动蛋白;临时的
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肌动蛋白;临时的


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ASKHA_NBD_ACTL7系统 cd10214
类肌动蛋白7(ACTL7)家族的核苷酸结合域(NBD);这个。。。
5-374 1.00至172

类肌动蛋白7(ACTL7)家族的核苷酸结合域(NBD);类ACTL7家族包括ACTL7A、ACTL7B和ACTL9(也称为ACTL7C)。在哺乳动物中,ACTL7A在多种成人组织中表达,而ACTL7B在精子细胞发育的伸长阶段在精子细胞中表达。ACTL7A在小鼠中也称为类肌动蛋白-7-α或T-actin-2,可能在顶体生物发生过程中高尔基衍生小泡的形成和融合中发挥重要作用。ACTL7B,也称为actin-like-7-beta,是男性生育所必需的精子生成的关键调节器。ACTL9是一种睾丸特异性蛋白,在前顶体小泡融合和核周膜形成中起重要作用。


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吉924183513 325迈克科尔斯k个一个P(P)帕金斯大众GGSILASL公司装货单FQQ公司M(M)W公司伊斯克安永D类E类S公司普通合伙人SIVH公司RKC公司 374
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ASKHA_NBD_actin样 cd10169型
肌动蛋白和肌动蛋白相关蛋白的核苷酸结合域(NBD);肌动蛋白是。。。
8-366 2.75e-161

肌动蛋白和肌动蛋白相关蛋白的核苷酸结合域(NBD);肌动蛋白普遍存在于真核生物中,是肌动蛋白细胞骨架的主要组成部分;单体球蛋白(G-actin)可逆聚合形成细丝(F-actin)。每个肌动蛋白原聚体结合一个ATP分子和钙或镁离子。随着ATP的水解,F-肌动蛋白丝形成。一些肌动蛋白相关蛋白(Arps)在细胞骨架功能中发挥作用,如肌动蛋白聚合(Arp2/3)和动力蛋白运动活性(Arp1)。传统肌动蛋白和特异性Arp都与染色质重塑和/或转录调节有关。肌动蛋白/ARP家族属于ASKHA(醋酸盐和糖激酶/Hsc70/actin)超家族,其所有成员共享一个共同的特征五链β片,出现在N端和C端结构域中。


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ASKHA_NBD_Arp4_ACTL6类 cd13395
肌动蛋白相关蛋白4(Arp4)样亚家族的核苷酸结合域(NBD);这个。。。
3-366 2.49e-160

肌动蛋白相关蛋白4(Arp4)样亚家族的核苷酸结合域(NBD);类Arp4亚家族包括来自真菌和植物的Arp4,也称为类肌动蛋白4。酿酒酵母Arp4与Arp8协同解聚F-actin;它与ATP结合,但与传统肌动蛋白不同,它不形成细丝。它是NuA4组蛋白乙酰转移酶复合物、染色质重塑INO80复合物和SWR1染色质重塑复合物的组成部分。拟南芥Arp4可能通过调节染色质结构参与植物器官组织、开花时间、花药发育、花衰老和育性等多种发育过程。该家族还包括酵母和植物的人类同源物,它们是肌动蛋白6A(由ACTL6A基因编码;也称为ArpNbeta、53 kDa BRG1相关因子A/BRG1关联因子53A/BAF35A和INO80复合亚基K/INO80K)和肌动蛋白6 B(由ACTL6B基因编码;也称为ArpNalpha,53 kDa BRG1相关因子B/BRG1关联因子53B/BAF35B)。ACTL6A和ACTL6B通过染色质重塑(DNA-核小体拓扑结构的改变)参与选择性基因的转录激活和抑制。它们是许多具有染色质重塑和组蛋白乙酰转移酶活性的复合物的组成部分。ACTL6A也是染色质重塑INO80复合物的假定核心成分,该复合物参与转录调节、DNA复制和可能的DNA修复。裂殖酵母肌动蛋白相关蛋白42(Arp42)也包括在这个家族中。它也是SWI/SNF和RSC复合物的组成部分。


