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| Ebola_HIV-1-like _HR1-HR2超级家族 |
类别02885 |
七肽重复序列1—七肽重复片段2区（外结构域）是各种。。。 |
19-215 |
1.97e-54页 |
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各种内源性逆转录病毒（ERV）和感染性逆转录酶病毒（包括埃博拉病毒和人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1））跨膜亚单位的七肽重复序列1-七肽重复片段2区域（外域）；该结构域超家族跨越了各种内源性逆转录病毒（ERV）和感染性逆转录酶病毒（包括埃博拉病毒gp2、Rous肉瘤病毒gp37、人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）gp41）的糖蛋白/跨膜亚基的七肽重复序列，以及各种ERV的包膜蛋白。在埃博拉病毒和RSV的HR1-HR2区，两个重复序列之间的连接区包括CKS17样免疫抑制区和CX6C基序，后者形成亚单位内二硫键；MMTV、HIV-1、HERV-K内源性逆转录病毒及其相关序列缺乏典型的CSK17-like序列和CX6C基序。HR1-HR2区域的N末端是融合肽（FP），C末端是膜跨区（MSR）。病毒感染包括形成一个三螺旋结构（三个HR1螺旋，由三个HR2螺旋支撑，呈反平行方向）。在这种结构中，FP（插入宿主细胞膜）和MSR（插入病毒膜）非常接近。ERV可能起源于由活性逆转录病毒引起的古代细菌系感染。一些现代ERV，即那些整合到宿主基因组后物种形成中的ERV，具有当前活跃的外源性对应物，如雅格西克羊逆转录病毒（JSRV）、猫白血病病毒（FeLV）和禽白血病病毒（ALV）。一些ERV在宿主中发挥特殊作用，包括胎盘发育、保护宿主免受相关致病性和外源性逆转录病毒的感染以及基因组可塑性。属于该超家族的人类ERV（HERV）包括Syncytin-1（HERV-W_c7q21.2/ERVWE1）和Syncytin-2（HERV-FRD_6p24.1），它们在胎盘中表达，是融合性的，尽管它们具有不同的融合细胞特异性。Syncytin-2具有免疫抑制作用，但Syncytin-1没有；其免疫抑制结构域可以保护胎儿免受母亲免疫系统的影响。Syncytin-1可能参与胎盘滋养层细胞的形成；它还与癌细胞与宿主细胞之间、癌细胞之间的细胞融合以及人类破骨细胞融合有关。该超家族还包含人类HERV-R_c7q21.2（ERV-3），该病毒也在胎盘中表达，但不是融合性的，具有免疫抑制结构域，但缺乏融合肽。目前尚不清楚ERV-3是否具有关键的生物学作用。该超家族中包括来自家养绵羊的ERV，这些ERV与羊传染性肺癌病原体JSRV有关；例如，enJSRV-26保留了完整的基因组。这些内源性JSRV保护绵羊免受JSRV感染，并且是绵羊胎盘发育所必需的。
检测到与超家族成员的实际对齐pfam00517型:
Pssm-ID：413513 Cd长度：197 比特分数：177.10 E值：1.97e-54页
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姓名 |
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E值 |
| 通用条款41 |
pfam00517型 |
逆转录病毒包膜蛋白；这个家族包括来自多种。。。 |
19-215 |
1.97e-54页 |
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逆转录病毒包膜蛋白；这个家族包括来自多种逆转录病毒的包膜蛋白。它包括来自人类和猿猴免疫缺陷病毒（HIV和SIV）的包膜蛋白复合物的GP41亚单位，其在病毒进入期间介导膜融合。该家族还包括牛免疫缺陷病毒、猫免疫缺陷病毒和马传染性贫血（EIAV）。该家族还包括来自小鼠乳腺肿瘤病毒（MMTV）和人类内源性逆转录病毒（HERV）的Gp36蛋白。
Pssm ID:395415 Cd长度：197 比特分数：177.10 E值：1.97e-54页
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| HIV-1类_HR1-HR2 |
cd09909 |
人类gp41亚单位的七肽重复序列1-七肽重复片段2区域（外结构域）。。。 |
28-154 |
8.97e-44页 |
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人类免疫缺陷病毒（HIV-1）gp41亚单位的七肽重复序列1-七肽重复片段2区域（外结构域）和相关结构域；该结构域家族跨越各种内源性逆转录病毒（ERV）和感染性逆转录酶病毒（包括人、猴和猫免疫缺陷病毒（HIV、SIV和FIV）、牛免疫缺陷样病毒（BIV）、马传染性贫血病毒（EIAV）的糖蛋白（gp）/跨膜亚基的七重序列，以及雅格西克羊逆转录病毒（JSRV）、小鼠乳腺肿瘤病毒（MMTV）和各种ERV，包括绵羊enJSRV-26和人类ERV（HERV）：HERV-K_c1q23.3和HERV-K_c12q14.1。该结构域属于一个更大的超家族，包含ERV和感染性逆转录病毒（包括埃博拉病毒和Rous肉瘤病毒）的HR1-HR2结构域。该家族中的蛋白质缺乏典型的CSK17-like免疫抑制序列，以及在Ebola_RSV-like_HR1-HR2家族中HR1和HR2之间的连接区发现的亚单位内二硫键形成CX6C基序。HR1-HR2区域的N末端是融合肽（FP），C末端是膜跨区（MSR）。病毒感染包括形成一个三螺旋结构（三个HR1螺旋，由三个HR2螺旋支撑，呈反平行方向）。在这种结构中，FP（插入宿主细胞膜）和MSR（插入病毒膜）非常接近。ERV可能起源于由活性逆转录病毒引起的古代细菌系感染。一些现代ERV，即那些整合到宿主基因组物种形成后的ERV，具有当前活跃的外源对应物，如JSRV。一些ERV在宿主中发挥特殊作用，包括胎盘发育、保护宿主免受相关致病性和外源性逆转录病毒的感染以及基因组可塑性。该亚组包括与JSRV相关的家养绵羊ERV，JSRV是绵羊可传播肺癌的病原体，例如保留完整基因组的enJSRV-26。这些内源性JSRV保护绵羊免受JSRV感染，并且是绵羊胎盘发育所必需的。HERV-K_c12q14.1可能是一种完整的包膜蛋白；然而，它似乎不是融合的。
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邮编：cd09909 81QGNDN公司W公司ISL公司台湾问电子战ENK公司我DDLEEK公司我液态氮L（左）L（左）电气工程师A类QNQ（质量保证）L（左）EK公司LADG公司陆上通信线S公司劳埃德P（P） 128
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逆转录病毒包膜蛋白；这个家族包括来自多种。。。 |
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逆转录病毒包膜蛋白；这个家族包括来自多种逆转录病毒的包膜蛋白。它包括来自人类和猿猴免疫缺陷病毒（HIV和SIV）的包膜蛋白复合物的GP41亚单位，其在病毒进入期间介导膜融合。该家族还包括牛免疫缺陷病毒、猫免疫缺陷病毒和马传染性贫血（EIAV）。该家族还包括来自小鼠乳腺肿瘤病毒（MMTV）和人类内源性逆转录病毒（HERV）的Gp36蛋白。
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| 爆破搜索参数 |
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数据来源：
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预计算数据，版本=cdd.v.3.21 |
| 预设选项： | 数据库：CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器：没有基于成分的调整：是的E值阈值： 0.01 |
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