2KRC公司


保守蛋白结构域家族
线束-HTH

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pfam05066:线束-HTH(此型号PSSM-Id:368272已过时,已被替换为461541)
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HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域
植物HB1、脊椎动物ASXL、幽门螺杆菌限制性内切酶HpyAIII(HgrA)、革兰氏阳性细菌的RNA聚合酶δ亚基(RpoE)和几种限制性内切酶中存在一个有翼的螺旋-转螺旋结构域。该结构域的区别在于在螺旋-3和之前的保守螺旋之间存在一个保守的单圈螺旋。它在具有广泛基因体甲基化的真核生物物种中的多样结构暗示着染色质功能。含有HARE-HTH的ASXL与甲基胞嘧啶羟基化Tet2蛋白的遗传相互作用表明该结构域在区分DNA修饰序列(如hmC)中起作用。细菌版本包括与多种限制性内切酶的融合,以及在检测修饰DNA时可能发挥类似作用的DNA糖基化酶。HARE-HTH结构域的某些细菌版本显示与RNA聚合酶α亚单位的螺旋-发夹-螺旋结构域以及西格玛因子区域3和4中发现的HTH结构域融合。这些版本被预测为RNA聚合酶与转录起始位点结合的新抑制剂,类似于芽孢杆菌δ蛋白。
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PSSM-Id: 368272
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创建: 2019年5月5日
更新时间: 2019年7月18日
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