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肌动蛋白相关蛋白[细胞骨架];


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ASKHA_NBD_Arp3-类 cd10221
肌动蛋白相关蛋白3(Arp3)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);Arp3。。。
7-370 5.13e-124条

肌动蛋白相关蛋白3(Arp3)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);Arp3,也称为肌动蛋白样蛋白3,是Arp2/3复合物的ATP结合成分,Arp2/3复合体是一种多蛋白复合物,在核增殖因子(NPF)刺激下介导肌动蛋白聚合。Arp2/3复合物由7种蛋白质(Arp2、Arp3和5种保守蛋白质ARPC1-5)组成。它通过促进肌动蛋白丝的成核,在较老的肌动蛋白纤维一侧形成70度的分支,从而生成细胞质分支丝网络。它通过与预先存在的丝状物、促核因子和肌动蛋白单体同时结合而被激活。子枝随后从母丝分离/去分枝。其Arp2和Arp3亚单位必须装载ATP才能启动分支肌动蛋白丝的组装。支管起始或脱支可能需要ATP水解。Arp2/3复合物也存在于细胞核中,在促进肌动蛋白从头聚合和RNA聚合酶II依赖性转录中发挥作用。这可能部分是通过调节核肌动蛋白聚合,就像它在细胞质中的功能一样。人类Arp3和Arp3B分别由ACTR3和ACTR3B基因编码。Arp3B也称为肌动蛋白相关蛋白Arp4。


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PTZ00280型 PTZ00280型
肌动蛋白相关蛋白3;临时的
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肌动蛋白相关蛋白3;临时的


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ASKHA_NBD_Arp6 cd10210
肌动蛋白相关蛋白6(Arp6)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);Arp6。。。
8-366 6.97e-101号

肌动蛋白相关蛋白6(Arp6)和类似蛋白的核苷酸结合结构域(NBD);Arp6,也称为肌动蛋白样蛋白6,是形成和/或维持适当核仁结构和功能所必需的,在核糖体DNA(rDNA)转录的调节中发挥双重作用。在高糖存在下,Arp6通过H2A维持活性rDNA转录。Z沉积和葡萄糖饥饿时,需要抑制rDNA转录,并且此功能可能独立于H2A。在分裂和芽殖酵母中,Z.Arp6也是端粒沉默所必需的。它是芽殖酵母和拟南芥SWR1复合物(SWR1C)和人类SWI2/SNF2相关CBP激活蛋白(SRCAP)染色质重塑复合物的组成部分,该复合物催化组蛋白H2A与H2AZ的交换。果蝇Arp6与HP1(异染色质蛋白1)在中心周围异染色素中共定位,脊椎动物Arp6也与HP1相互作用。人类Arp6由ACTR6基因编码。拟南芥促动蛋白相关蛋白6/短日早期1/FRIGIDA 3抑制剂(由ARP6/ESD1/SUF3编码)参与调节几个叶和花发育阶段。它是花期基因座C(FLC,开花的主要抑制物)和FLC样基因在茎和根尖的表达以及花抑制途径的活性所必需的。


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ASKHA_NBD_AtARP7类 cd10209
拟南芥肌动蛋白相关蛋白7的核苷酸结合域(NBD)及其类似物。。。
8-371 4.56e-90页

拟南芥肌动蛋白相关蛋白7和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);拟南芥ARP7是一种重要的核蛋白,广泛表达于所有细胞类型。它是正常胚胎发生、植物结构和花器官脱落所必需的。它可能通过染色质介导的基因调控在植物发育的各个阶段发挥作用。


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ASKHA_NBD_第5页 cd10211
肌动蛋白相关蛋白5(Arp5)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);Arp5。。。
7-367 2.48e-74页

