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CCDS55007.1报告(当前版本)

CCDS公司 状态 物种 铬。 基因 CCDS发布 NCBI注释发布 信号群注释发布 链接
55007.1 公共 智人 6 VEGFA(血管内皮生长因子) 24 110 108 CCDS历史NCBI基因:7422通过CCDS ID:55007.1重新查询CCDS数据库通过GeneID:7422重新查询CCDS数据库参见序列查看器中6号染色体上的组合注释

CCDS 55007.1公告
该CCDS表示始于上游非AUG(CUG)翻译起始密码子,该密码子得到了保护数据和实验证据的支持,包括PMID中的证据:11352659,1156398611731620。该位点上大多数公开可用的长mRNAs的延伸长度不足以包含CUG起始密码子,包括支持该变体的DQ22900.1。然而,BC058855.1、一些未拼接的部分转录本和上述出版物都支持转录起始进一步上游。因此,该CCDS表示包括扩展的5'CDS。该基因还显示了从下游AUG密码子(Met-181)开始的替代翻译,这导致具有预测信号肽的较短亚型。由该变体编码的较短的同种型由CCDS 55015.1表示。

公开日期:CCDS版本8、NCBI注释版本37.2、集成注释版本62

审查状态:审查(由RefSeq、哈瓦那和CCDS合作)


属性
非AUG起始密码子

CCDS 55007.1中包含的序列ID

原件 当前 来源 核苷酸ID 蛋白质ID 鬃毛 CCDS中的状态 序号。状态 链接
原成员 当前成员 EBI公司 ENST00000324450.11标准 ENSP0000317598.7号 认可的 活着的 集成成绩单查看器链接:ENST00000324450.11集成蛋白质查看器链接:ENSP0000317598.7通过核苷酸ID重新查询CCDS数据库:ENST00000324450通过蛋白质ID重新查询CCDS数据库:ENSP00000317598
原成员 当前成员 美国国立生物技术信息中心 NM_001171622.2号 核电站_001165093.1 认可的 活着的 核苷酸序列链接:NM_001171622.2蛋白质序列链接:NP_001165093.1通过核苷酸ID重新查询CCDS数据库:NM_001171622通过蛋白质ID重新查询CCDS数据库:NP_001165093BLAST链接:NP_001165093.1

参考序列 长度 相关UniProtKB/SwissProt 长度 身份 差距 不匹配项
NP_001165093.1号 317 第15692-18页 317 100% 0 0

CCDS 55007.1的染色体位置

装配GRCh38.p14(GCF_000001405.40)

6号染色体上的“+”链(NC_ 000006.12)
基因组浏览器链接:链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器参见序列查看器中6号染色体上的组合注释

染色体 起点 停止 链接
6 43770707 43771312 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43774341 43774392 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43777469 43777665 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43778460 43778536 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43784541 43784562 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器

