1B8季度,1QAU(质量保证单位)


保守蛋白结构域家族
PDZ_nNOS类

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cd06708:PDZ_nNOS类
神经元型一氧化氮合酶(nNOS)的PDZ结构域及相关结构域
nNOS的PDZ(PSD-95(突触后密度蛋白95)、Dlg(椎间盘大蛋白)和ZO-1(闭塞带蛋白-1))结构域1以及相关结构域。nNOS产生一种关键的信号分子一氧化氮(NO),它在全身具有多种功能,在中枢和外周神经系统中充当神经递质和细胞内信号分子。nNOS集中在大脑的突触连接处和骨骼肌的运动终板。神经元型一氧化氮合酶(nNOS)的PDZ结构域与(肌肉细胞中的)α1-合成营养素的PDZ区域、Disks大同源物4(Dlg4,也称为PSD-95)的第二个PDZ结构区以及神经元中的一氧化氮合酶1适配器蛋白NOS1AP相互作用。Dlg4结合NMDA受体和nNOS,在神经元中形成复合物。NOS1AP与Dgl4竞争nNOS PDZ结构域,并阻止nNOS活化与NMDA受体介导的钙内流耦合。PDZ结构域通常以序列特异的方式与位于其伴侣蛋白C末端的短肽序列(称为PDZ结合基序)结合。PDZ超家族包括经典的PDZ结构域以及那些具有圆形排列和由β链介导的结构域交换的结构域。这种类nNOS家族结构域是一个典型的PDZ结构域,包含六条β链a-F和两条α链(α-螺旋1和2),其排列顺序为:β链a、B、C、α-螺旋l、β链D、E、α-链2和β-链F。
链接
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资料来源: cd00136号
分类: Bilateria公司
公共医学: 18个链接
蛋白质: 代表
特异性蛋白质
相关蛋白质
相关结构
体系结构
超级家族: 氯49608
统计
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PSSM-Id: 467192
对齐的: 12排
阈值位分数: 198.756
创建: 2007年6月27日
更新时间: 2023年4月27日
结构
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程序:
图纸:
对齐行:
 
肽结合
保存的站点包含13个残留物-单击图像可使用Cn3D进行交互式查看
特征1:肽结合位点
证据:
  • 备注:基于具有结构的规范PDZ域
  • 备注:PDZ结构域特异性识别并结合短C末端肽基序,但也可以识别内部肽基序和某些脂质
  • 结构:1B8Q:褐家鼠nNOS的PDZ结构域结合MelR肽(VVKVDSV,一种合成肽,对应于褪黑素受体C末端结构域中的相同序列);4A触点
  • 引用:PMID 12493751
  • 引用:PMID 30006415

