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CCDS数据库将于2024年6月4日星期二(美国东部夏令时上午8:00开始)不可用,最长可达60分钟。
  

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CCDS4590.1报告(当前版本)

CCDS公司 状态 物种 铬。 基因 CCDS发布 NCBI注释发布 信号群注释发布 链接
4590.1 公共 智人 6 H3C4型 24 110 108 CCDS历史NCBI基因:8351通过CCDS ID:4590.1重新查询CCDS数据库参见序列查看器中6号染色体上的组合注释

公开日期:CCDS版本1、NCBI注释版本35.1、集成注释版本23

审查状态:审查(RefSeq和哈瓦那)

CCDS 4590.1中包含的序列ID

原件 当前 来源 核苷酸ID 蛋白质ID 鬃毛 CCDS中的状态 序号。状态 链接
原始成员 当前成员 EBI公司 ENST00000356476.3标准 ENSP00000366999.2 MANE选择 认可的 活着的 集成成绩单查看器链接:ENST00000356476.3集成蛋白质查看器链接:ENSP00000366999.2按核苷酸ID重新查询CCDS数据库:ENST00000356476通过蛋白质ID重新查询CCDS数据库:ENSP00000366999
原始成员 当前成员 美国国立生物技术信息中心 NM_001376937.1号 NP_001363866.1号 MANE选择 认可的 活着的 核苷酸序列链接:NM_001376937.1蛋白质序列链接:NP_001363866.1通过核苷酸ID重新查询CCDS数据库:NM_001376937通过蛋白质ID重新查询CCDS数据库:NP_001363866BLAST链接:NP_001363866.1
原始成员 当前成员 美国国立生物技术信息中心 NM_003530.4号 NP_003521.2号 认可的 活着的 核苷酸序列链接:NM_003530.4蛋白质序列链接:NP_003521.2通过核苷酸ID重新查询CCDS数据库:NM_003530通过蛋白质ID:NP_003521重新查询CCDS数据库BLAST:NP_003521.2链接

参考序列 长度 相关UniProtKB/SwissProt 长度 身份 差距 不匹配项
NP_001363866.1型 136 第68431页 136 100% 0 0
NP_003521.2号 136 第68431页 136 100% 0 0

CCDS 4590.1的染色体定位

装配GRCh38.p14(GCF_000001405.40)

6号染色体“-”链(NC_ 000006.12)
基因组浏览器链接:链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器参见序列查看器中6号染色体上的组合注释

染色体 启动 停止 链接
6 26196840 26197250 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器

CCDS序列数据
蓝色突出显示表示交替的外显子。
红色突出显示表示在剪接连接处编码的氨基酸。
 
将鼠标悬停在下面的核苷酸或蛋白质序列上,单击突出显示的密码子或残基以选择该对。

核苷酸序列(411nt):
自动液位计GCT公司CGT公司行政协调会AAG公司CAG公司ACT公司GCT公司CGC公司AAG公司TCC(变矩器离合器)ACG公司GGT公司GGG公司美国汽车协会GCG公司计算机辅助控制CGC公司AAG公司CAG公司CTG公司通用条款行政协调会A类
AG公司
GCT公司GCT公司CGA公司AAG公司自动增益控制GCT公司计算机辅助控制通用条款行政协调会GGC公司GGC公司GTG公司AAG公司AAG公司CCC公司CAC公司CGT公司节气门执行器控制CGG公司CCC公司GGC公司ACG公司燃气轮机
G公司
GCT公司CTG公司CGC公司GAG公司空中交通管制CGC公司CGC公司节气门执行器控制CAG公司AAG公司TCG公司行政协调会GAG公司CTG公司CTG公司ATT公司CGC公司美国汽车协会CTG公司计算机辅助控制TTC公司CAG公司CGT公司
CTA公司
GTC公司CGT公司GAG公司空中交通管制GCG公司CAG公司通用汽车公司TTC公司AAG公司ACT公司关贸总协定CTG公司CGT公司TTT公司CAG公司自动增益控制TCG公司GCG公司GTG公司自动液位计GCG公司CTG公司C类
AG公司
GAG公司通用条款TGC公司GAG公司通用条款节气门执行器控制CTG公司GTG公司GGG公司CTG公司TTT公司GAG公司通用汽车公司行政协调会AAC公司CTA公司TGC公司通用条款ATT公司CAC公司通用条款AAG公司CG公司
A类
GTG公司ACT公司空中交通管制自动液位计CCC公司AAG公司通用汽车公司空中交通管制CAG公司CTT公司GCT公司CGC公司CGC公司ATT公司CGT公司GGG公司GAG公司AGG公司GCG公司TAA公司


翻译(136 aa):
M(M)A类R(右)K(K)A类R(右)K(K)S公司G公司G公司K(K)A类P(P)R(右)K(K)L(左)A类K(K)A类A类R(右)K(K)S公司A类P(P)A类G公司G公司V(V)K(K)K(K)P(P)H(H)R(右)Y(Y)R(右)P(P)G公司V(V)A类L(左)R(右)E类R(右)R(右)Y(Y)K(K)S公司E类L(左)L(左)R(右)K(K)L(左)P(P)F类R(右)
L(左)
V(V)R(右)E类A类D类F类K(K)D类L(左)R(右)F类S公司S公司A类V(V)M(M)A类L(左)E类A类C类E类A类Y(Y)L(左)V(V)G公司L(左)F类E类D类N个L(左)C类A类H(H)A类K(K)R(右)V(V)M(M)P(P)K(K)D类L(左)A类R(右)R(右)R(右)G公司E类R(右)A类




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核苷酸报告
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通过以下方式重新查询CCDS数据库: CCDS标识
 基因ID
核苷酸ID
蛋白质ID
基因组浏览器链接: 集成基因组浏览器
NCBI序列查看器
UCSC基因组浏览器
VEGA基因组浏览器