CCDS序列数据
蓝色突出显示表示交替的外显子。
红色突出显示表示在剪接连接处编码的氨基酸。
 
将鼠标悬停在下面的核苷酸或蛋白质序列上,单击突出显示的密码子或残基以选择该对。这也适用于“翻译例外”部分中的替换符号。

翻译例外:
替换符号L(左)(密码子CTG)与M(M)在氨基酸位置1

核苷酸序列(954 nt):
CTG公司ACG公司通用汽车公司AGA公司CAG公司ACA公司通用汽车公司行政协调会通用控制中心CCC公司自动增益控制CCC公司自动增益控制节气门执行器控制CAC公司反恐委员会反恐委员会CCC公司GGC公司CGG公司CGG公司CGG公司ACA公司G公司
TG公司
通用汽车公司GCG公司GCG公司GCG公司自动增益控制CGC公司GGG公司CAG公司GGG公司立方厘米GAG公司CCC公司GCG公司CCC公司GGA公司GGC公司GGG公司全球技术集团GAG公司GGG公司GTC公司GGG公司GC公司
T型
CGC公司GGC公司GTC公司全球合作协议CTG公司美国汽车协会连续油管TTC公司GTC公司加拿大民航局连续油管CTG公司GGC公司TGT公司TCT公司CGC公司TTC公司GGA公司GGA公司通用控制中心全球技术集团GTC公司CGC公司
GCG公司
GGG公司公认会计准则通用控制中心阻塞立方厘米自动增益控制GGA公司通用控制中心GCG公司AGA公司AGT公司GCT公司自动增益控制TCG公司GGC公司CGG公司GAG公司GAG公司立方厘米CAG公司立方厘米GAG公司G公司
AG公司
GGG公司GAG公司GAG公司公认会计准则公认会计准则GAG公司AAG公司公认会计准则GAG公司GAG公司AGG公司GGG公司立方厘米CAG公司TGG公司CGA公司反恐委员会GGC公司GCT公司CGG公司AAG公司立方厘米
C类
TCA公司TGG公司ACG公司GGT公司GAG公司GCG公司GCG公司全球技术集团TGC公司全球合作协议通用汽车公司AGT公司GCT公司CCA公司通用控制中心GCG公司CGC公司GCT公司CCC公司CAG公司通用控制中心CTG公司通用控制中心
CGG公司
通用控制中心TCG公司GGC公司CGG公司GGA公司GGA公司AGA公司通用技术协议GCT公司CGC公司CGA公司GGC公司通用控制中心GAG公司GAG公司自动增益控制GGG公司立方厘米CCC公司CAC公司自动增益控制立方厘米A类
气相色谱
CGG公司AGA公司GGG公司自动增益控制GCG公司自动增益控制CGC公司通用控制中心GGC公司CCC公司GGT公司CGG公司通用控制中心TCC(变矩器离合器)公认会计准则行政协调会自动液位计AAC公司TTT公司CTG公司CTG公司TCT公司TG公司
G公司
全球技术集团CAT公司TGG公司自动增益控制连续油管通用控制中心TTG公司CTG公司反恐委员会节气门执行器控制反恐委员会CAC公司CAT公司通用控制中心AAG公司TGG公司TCC(变矩器离合器)CAG公司GCT公司全球合作协议CCC公司自动液位计全球合作协议
公认会计准则
GGA公司GGA公司GGG公司CAG公司AAT公司CAT公司CAC公司公认会计准则G公司TG公司全球技术集团AAG公司TTC公司自动液位计关贸总协定GTC公司周转时间CAG公司CGC公司自动增益控制节气门执行器控制TGC公司CAT公司C类
加利福尼亚州
空中交通管制GAG公司行政协调会CTG公司全球技术集团通用汽车公司空中交通管制TTC公司CAG公司GAG公司节气门执行器控制CCT公司关贸总协定GAG公司空中交通管制GAG公司节气门执行器控制空中交通管制TTC公司AAG公司CCA公司TCC(变矩器离合器)TG公司
T型
全球技术集团CCC公司CTG公司自动液位计CGA公司TGC公司GGG公司GGC公司TGC公司TGC公司AAT公司通用汽车公司GAG公司GGC公司CTG公司GAG公司TGT公司全球技术集团CCC公司ACT公司GAG公司GAG公司TCC(变矩器离合器)
AAC公司
空中交通管制行政协调会自动液位计CAG公司ATT公司自动液位计CGG公司空中交通管制美国汽车协会CCT公司CAC公司加拿大民航局GGC公司CAG公司可可ATA公司GGA公司GAG公司自动液位计自动增益控制TTC公司CTA公司C类
AG公司
CAC公司AAC公司美国汽车协会TGT公司公认会计准则TGC公司AG公司A类TGT公司通用汽车公司AAG公司立方厘米AGG公司CGG公司TGA公司


翻译(317 aa):
M(M)T型D类R(右)T型D类T型A类S公司S公司Y(Y)H(H)L(左)L(左)G公司R(右)R(右)R(右)T型V(V)D类A类A类A类S公司R(右)G公司G公司E类A类G公司G公司G公司V(V)E类G公司V(V)G公司A类R(右)G公司V(V)A类L(左)K(K)L(左)如果V(V)L(左)L(左)G公司C类S公司R(右)如果G公司G公司A类V(V)V(V)R(右)
A类
G公司E类A类E类S公司G公司A类A类R(右)S公司A类S公司S公司G公司R(右)E类E类E类E类G公司E类E类E类E类E类K(K)E类E类E类R(右)G公司W公司R(右)L(左)G公司A类R(右)K(K)G公司S公司W公司T型G公司E类A类A类V(V)C类A类D类S公司A类A类A类R(右)A类A类L(左)A类
R(右)
A类S公司G公司R(右)G公司G公司R(右)V(V)A类R(右)R(右)G公司A类E类E类S公司G公司H(H)S公司S公司R(右)R(右)G公司S公司A类S公司R(右)A类G公司G公司R(右)A类S公司E类T型M(M)N个如果L(左)L(左)S公司W公司V(V)H(H)W公司S公司L(左)A类L(左)L(左)L(左)Y(Y)L(左)H(H)H(H)A类K(K)
W公司S公司A类A类M(M)A类
E类
G公司G公司G公司N个H(H)H(H)E类
V(V)V(V)K(K)如果M(M)D类V(V)Y(Y)R(右)S公司Y(Y)C类H(H)E类T型L(左)V(V)D类如果E类Y(Y)D类E类E类Y(Y)如果K(K)S公司C类V(V)L(左)M(M)R(右)C类G公司G公司C类C类N个D类E类G公司L(左)E类C类V(V)T型E类E类S公司
N个
T型M(M)
M(M)R(右)K(K)H(H)G公司H(H)G公司E类M(M)S公司如果L(左)H(H)N个K(K)C类E类C类R(右)C类D类K(K)R(右)R(右)



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