美国国立生物技术信息中心 CCDS横幅
公共医学 Entrez公司 基因 爆炸 OMIM公司
  

CCDS公司
主页
文件传输协议
过程
发布和统计

合作者
EBI公司
HGNC公司
管理信息
美国国立生物技术信息中心

联系我们
电子邮件CCDS

基因组显示
合奏
美国国立生物技术信息中心
UCSC公司
VEGA公司

相关资源
基因
同源基因
鬃毛
参考序列


CCDS5501.1报告(当前版本)

CCDS公司 状态 物种 铬。 基因 CCDS发布 NCBI注释发布 信号群注释发布 链接
55011.1 公共 智人 6 VEGFA(血管内皮生长因子) 24 110 108 CCDS历史NCBI基因:7422通过CCDS ID:5501.1重新查询CCDS数据库通过GeneID:7422重新查询CCDS数据库参见序列查看器中6号染色体上的组合注释

CCDS 5501.1公共注释
该CCDS由mRNA AF091352.1支持,代表一种源自AUG起始密码子的VEGFA亚型。该基因也可能从多个上游非AUG(CUG)密码子进行选择性翻译起始,如PMIDs所示:11352659,1156398611731620该变异体编码的最长亚型由CCDS 47435.1表示,该亚型源自5’-最多CUG起始密码子。

公开日期:CCDS版本8、NCBI注释版本37.2、集成注释版本62

审查状态:审查(由RefSeq、哈瓦那和CCDS合作)

CCDS 5501.1中包含的序列ID

原件 当前 来源 核苷酸ID 蛋白质ID 鬃毛 CCDS中的状态 序号。状态 链接
原始成员 当前成员 EBI公司 ENST00000523125.5标准 ENSP00000429008.1标准 认可的 活着的 集成成绩单查看器链接:ENST00000523125.5集成蛋白质查看器链接:ENSP00000429008.1通过核苷酸ID重新查询CCDS数据库:ENST00000523125按蛋白质ID:ENSP00000429008重新查询CCDS数据库
原成员 当前成员 美国国立生物技术信息中心 NM_001171627.2号 NP_001165098.1 认可的 活着的 核苷酸序列链接:NM_001171627.2蛋白质序列链接:NP_001165098.1通过核苷酸ID重新查询CCDS数据库:NM_001171627通过蛋白质ID重新查询CCDS数据库:NP_001165098BLAST链接:NP_001165098.1

参考序列 长度 相关UniProtKB/SwissProt 长度 身份 差距 不匹配项
NP_001165098.1 174 第15692-5页 174 100% 0 0

CCDS 5501.1的染色体位置

装配GRCh38.p14(GCF_000001405.40)

6号染色体上的“+”链(NC_ 000006.12)
基因组浏览器链接:链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器参见序列查看器中6号染色体上的组合注释

染色体 起点 停止 链接
6 43771247 43771312 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43774341 43774392 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器6号染色体上的Ensembl基因组浏览器链接
6 43777469 43777665 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43778460 43778536 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43778889 43778918 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43781956 43782052 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43784541 43784546 链接到NCBI核苷酸6号染色体上的UCSC基因组浏览器链接连接到6号染色体上的集成基因组浏览器

CCDS序列数据
蓝色突出显示表示交替的外显子。
红色突出显示表示在剪接连接处编码的氨基酸。
 
将鼠标悬停在下面的核苷酸或蛋白质序列上,单击突出显示的密码子或残基以选择该对。

核苷酸序列(525 nt):
自动液位计AAC公司TTT公司CTG公司CTG公司TCT公司TGG公司全球技术集团CAT公司TGG公司自动增益控制连续油管通用控制中心TTG公司CTG公司反恐委员会节气门执行器控制反恐委员会CAC公司CAT公司通用控制中心AAG公司TGG公司T型
科科斯群岛
CAG公司GCT公司全球合作协议CCC公司自动液位计全球合作协议公认会计准则GGA公司GGA公司GGG公司CAG公司AAT公司CAT公司CAC公司公认会计准则G公司TG公司全球技术集团AAG公司TTC公司自动液位计关贸总协定GTC公司助教
T型
CAG公司CGC公司自动增益控制节气门执行器控制TGC公司CAT公司CCA公司空中交通管制GAG公司行政协调会CTG公司全球技术集团通用汽车公司空中交通管制TTC公司CAG公司GAG公司节气门执行器控制CCT公司关贸总协定GAG公司空中交通管制GAG公司
节气门执行器控制
空中交通管制TTC公司AAG公司CCA公司TCC公司TGT公司全球技术集团CCC公司CTG公司自动液位计CGA公司TGC公司GGG公司GGC公司TGC公司TGC公司AAT公司通用汽车公司GAG公司GGC公司CTG公司GAG公司T型
燃气轮机
全球技术集团CCC公司ACT公司GAG公司GAG公司TCC公司AAC公司空中交通管制行政协调会自动液位计CAG公司ATT公司自动液位计CGG公司空中交通管制美国汽车协会CCT公司CAC公司加拿大民航局GGC公司CAG公司CAC公司自动变速箱
A类
GGA公司GAG公司自动液位计自动增益控制TTC公司CTA公司CAG公司CAC公司AAC公司美国汽车协会TGT公司公认会计准则TGC公司AG公司A类CCA公司AAG公司美国汽车协会关贸总协定AGA公司全球合作协议AGA公司加拿大民航局公认会计准则
AA公司
T型
CCC公司TGT公司GGG公司CCT公司TGC公司TCA公司GAG公司CGG公司AGA公司AAG公司CAT公司TTG公司TTT公司通用技术协议加拿大民航局关贸总协定立方厘米CAG公司ACG公司TGT公司美国汽车协会TGT公司T型
科科斯群岛
TGC公司美国汽车协会AAC公司ACA公司通用汽车公司TCG公司CGT公司TGC公司AAG公司自动液位计TGA公司


翻译(174 aa):
M(M)N个F类L(左)L(左)S公司W公司V(V)H(H)W公司S公司L(左)A类L(左)L(左)L(左)L(左)H(H)H(H)A类K(K)W公司S公司A类A类P(P)M(M)A类E类G公司G公司G公司N个H(H)H(H)E类V(V)V(V)K(K)F类M(M)D类V(V)R(右)S公司C类H(H)P(P)E类T型L(左)V(V)D类F类E类P(P)D类E类E类
F类K(K)P(P)S公司C类V(V)P(P)L(左)M(M)R(右)C类G公司G公司C类C类N个D类E类G公司L(左)E类C类V(V)P(P)T型E类E类S公司N个T型M(M)
M(M)R(右)K(K)P(P)H(H)G公司H(H)G公司E类M(M)S公司F类L(左)H(H)N个K(K)C类E类C类R(右)P(P)K(K)K(K)D类R(右)A类R(右)E类
N个
P(P)C类G公司P(P)C类S公司E类R(右)R(右)K(K)H(H)L(左)F类V(V)D类P(P)T型C类K(K)C类S公司C类K(K)N个T型D类S公司R(右)C类K(K)M(M)



链接键
链接到: 历史记录报告
BLAST报告
Entrez基因
核苷酸报告
蛋白质报告
通过以下方式重新查询CCDS数据库: CCDS标识
 基因ID
核苷酸ID
蛋白质ID
基因组浏览器链接: 集成基因组浏览器
NCBI序列查看器
UCSC基因组浏览器
VEGA基因组浏览器