肌动蛋白相关蛋白5(Arp5)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);Arp5,也称为肌动蛋白样蛋白5,可能是染色质重塑INO80复合体的核心成分,参与转录调控、DNA复制和DNA修复。参与DNA双链断裂修复和紫外线损伤切除修复。人类Arp5由ACTR5基因编码。拟南芥ARP5(AtARp5)是一种广泛表达的核蛋白,参与DNA修复,是所有器官多细胞发育所必需的。AtARp5可能是除INO80之外的其他染色质重塑机器的一部分。


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ASKHA_NBD_ScArp9类 cd10208
酿酒酵母肌动蛋白相关蛋白9(Arp9)的核苷酸结合域(NBD)和。。。
38至373 1.93e-58号

酿酒酵母放线相关蛋白9(Arp9)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);酿酒酵母Arp9,也称为类肌动蛋白9、染色质结构重建复合物蛋白Arp9或SWI/SNF复合物成分Arp9,是染色质结构重塑复合物(RSC)的组成部分,参与转录调控和核小体定位。它也是SWI/SNF复合物的一部分,这是一种ATP依赖的染色质重塑复合物,对许多基因的基因表达进行正调控和负调控所必需的。Arp9在RSC和SWI/SNF染色质重塑复合物中与Arp7蛋白形成稳定的异二聚体。有人建议,这种二聚体作为DNA弯曲蛋白的一个模块发挥作用,以实现正确的结构并促进络合物相互作用。裂变酵母SWI/SNF和RSC复合物不包含Arp7和Arp8,而是包含Arp9和Arp42。


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ASKHA_NBD_Arp10 cd10207
肌动蛋白相关蛋白10(Arp10)和类似蛋白的核苷酸结合结构域(NBD)。。。
9-366 4.28e-51页

肌动蛋白相关蛋白10(Arp10)和类似蛋白的核苷酸结合结构域(NBD);Arp10,也称为肌动蛋白相关蛋白11(Arp11),是动力蛋白激活物dynactin的货物结合部分的一个亚单位。它与dynactin4(p62)、-5(p25)和-6(p27)一起,形成位于Arp1尖端的异四聚体复合物。Arp1形成大小均匀的微丝,蛋白质沿着其长度和两端结合。人类Arp10由ACTR10基因编码。


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ASKHA_NBD_AtArp8类 cd13396
拟南芥肌动蛋白相关蛋白8(AtArp8)的核苷酸结合域(NBD)和。。。
89-366 第5.37页至第48页

拟南芥肌动蛋白相关蛋白8(AtArp8)和类似蛋白的核苷酸结合域(NBD);拟南芥ARP8也称为F-box蛋白ARP8,是一种定位于核仁的F-box蛋白。它在所有器官和细胞类型中普遍表达,并具有细胞周期依赖性的亚细胞分布模式:它定位于间期细胞的核仁,分散在有丝分裂细胞的细胞质中。


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250 260 270 280 290
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丁香胶 NF040575号
丁香胶;丁香凝集素是正常真核蛋白肌动蛋白的密切同源物,发现于。。。
303至374 2.59e-35

丁香胶;丁香凝集素是正常真核蛋白肌动蛋白的密切同源物,存在于植物病原体丁香假单胞菌及其相关物种中。创建这个模型的部分目的是为了澄清这个家族是真实的和独特的,而不是真核生物污染细菌基因组序列数据的产物。在这个HMM创建之初,这个家庭是没有特点的。


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ASKHA_NBD_Arp8-like类 cd10206
肌动蛋白相关蛋白8(Arp8)样亚家族的核苷酸结合域(NBD);这个。。。
48-369 1.16e-27