序列对齐
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格式: 行显示: 颜色位: 类型选择:
功能1#####1#######&####
1B8Q_A型       8N个V(V)S公司V(V)R(右)L(左)F类K(K)R(右)K(K)v(v)G公司G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)K(K)E类R(右)v(v)K(K)P(P)P(P)V(V)S公司D类L(左)R(右)G公司G公司A类A类E类S公司G公司L(左)A类G公司D类L(左)A类V(V)N个D类R(右)P(P)L(左)V(V)D类S公司Y(Y)D类S公司A类L(左)E类V(V)L(左)R(右)G公司A类E类T型H(H)V(V) 87 挪威鼠
1QAU_A(质量保证单位_A)       1N个V(V)S公司V(V)R(右)L(左)F类K(K)R(右)K(K)v(v)G公司G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)K(K)E类R(右)v(v)K(K)P(P)P(P)V(V)S公司D类L(左)R(右)G公司G公司A类A类E类S公司G公司L(左)A类G公司D类L(左)A类V(V)N个D类R(右)P(P)L(左)V(V)D类S公司Y(Y)D类S公司A类L(左)E类V(V)L(左)R(右)G公司A类E类T型H(H)V(V) 80 挪威鼠
XP_035691848号 6N个V(V)A类V(V)K(K)L(左)M(M)K(K)R(右)E类D类G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)K(K)R(右)c(c)N个P(P)P(P)V(V)V(V)S公司D类V(V)V(V)R(右)G公司G公司A类A类D类S公司G公司L(左)V(V)G公司D类L(左)L(左)S公司V(V)N个G公司T型S公司L(左)E类T型v(v)S公司Y(Y)S公司D类A类L(左)V(V)L(左)R(右)S公司V(V)E类v(v)G公司K(K)P(P)T型 85
NP_001079155号 14N个V(V)S公司V(V)R(右)L(左)F类K(K)R(右)K(K)v(v)G公司G公司L(左)G公司F类L(左)A类K(K)R(右)第页n个K(K)P(P)P(P)V(V)S公司D类L(左)R(右)G公司G公司A类A类E类S公司G公司L(左)V(V)V(V)G公司D类L(左)A类V(V)N个D类R(右)P(P)L(左)V(V)D类S公司Y(Y)E类S公司A类L(左)E类L(左)R(右)S公司S公司E类T型F类V(V) 93 非洲爪。。。
AAZ76558型     14N个V(V)S公司V(V)K(K)L(左)F类K(K)R(右)K(K)v(v)G公司G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)K(K)E类R(右)K(K)P(P)P(P)V(V)S公司D类L(左)R(右)G公司G公司A类A类E类S公司G公司L(左)T型G公司D类L(左)A类V(V)N个G公司R(右)P(P)L(左)V(V)D类N个Y(Y)D类T型A类L(左)V(V)L(左)R(右)S公司A类E类T型Y(Y)V(V) 93 天门冬氨酸。。。
XP_006008471号 14N个S公司V(V)R(右)L(左)F类K(K)R(右)K(K)G公司G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)K(K)R(右)c(c)K(K)P(P)P(P)V(V)S公司D类L(左)R(右)G公司G公司A类A类E类E类S公司G公司L(左)V(V)V(V)G公司D类L(左)A类V(V)N个N个K(K)P(P)L(左)V(V)D类v(v)S公司Y(Y)E类N个A类L(左)E类L(左)K(K)N个A类D类T型Y(Y)V(V) 93 腔棘鱼
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AAO53340型     14N个S公司V(V)R(右)L(左)F类K(K)R(右)K(K)G公司G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)K(K)R(右)v(v)c(c)K(K)P(P)P(P)V(V)V(V)S公司D类L(左)R(右)G公司G公司A类A类E类E类C类G公司L(左)V(V)V(V)G公司D类V(V)L(左)A类V(V)N个N个K(K)P(P)L(左)V(V)D类S公司Y(Y)E类R(右)A类L(左)E类T型L(左)K(K)N个V(V)S公司第页E类S公司H(H)A类 93 斑马鱼
BAF73722号     10N个T型R(右)V(V)K(K)L(左)V(V)K(K)K(K)小时G公司G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)K(K)R(右)t吨K(K)P(P)F类V(V)L(左)V(V)A类S公司V(V)K(K)G公司G公司V(V)A类E类E类S公司G公司L(左)V(V)G公司D类L(左)R(右)N个D类D类L(左)T型D类S公司Y(Y)P(P)S公司A类E类V(V)L(左)K(K)A类V(V)P(P)D类T型P(P)V(V) 89 莱曼价值。。。