肌动蛋白相关蛋白8(Arp8)样亚家族的核苷酸结合结构域(NBD);类Arp8家族包括来自脊椎动物和真菌的Arp8,也称为类肌动蛋白8。人类Arp8由ACTR8基因编码,也称为INO80复合亚单位N。它在有丝分裂染色体的功能组织中起着重要作用。Arp8的基础ATP酶活性较低,不能聚合。它可能是染色质重塑INO80复合体的核心成分,参与转录调控、DNA复制,可能还参与DNA修复。这是INO80(可能还有INO80复合物)招募到DNA损伤部位所必需的。Arp8对核小体和H3-H4四聚体的偏好性强于H2A-H2B二聚体,这表明它可能在复合物中充当核小体识别模块。该亚科还包含拟南芥Arp9。


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抄送:cd10206  409LLA公司W公司KGG公司成人影片洛杉矶C类DSA(数字减影)电致发光威斯康星州TRK公司E类WQRL公司G公司VRA公司 443
ASKHA_NBD_ScArp7类 cd10212
酿酒酵母肌动蛋白相关蛋白7(Arp7)的核苷酸结合域(NBD)和。。。
8-363 1.20至19

酿酒酵母肌动蛋白相关蛋白7(Arp7)和类似蛋白的核苷酸结合结构域(NBD);酿酒酵母Arp7,也称为类肌动蛋白7,是染色质结构重塑复合体(RSC)的组成部分,参与转录调控和核小体定位。它也是SWI/SNF复合物的一部分,这是一种ATP依赖的染色质重塑复合物,对许多基因的基因表达进行正调控和负调控所必需的。Arp7在RSC和SWI/SNF染色质重塑复合物中与Arp9蛋白形成稳定的异二聚体。有人建议,这种二聚体作为DNA弯曲蛋白的一个模块发挥作用,以实现正确的结构并促进络合物相互作用。裂变酵母SWI/SNF和RSC复合物不包含Arp7和Arp8,而是包含Arp9和Arp42。


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抄送:cd10212  161GCNVT公司圆周率身份证件G公司IVVKN公司一个VV公司R(右)SKFG公司G公司-D类佛罗里达州D类FQV公司她喜欢的男人KRS系列T型DVW公司Y(Y)EAS公司T型wiqqfkstmlqvsek公司 239
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抄送:cd10212  394G公司W公司G公司ALTM公司一个N个公共安全服务GK公司W公司Y(Y)斯克预计起飞时间Y(Y)E类 419
ASKHA_NBD_MamK公司 cd24009
肌动蛋白MamK家族的核苷酸结合域(NBD);MamK,也称为。。。
15-316 5.34e-10页

肌动蛋白MamK家族的核苷酸结合域(NBD);MamK也称为磁小体细胞骨架蛋白MamK,是一种具有ATP酶活性的蛋白质,可形成动态细胞质细丝(可能具有类似paralog MamK的结构),可将磁小体组织成平行于细胞长轴的长链。MamK长丝的周转可能由MamK-like(例如MamJ和/或LimJ)促进,它提供了一个单体池。MamK在ATP或GTP存在的情况下形成扭曲的细丝。它用于闭合链中磁小体之间的间隙。与MCP10的相互作用可能通过控制鞭毛的旋转来控制对磁场的响应。MamK家族属于ASKHA(乙酸和糖激酶/Hsc70/Actin)超家族,其所有成员共享一个共同的特征五链β片,该β片出现在N端和C端结构域中。


Pssm-ID:466859[多域]Cd长度:328  比特分数:59.92  E值:5.34e-10页
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吉924183513 15G公司MCKAGFAGDDAP公司R(右)成人影片F类P(P)S公司VG公司R(右)P(P)RHQGVMVGM公司G公司q个KDSYV公司GDEA公司QSK公司R(右)GI公司T型肯塔基州P(P)E类H(H)G公司IVTNW公司尽职调查mekiwhhtfy(我的名字) 94
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抄送:cd24009  290工业工程K一个 293
 
爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • 王杰等(2023),“2023年的保守域数据库”核酸研究51(D) 公元384-388年。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”核酸研究45(D) 2003年3月。
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