XP_030847313型 6N个T型F类S公司R(右)L(左)V(V)K(K)R(右)P(P)第页H(H)G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)R(右)K(K)R(右)k个c(c)N个P(P)P(P)V(V)L(左)S公司D类L(左)S公司G公司G公司V(V)A类E类N个S公司G公司L(左)V(V)R(右)G公司D类L(左)L(左)A类V(V)N个G公司V(V)L(左)T型D类v(v)P(P)Y(Y)N个T型A类L(左)E类V(V)L(左)R(右)S公司V(V)P(P)D类T型P(P)C类 85 坚强。。。
XP_009861972年 11N个A类S公司V(V)V(V)L(左)T型K(K)R(右)H(H)k个T型G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)R(右)E类R(右)q个K(K)P(P)K(K)V(V)E类V(V)M(M)E类L(左)V(V)E类D类G公司S公司A类F类H(H)S公司C类L(左)A类G公司D类V(V)L(左)A类V(V)N个G公司V(V)D类L(左)T型T型t吨S公司Y(Y)R(右)E类S公司L(左)K(K)T型L(左)R(右)A类P(P)v(v)G公司G公司K(K)A类 90 花瓶被膜
第29475页       14N个V(V)S公司V(V)R(右)L(左)F类K(K)R(右)K(K)v(v)G公司G公司L(左)G公司F类L(左)V(V)K(K)E类R(右)v(v)K(K)P(P)P(P)V(V)S公司D类L(左)R(右)G公司G公司A类A类E类S公司G公司L(左)A类G公司D类L(左)A类V(V)N个G公司R(右)P(P)L(左)V(V)D类S公司Y(Y)D类S公司A类L(左)E类V(V)L(左)R(右)G公司A类E类T型H(H)V(V) 93 人类
特征1
1B8Q_A型       88V(V)L(左)L(左)R(右)G公司P(P)E类G公司F类T型T型H(H)L(左)E类T型T型F类T型G公司D类G公司T型P(P)K(K)T型R(右)V(V)T型 117 挪威鼠
1QAU_A(质量保证单位_A)       81V(V)L(左)L(左)R(右)G公司P(P)E类G公司F类T型T型H(H)L(左)E类T型T型F类T型G公司D类G公司T型P(P)K(K)T型R(右)V(V)T型 110 挪威鼠
XP_035691848号 86E类L(左)R(右)G公司P(P)E类G公司F类A类T型K(K)L(左)E类T型T型F类T型G公司T型G公司P(P)K(K)T型V(V)R(右)T型 115
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AAZ76558型     94V(V)L(左)L(左)R(右)G公司P(P)E类G公司F类T型T型H(H)L(左)E类T型T型F类T型G公司D类G公司T型P(P)K(K)T型V(V)R(右)V(V)T型 123 无节门冬孢子虫
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XP_007900533号 94V(V)L(左)L(左)R(右)G公司P(P)E类G公司F类T型T型H(H)L(左)E类T型T型F类A类S公司D类G公司T型P(P)R(右)T型R(右)V(V)T型 123 象鲨
AAO53340型     94V(V)L(左)L(左)R(右)G公司P(P)E类G公司F类T型T型H(H)L(左)E类T型T型L(左)S公司S公司D类G公司K(K)T型K(K)T型R(右)V(V)T型 123 斑马鱼
BAF73722号     90V(V)L(左)L(左)L(左)R(右)G公司P(P)E类G公司Y(Y)T型T型Y(Y)L(左)T型S公司F类L(左)E类N个G公司M(M)P(P)R(右)T型V(V)R(右)V(V)T型 119 瓦伦蒂亚纳莱曼尼亚
XP_030847313型 86V(V)V(V)L(左)K(K)G公司P(P)E类G公司Y(Y)R(右)T型R(右)L(左)E类T型V(V)M(M)S公司P(P)D类G公司A类V(V)N个V(V)R(右)T型 115 紫斑圆线虫
XP_009861972年 91V(V)L(左)K(K)G公司P(P)E类G公司T型H(H)L(左)T型T型F类T型R(右)E类G公司P(P)R(右)T型V(V)R(右)S公司 120 花瓶被膜
第29475页       94V(V)L(左)L(左)R(右)G公司P(P)E类G公司F类T型T型H(H)L(左)E类T型T型F类T型G公司D类G公司T型P(P)K(K)T型R(右)V(V)T型 123 人类

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